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User talk:靖天子/存檔9

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Merry Christmas!!!

冠状病毒模板与RaTG13

I have just finished translating template {{Coronavirus}} from Chinese to English.

I like this template, compared with "Human coronaviruses", which I just REDIRECT to "Coronaviridae", Its a DeAnthropocentrism template.--Htmlzycq（留言） 2020年12月24日 (四) 16:28 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：感謝閣下翻譯這個模板，當初創建這個模板正是感到人們對感染人類以外動物的冠狀病毒（或者更廣泛來說，流行病學、疫情以外關於冠狀病毒的病毒學知識）關注太少了。剛剛無意間發現英文版也有人寫了RaTG13，便詳細擴充了RaTG13病毒。英文版竟連冠狀病毒的5' UTR、3' UTR、甚至3'UTR上的一個結構都自成一條目，真是絕了，希望今年有空時能在中文版將這些條目全部寫完，並重寫母條目冠狀病毒，不過與Covid-19直接相關的條目因為容易被政治污染，我就不碰了。--Wikimycota~🍄 2021年1月4日 (一) 09:29 (UTC)[回复]

是在下先把阁下的中文版RaTG13翻译为英文的，后来他们几乎重写了条目，毕竟英语不是母语，有很多语法问题 囧rz……--Htmlzycq（留言） 2021年1月4日 (一) 09:33 (UTC)[回复]


I have created template {{Coronavirus genomes}} in enwiki. Do you have any suggestions for improvement?--Htmlzycq（留言） 2021年1月5日 (二) 02:48 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：感謝閣下貢獻（不愧是「模板控」）。粗看一下，membrane protein連到一般的膜蛋白去了，這個連結還是去掉的好（應該沒有辦法為冠狀病毒的M蛋白單獨寫一篇條目），outer membrane protein連到細菌的外膜蛋白去了（同上，這個也去掉比較好），非結構蛋白不同冠狀病毒歧異性很大，命名方式也都不同，難以概括，目前唯一有條目的NS3是連到HCV的，不是冠狀病毒的，關於冠狀病毒的NS，我想應該有蠻多是有建立成條目的價值（例如SARS1/2的ORF8，這個可以大書特書），但目前都沒有條目，可以等到有條目建立再放上去。
希望今年能在中文版將這些病毒學條目一一建立。題外話：中文版被埃及阿拉伯語趕超了？--Wikimycota~🍄 2021年1月5日 (二) 07:23 (UTC)[回复]

在下建立这个模板只是先试一下，想改的还有很多，比如在这次大流行中这么重要的spike protein英文至今都是重定向到Peplomer没有独立条目，这不应该啊，还有S蛋白的RBD，在下认为也有独立条目的必要。

題外話：是的，埃及阿拉伯語20年初就开始疯涨，2万起步一年内突破100万，11月初趕超了中文版，另外，9月乌克兰语版超过了葡萄牙语版，与中文的差距也从2016年的24万缩小到10万，更多见Wikipedia:统计/与邻近条目数量的语言版本比较存档--Htmlzycq（留言） 2021年1月5日 (二) 09:09 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：確實RBD有獨立條目的價值，另外許多特定冠狀病毒的輔助蛋白（有研究闡明功能的幾個ORF）應該也能獨立成跳目，例如ORF8 in SARS, ORF3 in SARS等，另外還可以寫一篇冠狀病毒的輔助蛋白統整介紹不同冠狀病毒的輔助蛋白。閣下還有這方面的寫作計畫嗎？
一年增加100萬....跟瑞典語一樣是刷物種嗎？去年增加的條目大都是機器人刷出來的？--Wikimycota~🍄 2021年1月6日 (三) 09:07 (UTC)[回复]

没有，感觉在下没有这个能力，在下在英文建立的条目基本上都是stub。

題外話：好像刷了很多人物，和阿拉伯语一样，估计是同一批人干的--Htmlzycq（留言） 2021年1月6日 (三) 13:26 (UTC)[回复]

问一下刺蝟冠狀病毒和東北刺蝟冠狀病毒HKU31在Merbecovirus（支系C）中的亲缘关系是最近的吗？如果是，那该条目似乎应该和英文条目一样，移动到“刺蝟冠狀病毒1”，而原条目可像鼠冠状病毒（MCoV）一样作为这一类的总称当然，要有文献支持这样命名--Htmlzycq（留言） 2021年1月6日 (三) 15:39 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：是，這兩個應該是最近的，刺蝟冠狀病毒1是前者，東北刺蝟冠狀病毒HKU31沒有別名（好像也無人跟進研究），這兩個相似度只有79.6%，以冠狀病毒的慣例90%以上才被視為同種。剛發現英文版跟德文版都把Rat Coronavirus獨立成條了，這個應該跟小鼠的是同種。還有Letovirinae，這個亞科是單型的，不知為何英文版條目是以亞科為標題，而非病毒（雖然後來我引用了去年介紹的太平洋鮭魚病毒，但那篇僅是提到發現了與MLeV類似的病毒，沒有提及是否視為同種，或發表為新種，而且在您補充前英文版也沒有人注意到這個鮭魚病毒的存在）當初我就很想在英文版把它移動到MLeV，因為單型的單元應該用最下級的階層命名，也想過在Wikidata請求合併，但考量到在Wikispecies兩者還是不同的entry，不知道怎麼做。--Wikimycota~🍄 2021年1月7日 (四) 05:06 (UTC)[回复]

诚如阁下用户页所说，英文维基上也充斥着不少过时的内容，之前的Letovirinae就是一例，相信随着更多的对海洋生物病毒的探索，会有更多的勒托病毒被发现。MCoV这边，感觉 Mouse hepatitis virus 和 Rat Coronavirus 都应该算作 Murine coronavirus 下的“subspecies”，而 Sialodacryoadenitis virus 和 Parker's rat coronavirus 应该算作“Strain”，龙泉罗赛鼠冠状病毒的信息应该也可以加入Rat Coronavirus条目了。另外，Wikidata里很难合併的，即使物种名和异名都会有两个entry--Htmlzycq（留言） 2021年1月7日 (四) 06:43 (UTC)[回复]

英文版{{Coronavirus}}又给改成属-亚属的格式了，而且还是以字母顺序排序，看来Ypna他们只接受ICTV的命名，但在下觉得这样与Coronaviridae这个页面的点列式列表无异，相比之下阁下的模板更方便看出各个支系之间的关系。--Htmlzycq（留言） 2021年1月8日 (五) 12:27 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：真不知為何這麼搞，ICTV收錄新種病毒的速度是很慢的，而且經常有漏，像Pacific salmon nidovirus這種只是論文中稍微提及的刪掉就算了，至少經論文在無爭議的期刊上正式發表、命名的病毒應該都充分符合關注度才是。重寫模板的人編輯摘要給出"rewrote entire template for taxonomic consistency and proper formatting"，不曉得是不是沒有看懂原本的模板是反映支序分類關係，而認為僅是未經整理的inappropriate formatting......--Wikimycota~🍄 2021年1月8日 (五) 20:43 (UTC)[回复]

在下觉得像229E-like、NL63-like 这样的分类名明显好于 Duvinacovirus、Setracovirus 这样不知所云的ICTV亚属名，而且结构化的排布也很好反映了两者相近的亲缘关系，但他们要是以ICTV为权威，看来也只能这样了--Htmlzycq（留言） 2021年1月9日 (六) 02:52 (UTC)[回复]

RmYN02等

另外，英文维基上有人觉得RmYN02符合关注度可以创建，见en:User_talk:ScrupulousScribe#about_RmYN02--Htmlzycq（留言） 2021年1月16日 (六) 11:14 (UTC)[回复]

这位用户他建立条目了，见en:RmYN02。另外有个问题，en:Bat SARS-like coronavirus WIV1和en:SHC014-CoV哪个离SARS-COV-1更接近？--Htmlzycq（留言） 2021年1月16日 (六) 17:27 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：WIV1可能近一些，用RBD做出的演化樹WIV1比SHC014更接近SARS[1][2]（WIV1非常接近Rs3367），但沒有找到全基因組下去比的，加上可能還有基因重組，我覺得真實關係難說，只能說都很接近。正好我有打算在中文版寫RmYN02、SHC014跟ZC45的條目，這幾個病毒株都有一定關注度，RmYN02是去年剛發現、跟covid相似度僅次於RaTG13且做出演化樹甚至可能比它更接近covid，SHC014是石正麗曾經拿來做可以感染人類細胞的重組病毒引起一陣風波，ZC45是閆麗夢聲稱covid人工製造的來源株。--Wikimycota~🍄 2021年1月16日 (六) 21:57 (UTC)[回复]

谢谢阁下又写了Rc-o319病毒，另外，记得在下在一篇文章中看到SARSr-CoV这个“种”下发现的病毒，可以明显的分为三支，人SARS-COV-1和人SARS-COV-2分别位于其中两支，假设这个分支系统被新的发现继续巩固，这个“种”是否将来会分为此三个“亚种”？--Htmlzycq（留言） 2021年1月18日 (一) 16:44 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：冠狀病毒好像不常使用亞種的概念，只會稱是不同病毒株，種的概念則是以複製酶保守區相似度90%來界定。我看到的文章都是只有分成SARS-CoV-1與SARS-CoV-2兩支，閣下記得另一支包含哪些病毒嗎（還是能不能找到那篇論文）--Wikimycota~🍄 2021年1月18日 (一) 17:06 (UTC)[回复]
@Htmlzycq：找到了，是不是這篇，第三支是BtKY72與BM48-31兩種蝙蝠病毒。--Wikimycota~🍄 2021年1月18日 (一) 17:38 (UTC)[回复]

嗯，那篇文章应该是时间上晚于这篇的一篇文章，那个时候刚刚被命名为SARS-COV-2。其中，第三支应该是包括BtKY72與BM48-31兩種以及其它多種病毒的一支，分化点早于SARS-COV-1和SARS-COV-2的分化，但貌似複製酶保守區相似度仍在90%以上。不过可能由于没有产生可感染人类的病毒，所以很多文章的系统树并没有把这一支算进去吧。--Htmlzycq（留言） 2021年1月18日 (一) 18:29 (UTC)[回复]

  1. 是的，根据PMID:31296683这篇发现的文章，BtKY72可能是在非洲国家发现的第一种β-冠状病毒，应该有足够关注度。
  2. 根据PMID: 32699095，PMID：33219796这两篇文章，用基因组的不同片段建树，BtKY72與BM48-31所在的这一支，有时候在SARS-COV-1和SARS-COV-2的分化点之前分出来，有时候插在他两之间，但三者都很明显的单支，没有crosstalk。
  3. 临时先把拉尔夫·S·巴里克这个stub建立了，看了年初有人写的[3]，感觉他的故事可以多写一些。--Htmlzycq（留言） 2021年1月19日 (二) 12:04 (UTC)[回复]
@Htmlzycq：大概看了下PMID: 32699095是比較各病毒株S蛋白和各物種ACE的結合，好像沒有提到支序分類？33219796這篇全基因組去做的樹中BM48-31插在他倆中間（更接近SARS-1，但clade的分數只有64），相較之下我上面連結的那篇也是拿全基因組做樹，BM48-31是在最基部（分化點早於SARS-1與2的分化點），結果不太一致（否則我會在條目中畫支序圖），可能是33219796分析的病毒株比較少造成，另外可惜它沒有把RmYN02加進去比較。
另外剛才研究了一下這個「第三支」，有些新發現，從BM48-31的那篇發現了一支"Ghana-348"，是2009年這篇所發表（僅有RdRP保守區序列，未有全基因組序列），這支本身不被視為SARSr-CoV，而是SARSr-CoV的姊妹群，比HKU9更接近SARSr-CoV，這樣它地位有可能接近蹄蝠乙型冠狀病毒浙江2013，兩者關係令人好奇。而2009年還有另一篇發表了許多肯亞的SARSr-CoV（也未有全基因組序列，僅有RdRP保守區），雖然演化樹的解析度不高難以判讀（甚至Betacoronavirus都不成單系群了），但粗看之下這些有可能也是SARSr-CoV中比較基部的演化支，可能地位也跟BtKY72類似。不過有完整基因組定序的應該只有BtKY72和BM48-31，兩者我都會盡量寫成條目（我自己對病毒關注度的門檻是具有完整序列，且論文中有特別段落介紹，所以一篇發表數十種病毒的論文，大概會有數種有寫的價值）。前幾天看2020.12.18石正麗在專欄中說"(Rc-o319) is the first full-length genome sequence of bat sarbecovirus reported in an Asian country other than China"，我還相當疑惑為何要強調"Asian"，追到這裡才知道應該就是歐洲、非洲有BM48-31和BtKY72的緣故，可惜絕大多數文章都不提了，這些中國以外的病毒株對重構SARSr-CoV的演化史應該是非常有幫助的，不知道除了上述這些，閣下還有沒有看過哪些中國以外的SARSr-CoV（穿山甲病毒應該也是，畢竟那穿山甲是從南洋走私到中國，不是原產在中國，幾個月前Nature也有文章提及柬埔寨發現了接近SARS-2的RdRP序列，但尚未發表）--Wikimycota~🍄 2021年1月20日 (三) 02:11 (UTC)[回复]
@Htmlzycq：ZC45病毒與ZXC21病毒，這次是您們浙江的，這兩個是疫情爆發時唯二已知與SARS-CoV-2在同一支的病毒，其他都是之後才發表的，所以去年爆紅了....--Wikimycota~🍄 2021年1月20日 (三) 06:48 (UTC)[回复]

谢谢，其实舟山和台北到我家直线距离都是300公里，就是一个有跨海大桥一个没有，ZC45去年爆红了一下，但风头迅速被穿山甲病毒盖过去了 囧rz……

BtKY72與BM48-31兩種所在的这一支（这里在下“原创研究”一下，暂时把它称为SARS-COV-3），现有的发现地基本上位于欧洲非洲，和SARS-COV-1、SARS-COV-2的主要发现地，华南及东南亚（在下认为算是一个地理区）有着“地理隔离”，因此应该是较早分离出来的基部的演化支，其独立演化过程中，应该没有与1、2发生重组。部分序列树显示的SARS-COV-3插在它两之间的可能是样本量少造成的偏误？ --Htmlzycq（留言） 2021年1月20日 (三) 10:05 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：對，可能是樣本數較少所致（如我上則留言所說，PMID：33219796使用的樣本較少）。最近越是研究，越發對SARSr-CoV的演化史感到好奇，並對為何SARSr-CoV是在東洋區（即華南與東南亞）、而非其他地方發生輻射演化感到百思不得其解，可惜沒有查到任何類似的研究（估計關心的人太少，而且中國以外地區對SARSr-CoV的研究、調查相當不足），我想要回答這個問題，應該還得對蝙蝠的生物地理學有相當了解。這些資訊對於阻止下一次的疫情爆發應該相當重要（剛好閣下使用SARS-CoV-3，有些不吉，彷彿這「第三支」不讓另外兩支專美於前，在20X0年迸出了一個SARS-CoV-3又造成一番疫情）。
下一篇我便打算寫穿山甲冠狀病毒。待疫情結束，閣下應該來台灣一遊。--Wikimycota~🍄 2021年1月20日 (三) 22:49 (UTC)[回复]

谢谢邀请，话说“不讓另外兩支專美於前”的可能性还真有 囧rz……，毕竟它分布范围这么广，看了保加利亚那篇论文，好像大多数蝙蝠在地中海南北都有分布，不知道在保加利亚和Kenya之间还有多少未知在等着人们去探索。关于對於阻止下一次的疫情爆發，在下记得石正麗20年的一次网络演讲中提到了她认为的有可能演化出感染人类的支系应该是重组变异最多的几个，另外在下想起了[4]一文中的Ralph S Baric，没有他在02年及更早先对冠状病毒的前瞻性研究，中国的科学家就不会这么快认识到“非典”是冠状病毒引起的，如果没有在03年爆发了非典，可能他会转行成为一个游泳教练，可以说是相互成就吧。不过石正麗和Ralph S Baric这二位现在变成了某些“阴谋论”的主角了 囧rz……

关于“穿山甲冠状病毒”，感觉和ZC45病毒與ZXC21病毒不一样，ZCZX两者关系非常近，目前没有发现舟山以外的病毒，但是广东截获的和广西截获的很明显关系不近，两者之间有其它的蝙蝠病毒在，说明東洋區的蝙蝠与穿山甲之间发生了多次相互传播的事件，估计以后会有很多“穿山甲冠状病毒”发现，建议条目在将来可以写成类似于蝙蝠携带的病毒的综述形式--Htmlzycq（留言） 2021年1月21日 (四) 03:53 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：作為從事基礎科學研究的人，我對基礎科學不受重視的情形深有體會（在維基百科好像也是如此），閣下有興趣繼續擴充Baric的條目嗎？可參考這篇（有提到他非常擅長游泳，可惜沒講到他一度撐不下去要去當游泳教練...）。
穿山甲冠狀病毒除了去年3月這篇發表的廣西、廣東型，至少還有[5][6][7]，其中PMID: 31652964是唯一一篇疫情前發表的，雖無完整序列，但可見穿山甲冠狀病毒相當多樣，甚至可能包含alphacoronavirus, deltacoronavirus的成員。而另外三篇都是疫情後發表的，這三篇的病毒應該很接近，都是RBD和SARS-CoV-2相似度極高（關鍵位點完全吻合），都是廣東廣西海關截獲的穿山甲，但都沒有把他篇的pangolin-cov拿來相互比較，看來條目不好處理，需要思考一下。
蝙蝠携带的病毒這個條目相當重要，百科性很強，在英文版是優良條目，等這些SARSr-CoV處理完，希望能將英文版完整翻譯。--Wikimycota~🍄 2021年1月21日 (四) 06:23 (UTC)[回复]

聊聊其他的

擴充Baric的條目还是留给其他维基人吧，在下最近想尽可能多的建立一些学者条目，哪怕是一个小条目，也可以帮助其他人。说道这个，怀念一下被错误封禁的User：镜海水手，当年我是这么问他为什么要写这么多科学家小条目的时候，他说图方便快速建立一些。

User_talk:靖天子/存檔4#关于那个用户的禁封，User_talk:Jinghaishuishou#这到底是怎么回事！？

最近建立了好几个奖项等科学家有关列表如刘易斯·托马斯奖、美国科学促进会主席等，还能看到他当年所写的学者小条目--Htmlzycq（留言） 2021年1月21日 (四) 11:16 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：我簡單擴充了Baric的條目，中文維基百科的科學家條目確實非常缺乏，記得我寫過一些真菌條目，內文提到近十位科學家，清一色全部沒有條目、一片綠色連結.....那位是武漢大學的朋友吧，轉眼間竟已七年了，閣下當年說維基有點「萬馬齊喑」，然而現在中文維基的社群環境又不知比當年惡化幾倍了，虧得閣下多年不輟寫作大量生物與化學條目。也看到我早已無力更新的Portal:生物学/新进条目，很高興這兩年在閣下長期努力之下又持續運作。--Wikimycota~🍄 2021年1月21日 (四) 21:13 (UTC)[回复]

Baric已经提报DYK，另外Portal:生物学/新进条目现在在下也無力更新了，有几位不断更新动物物种的维基人在接力，虽然忽略了其它生物领域，但也算是一件幸事了--Htmlzycq（留言） 2021年1月21日 (四) 23:09 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：感謝提名，剛剛又多擴充了一些。一個小發現：剛疑惑為何2002那篇MHV cDNA的研究文中僅說 "In this study we report the first reverse genetic system for a group II coronavirus, MHV-A59"，後來查到在Baric成功組裝MHV的cDNA前，已經有人組裝了TGEV與IBV的cDNA（[8][9]），分別屬group I與group III。
有注意到來了幾位專門寫恐龍、古生物的維基人，恐龍領域多年來出了幾位專精的編者，算是中文維基百科的生物條目中難得比較多人關注的。--Wikimycota~🍄 2021年1月21日 (四) 23:42 (UTC)[回复]
是的，其实十年前的也是有几位專門寫恐龍的維基人，许多Wikipedia:模仿专题/英语维基典范条目#非鸟恐龙里的优良条目是他们当年写的。--Htmlzycq（留言） 2021年1月22日 (五) 05:07 (UTC)[回复]
@Htmlzycq：穿山甲冠狀病毒。仔細閱讀[10]的全部數據後我對演化樹中有Pangolin-CoV屬於Deltacoronavirus與Alphacoronavirus的演化支感到相當懷疑，認為這應該是樣本數過少造成，這篇文章自己附上的blast結果也認為那些病毒是與SARSr-CoV相似，且他們隔年的新文章[11]也只主張有一種SARSr-CoV。所以我認為已知的穿山甲冠狀病毒應該通通屬於SARS-CoV，條目中還是使用了分類框，當然它們彼此並不構成一個單系群，中間穿插有蝙蝠病毒，因此特別畫出演化樹讓讀者參考。穿山甲病毒被不同研究組多次發現，彼此間又缺乏比較（像是Pangolin-CoV-2020可能根本跟GD是相同的），資訊紛亂，實在是不太好寫的一篇條目。
看了閣下的連結，感到古菌可能是在下有興趣翻譯的（但短期應該還是寫冠狀病毒為主），至於那一堆菇類的FA對讀者的幫助感覺不大，我倒不是很有興趣寫--Wikimycota~🍄 2021年1月23日 (六) 02:44 (UTC)[回复]

谢谢阁下的贡献，由于维基不能原创研究，就算Pangolin-CoV-2020根本同GD相同也要等今年出一些综述性文章后，维基再来跟进引用。 另外，在下把Rc-o319病毒加上去了，毕竟是目前明确的SARS-COV-2里最远的一支。

古菌，相当重要的基础条目，在下13年的时候扩充过一点点，把“new domain”翻译为“新域的诞生”，近年来看到英文条目有了一些变化，比如分类树等，该跟新了。--Htmlzycq（留言） 2021年1月23日 (六) 04:11 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：WIV病毒。這大概是SARSr-CoV中最重要的，英文版整個寫偏了，除了第一句話之外通通離題......閣下如有關於古菌條目的編寫計畫，我也可以幫忙。--Wikimycota~🍄 2021年1月23日 (六) 09:03 (UTC)[回复]

(？)疑問条目名不应该是WIV1病毒吗？

应该是阁下有什么计划，在下也可以幫忙才对

去年年中开始，在下基本上把哲人石丛书等翻译、创建的丛书条目作者写了个stub，见User talk:Ma3r#关于丛书类型条目的探讨，在下想继续下去，世纪人文系列丛书里的作者是一个很大的工程，--Htmlzycq（留言） 2021年1月23日 (六) 10:40 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：糗了，漏了個1，補上了。這麼多作者看來是浩大工程。--Wikimycota~🍄 2021年1月24日 (日) 04:40 (UTC)[回复]
@Htmlzycq：YNLF 31C病毒與YNLF 34C病毒。我原以為這兩個應該是ORF8跟SARS最接近的，相似度超過八成了，不料[12]竟發現潛藏在資料庫中的兩個中華菊頭蝠病毒株ORF8和SARS的幾乎相同，大出我意料之外，這其實幾乎把原論文提出SARS-1是Rf, Rs兩種蝙蝠中SARSr-CoV重組而來的假說給毀了，偏偏兩篇沒有互引，也沒有其他文章引用比較，受限於原創研究而不能在條目中寫太多。
查閱大量資料後感到SARSr-CoV的資料相當零散，沒有完善的綜述性文章概括所有重要內容，只好讓在下斗膽在中文維基百科發揮此功能。另外關於閣下之前詢問WIV1與SHC014和SARS-1的相似度，根據[13]這篇確實是WIV1略高0.2%，但這篇新發表的WIV16病毒跟SARS-1相似度96%，應是目前已知跟SARS-1最相似的（不計果子狸的話），這些在下都會盡快建立完善。--Wikimycota~🍄 2021年1月24日 (日) 10:05 (UTC)[回复]

条目数量

嗯，之前在和Ma3r讨论的时候是把寫書籍條目作为“三步走”的“第三步”的，但后来发现自己写作者条目stub越写越顺利（都形成固定的套路了）就想快点都建起来。另一个原因是这些作者中文译名都是有来源的，直接用译者给出的就行了，不会像写其他人需要“原创译名”，其实在下这段时间里写了《病毒星球》、《致命伴侣》这些书里给出的病毒学家、细菌学家等学者的stub也是因为译者给出了译名，不需要“原创”。

预测一下，2021年越南语、日本语的条目数量都应该会超过LSJbot当年搞大的瓦瑞瓦瑞语，中文版应该会在2022年初--Htmlzycq（留言） 2021年1月24日 (日) 10:10 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：（在下前一則留言湊巧與閣下編輯衝突了，好像沒有ping到）至今仍對當年基金會放任、甚至公開鼓勵這類用機器人刷條目的做法感到不解，那幾個小語種維基也算是毀了。特別是物種條目，中文至今都未能清完當初錯誤、重複的條目。記得當年我們還在與越南語互相追趕，現在居然他們領先這麼多去了--Wikimycota~🍄 2021年1月24日 (日) 10:39 (UTC)[回复]

原来基金會还公開鼓勵过bot？真是大开眼界。

虽然没搞懂阿拉伯语和埃及阿拉伯语编者之间的关系，但在下这样推测：在那几位人肉机器人把阿拉伯语刷过百万条目后，被阿语版社群“赶走”了，之后他们转战埃及阿拉伯语刷了百万以上条目，直到数据库暂时性“枯竭”，不知道埃及阿语版接下来会有什么动作。

越南语也是14年刷过百万条目的，不过中文版也没什么好骄傲的，当年也是刷过条目，见{{Milestone}}--Htmlzycq（留言） 2021年1月24日 (日) 16:13 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：好像是某次年會上講的，非但不考慮將那些小語種打回原型，還大加表揚了一番，不過我也是從別人處聽說。記得埃及阿拉伯語版當初連是否獲准設立都吵了一陣子，現在居然都超過中文版了。話說回來，當年我們先後跟越南語、瑞典語和宿霧語大戰，真是一段熱血的時光，雖然我沒有能力操縱機器人參與，但每天看到客棧裡大家為了同一目標討論分工的氛圍，包括好幾位彼此不合的維基人都攜手合作，讓我更加體會到維基百科合作的精神，不過現在社群分裂至此，大概沒機會再看到類似的場景了....
關於{{SARSr-CoV}}，有關注度的條目快寫完了（HKU3病毒這種很久以前發表的病毒實在非常難寫），其他關注度不足以成條的病毒株應該有上百個，思考了一下後我打算在SARSr-CoV條目中以列表的形式介紹，包括長度、發表時間地點、宿主與特徵簡述，如能順利寫完應該會是一篇篇幅龐大的特色列表。--Wikimycota~🍄 2021年1月25日 (一) 00:20 (UTC)[回复]

谢谢阁下贡献，之前阁下把HKU1写到了三十几，唯独少了3，在下还以为没有这个编号的病毒呢

列表的形式记录關注度不足的病毒株这个想法很好，希望能成为特色列表。--Htmlzycq（留言） 2021年1月25日 (一) 04:19 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：不好找，HKU3應該是第一個被發現的蝙蝠SARSr-CoV，發表時都還沒有命名，全文找不到HKU3這個名稱，只叫做bat-SL-CoV。這個列表我目前構想，是先以幾個段落的文字介紹2003年以來至今SARSr-CoV的研究史，包括重要的幾篇研究，和幾個特別重要的病毒株，列表的部分欄位應該包括名稱、宿主、樣本採集時間、採集地點、發表時間、序列長度、有完整序列與否、成功分離與否、序列與SARS-CoV（或SARS-CoV-2）的相似度以及註腳。--Wikimycota~🍄 2021年1月25日 (一) 06:34 (UTC)[回复]

路過

顧名思義，路過。這就是神仙打架嘛 Orz —— Eric Liu 創造は生命（留言．留名．學生會） 2021年1月26日 (二) 03:09 (UTC)[回复]

@Ericliu1912：没看懂，哪里打架啦？--Htmlzycq（留言） 2021年1月26日 (二) 10:39 (UTC)[回复]
我也知道這個詞用的不好，要說的話應該是「神仙討論」，但顯然原創用詞不會有人看得懂（ —— Eric Liu 創造は生命（留言．留名．學生會） 2021年1月26日 (二) 14:08 (UTC)[回复]
@Ericliu1912：没事。刚发现，原来英文版的菊頭蝠科最近成为了特色条目了，有一段整理了其SARSr-COV的数量，见en:Horseshoe bat#Coronaviruses --Htmlzycq（留言） 2021年1月26日 (二) 14:11 (UTC)[回复]
英文維基百科的優質內容產製速度血洗本地啊，生物學方面算是本地相對落後的一個領域。多虧有靖天子閣下等人奮力撐著門面。—— Eric Liu 創造は生命（留言．留名．學生會） 2021年1月26日 (二) 14:14 (UTC)[回复]
  • @Ericliu1912、Htmlzycq：感謝，第一次聽到這個詞。不過「撐著門面」還不敢當，門面應該是生物學中比較重要、點閱率高的基礎條目，中學課本就會介紹的概念，這些「門面」不幸在中文維基百科中大多質量很低，過去雖曾有許多獲選優特條目（例如個人印象很深刻的光呼吸），但2012左右通通被撤銷了，那些條目的主編也早已離開維基百科。我個人寫「門面」的優特條目大概只有5條左右（真菌、白色念珠菌、管胞、糊粉層、巴爾小體），還有很多我希望能寫成優特的，包括古菌、轉錄、轉譯、核糖體、tRNA、mRNA、rRNA、miRNA、RNA、RNA世界.....只是這些大都需要原創編寫，而需要長期規劃整理。
  • 計算病毒株數目我覺得不一定能反映多樣性，畢竟有的毒株彼此高達99%相似也被視為不同的，可能某篇研究多採了幾隻蝙蝠就多幾個病毒株了。說到蝙蝠，這麼多年來我好像沒看過任何一位維基人寫蝙蝠的條目，也沒印象有在DYK見過，打開翼手目分類表，大部分是紅字，藍字也全部都是小作品，大概放幾年都不會有人寫，可能等得哪天有對蝙蝠有興趣的「神仙」加入才能改善。--Wiki SL-CoV🦠 2021年1月26日 (二) 20:25 (UTC)[回复]

en:Template talk:Coronaviridae，Ypna 建议我们中文也该改成他那样的，该怎么和他解释好呢？--Htmlzycq（留言） 2021年1月27日 (三) 16:09 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：我上去留言向他解釋了。另外英文版把gamma跟delta完全搞反了，不但模板裡寫反，很多條目裡也寫反，這錯誤實在是......看了編輯紀錄，不知道是不是ICTV網站上寫反了（我打不開ICTV網站上的分類表）。
倒是有一點收穫，就是發現了幾個漏寫的鳥類病毒（有些是去年剛發表），例如鴨冠狀病毒2714、鵝冠狀病毒CB17，哎真是永遠沒有寫完的一天。--Wiki SL-CoV🦠 2021年1月27日 (三) 21:22 (UTC)[回复]

看了一下ICTV没搞错，Ypna搞错了。另外，他用的NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b、Myodes coronavirus 2JL14也全都是ICTV里的物种名--Htmlzycq（留言） 2021年1月28日 (四) 02:09 (UTC)[回复]

ICTV等

  • @Htmlzycq：打擾了，能不能幫我看下ICTV網站（不知為何我用任何瀏覽器都顯示錯誤頁面），gammacoronavirus現在是不是分成五個物種（Avian coronavirus, Avian coronavirus 9203, Duck coronavirus 2714, Beluga whale coronavirus SW1與Goose coronavirus CB17）？網站上有提供支序圖或其他分類資訊嗎？謝謝。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月3日 (三) 01:28 (UTC)[回复]

是的，ICTV的分类系统里，gamma分为三个亚属，五个种，和当前英文版一致，其中 Avian coronavirus 是 Igacovirus 的“模式种”--Htmlzycq（留言） 2021年2月3日 (三) 01:40 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：感謝，我將擴充鳥類冠狀病毒條目至優良條目。火雞的看來也被歸入9203了。最基群是鯨豚那隻嗎？看到有文章說CB17是Igacovirus（三個鳥類病毒物種）的姊妹群。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月3日 (三) 01:58 (UTC)[回复]

ICTV的分类里，都是三个三个并列，看不出来谁是基群--Htmlzycq（留言） 2021年2月3日 (三) 02:10 (UTC)[回复]

在下有这种感觉：和最新文献中给出的分类系统相比，英文维基更倾向于使用已有的网络数据库给出的分类系统，哪怕数据库本身已经有点过时，比如在下之前在和Boghog讨论的{{转录因子与细胞内受体}}中的Paired box (3.2)等分类编号来自于TRANSFAC数据库，见en:User_talk:Boghog中的About_{{Transcription_factors_and_intracellular_receptors}}

PS:96%是个挺神奇的病毒全基因组相似度，SARS-COV-1和WIV16病毒，SARS-COV-2和RaTG13病毒，OC43和牛冠狀病毒--Htmlzycq（留言） 2021年2月3日 (三) 03:21 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：恐怖唷，不知道這3-4%是不是某個很難變異出來、感染人類所需的關鍵元件（ORF8?），一旦越過這最後一道關卡人類就淪陷了（好像在講Great Filter（英语：Great Filter））
用資料庫的好處是簡明、編輯門檻低、好維護，但如果有人對這個領域很熟悉（Ypna應該也是病毒學的專家）人為去抓文獻可以得到比較豐富的結果。
另外感謝閣下創了MALAT1，還有興趣寫其他基因嗎？我特別喜歡lnRNA，有機會可以擴充。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月3日 (三) 06:14 (UTC)[回复]

在下觉得应该不是Great Filter（英语：Great Filter），而只是采样密度的问题，随着田野调查的深入，应该会发现相似度更高的不能感染人的病毒，除非MERS等一系列别的也卡在96%

PCGEM1、His-1、MALAT1、H19这几个，是在陈润生院士的公开课第三集中看到的，见[14] --Htmlzycq（留言） 2021年2月3日 (三) 06:46 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：是的我是開玩笑的 囧rz……，應該是取樣誤差所致，跟MERS最接近的是祖魯棕蝠冠狀病毒，沒有做全基因組定序，但看RdRP的差異，兩者應該還是差蠻遠的。期待哪天能發現跟SARS-CoV-2相似度99%的病毒。
閣下工作之餘還看公開課，並將所學寫成條目，要是有更多生物學者這麼做就好了。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月3日 (三) 18:50 (UTC)[回复]

鼠冠狀病毒已帮阁下提名DYK，另外，大鼠冠状病毒是单系群吗，还是和穿山甲冠状病毒一样的复系群？能做一个M-CoV内部的系统树吗？--Htmlzycq（留言） 2021年2月5日 (五) 01:21 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：感謝閣下提名，冠狀病毒寫到一半發現這條還有許多內容能寫。小鼠跟大鼠的應該都是單系群，但大鼠中SDAV跟帕克有可能不是（有人認為帕克只是SDAV的一型），不過沒有看到有人做鼠冠狀病毒之下各株的演化樹。浙江那兩支鼠病毒的位置也很不清楚（不同區段做出的結果不同），Puffinosis是污染的機率很高（真是感染鳥類就有趣了）。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月5日 (五) 06:18 (UTC)[回复]
  1. 明白了阁下对DYK 应该只上一次的想法，不过在下觉得wiki上关于科学的内容应该多多宣传才是。
  2. 在下感觉Puffinosis应该是污染吧，毕竟1982年的实验，如果放在今天，应该会先来一次组织RNA测序，看看有没有冠状病毒RNA。
  3. 突然发现HKU24也是在大鼠中发现的病毒，那大鼠冠状病毒这个条目未来应该改为对“所有能感染大鼠的冠状病毒”的综述性质条目。
  4. 结合A支系大部分都在啮齿动物（鼠类、兔类），估计有好多次传播到大鼠的事件，待以后看看怎么写吧。
  5. “可能是起源于鼠类，而非蝙蝠” 这样表达感觉不妥，毕竟整个α、β冠状病毒都是起源于蝙蝠，这样表达会让读者以为此病毒的演化路径无关蝙蝠，“早先就传播到啮齿动物”、“在啮齿动物中长期独立演化”（还是阁下来组织语言吧）

--Htmlzycq（留言） 2021年2月5日 (五) 07:30 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：
    1. 確實，科學條目少得可憐，不成比例，DYK跟優特條目經常半條科學條目都沒有，過去一直想推廣專業人士進來寫，多年來的感想還是我自己動手寫最快。不過說到這我倒是突然想到，閣下是不是之前有召集身邊的人合寫生物條目過？
    2. 是的，後續也無人研究了，但是個挺吸引人的假說（原論文聲稱只有患病鳥類組織感染的小鼠中可以分出病毒，其他小鼠中沒有），畢竟gamma跟delta都有外溢到哺乳類，alpha跟beta外溢到鳥類也是可以想像的。
    3. 是的，感染大鼠中的冠狀病毒有三：1.MCoV下的所有大鼠冠狀病毒、2.HKU24、3.alpha的鹿城褐家鼠冠狀病毒，小鼠的則有二：1.MCoV下的MHV、2.乙型冠狀病毒1型的龍泉黑線姬鼠冠狀病毒（LAMV）。但後面幾種幾乎無人討論，文獻中提到"Rat Coronavirus"、"Mouse Coronavirus"還是都只在討論MCoV底下的。如果之後有更多種病毒發現，可以將大鼠冠狀病毒獨立寫成綜述條目。兔也有類似狀況，除了HKU14外至少有兩株很早就發現但無人研究的冠狀病毒。
    4. 確實可能有此誤解，還是您想得周到，我稍微調了一下，您看能不能再調。可惜這個假說提出時就只是一筆帶過，寫太多怕有原創研究的感覺--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月5日 (五) 09:29 (UTC)[回复]

鼠類的冠狀病毒

在下还有个问题，在A支系中，ICTV给出的是五个物种，en:Myodes coronavirus 2JL14应该在系统树的哪里？--Htmlzycq（留言） 2021年2月5日 (五) 15:04 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：閣下不提的話我還不知道有這病毒，一查發現很有意思，是來自這篇文章[15]，這篇是大規模鼠類病毒的survey，沒有深入探討冠狀病毒，但發現了支序A大量的鼠類病毒（Fig.5)，感染包括不同屬的許多物種（不只大鼠與小鼠），2JL14在beta-CoV-1的那一支，不考慮基部那個HJL2015的話樹型還是MCoV, HKU1 以及 beta-CoV-1兩大支，比起HKU24那篇只發現一種就宣稱支序A共祖是鼠病毒，這篇的結果才真正說明了這點。
另還有兩點讓我驚喜的：1.AlphaCoV那邊有許多跟鹿城鼠病毒相關的，表示這不是孤例，AlphaCoV那裡真的有一大支跳到了囓齒類；2.Alpha基群是一個在西藏鼩鼱發現的病毒，馬上讓我想起之前寫過的文成鼩鼱病毒，在演化樹上也是AlphaCoV的基群，看來這也不是孤例。可惜這篇作者並未引用文成病毒那篇。
ICTV獨列2JL14是我不太能理解的，2JL14的位置並不特別特殊。這些病毒株本身根本沒有任何介紹，應該是不符合關注度的，寫了2JL14，就沒理由不寫另外20幾個病毒株的條目，真的要寫的話寫成「鼠類的冠狀病毒」（Coronavirus in rodents）比較合理。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月6日 (六) 10:16 (UTC)[回复]

谢谢阁下指出了這篇文章，这篇文章中冠状病毒的内容是Figure 5a 与 Figure S6，分别以RdRp和S蛋白建立的系统树只不过鹿城褐家鼠冠状病毒没有在S蛋白树中列出，HKU24在RdRp树中也标红了让人难找，写作的时间应该晚于User_talk:靖天子/存檔8#有關冠狀病毒里提到的HKU24和鹿城褐家鼠冠状病毒发表的时间，但早于文成鼩鼱病毒（WESV）的发表时间[16]MCOV中的LRLV和β1CoV中的LAMV在这篇文章中分别标为“longquan-708”和“longquan-343”？

貌似无论RdRp还是S建树，与OC43关系最近者都不是牛冠状病毒，牛冠状病毒只是全基因组与OC43最近吗？还是β1CoV中有其它更近的？

文成鼩鼱病毒（WESV）与这篇文章提出来的Shrew-CoV/Tibet2014的关系不知道后来有没有人做过？

这篇文章里和鹿城褐家鼠冠状病毒最近的是福建省发现的RtRl-CoV/FJ2015，这么近的距离，估计真的是 in situ evolution --Htmlzycq（留言） 2021年2月6日 (六) 15:51 (UTC)[回复]

再看了一遍，doi:10.1016/j.virol.2014.10.017文章的RdRp树中，明明龍泉羅賽鼠冠狀病毒（LRLV）和HKU1是最接近的，为什么又说LRLV belong to the established species murine coronavirus，而ICTV里HKU1是单独一个species的？

阁下的「鼠類的冠狀病毒」（Coronavirus in rodents）的想法在下觉得确实有意义，在下试着先在沙盒里写了一点点，不过感觉很快就会碰到“原创研究”。

最后，ICTV把2JL14獨列的原因估计是它是完成全基因组的12个之一，而且RdRp相似度刚好小于90%一点点。--Htmlzycq（留言） 2021年2月6日 (六) 16:54 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：沒有人做文成鼩鼱與西藏2014的關係，文成那篇發表於2017年8月，大規模鼠病毒研究是2018年10月，且後者內文還特別強調了西藏鼩鼱的特殊演化地位，可惜沒有引用前者一起討論，看起來西藏跟浙江中間應該還有大量鼩鼱病毒才是（剛發現鼩鼱原來跟嚙齒目關係是很遠的）。
LRLV的地位用不同區段建樹結果不同，有時更接近MCoV，有時更接近HKU1（RdRP是跟HKU1分成一群），其中龍泉708可能是兩支鼠病毒重組產生，所以我在鼠冠狀病毒中使用比較有彈性的描述，形容它跟MCoV、HKU1都很接近，但是作者選擇將其歸入MCoV，估計是當時不知HKU1有鼠病毒，根據大規模鼠病毒研究結果，LRLV（龍泉708）應該是在HKU1這一支（因為地位模糊我就沒有畫在演化樹上了），LAMV（龍泉343，龍泉黑線姬鼠冠狀病毒）確實在betaCoV1那一邊，但跟HKU24和其他鼠病毒成一支，跟其他betaCoV1沒那麼近，看起來不應該算betaCoV1的一株，否則兔HKU14跟HKU24也都能歸入betaCoV1了我一開始真的因為紅字漏看了HKU24跟LAMV。現在冠狀病毒這麼火紅，期待能再有幾篇這樣的大規模調查研究（特別是中國以外的）出來。
OC43跟馬、牛關係估計都很接近，也是不同區域做的結果不同，不知道是不是也有重組發生（但目前看到文章都咬定OC43是直接從牛分家）
「鼠類的冠狀病毒」，可以alpha、beta分段，alpha講鹿城那一支，beta至少有MCoV、HKU1-like、HKU24/LAMV-like三支，然後再一節講演化（確實有點原創總結的感覺）。同理還有「蝙蝠的冠狀病毒」、「鳥類的冠狀病毒」。
順帶一提，鼠冠狀病毒經過這幾天擴充，感覺足夠典範條目了，打算在優良條目之後提出，閣下認為這個條目還有沒有哪些內容可以寫的？--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月6日 (六) 22:03 (UTC)[回复]

有没有这种可能，LRLV（龍泉189、370、708）、LAMV（龍泉343）发表时，HKU1、14都已经发表了，但是ICTV并未更新，其A支系中，给出的只有两个物种：β1-COV 和 M-COV，所以那篇文章就暂时放入了这两个？--Htmlzycq（留言） 2021年2月7日 (日) 01:10 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：我覺得挺有可能的，畢竟ICTV比較常用「物種」的概念，文中說established species確有可能是指ICTV認定的。不過HKU1早在2005年就發表，這也拖太久了。另外今天偶然發現了一個閣下應該會有興趣的列表：en:Royal Society of London Michael Faraday Prize，感覺閣下會有興趣撰寫此條目以及上面的科學家。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月7日 (日) 07:54 (UTC)[回复]

鸟類的冠狀病毒

  • @Htmlzycq：謝謝閣下建立了伦敦皇家学会迈克尔·法拉第奖，寫完後應可評選特色列表，其中有位獲獎者Nick Lane是我相當崇拜的演化學家，他的書可說是我生物學的啟蒙之一。我打算開始寫鳥類冠狀病毒，這個條目閣下建議該如何處理，應該只收錄現ICTV定義的Avian Coronavirus（包括一些IBV病毒株、一些鴨病毒株[17]），將Avian coronavirus 9203（包含Turkey Coronavirus跟一些IBV的病毒株）跟Duck coronavirus 2714另立條目，還是將這些都寫在同一條目中？這些病毒分類相當混亂，Duck coronavirus 2714那一支也包含許多名為Avian Coronavirus XXXX的病毒--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月7日 (日) 21:47 (UTC)[回复]

不敢當，不敢當，能像刘易斯·托马斯奖一样把坑填完就行了，话说这两个都是科普类的奖项，有好多人获奖者重复的

感觉「鳥類的冠狀病毒」和Avian coronavirus、IBV的处理方式可能要像鼠这样处理：

综述性条目 ICTV定义的物种 模式株
鸟类 鳥類的冠狀病毒 禽冠狀病毒 禽傳染性支氣管炎病毒
英文 Coronavirus in birds Avian coronavirus, A-COV Avian infectious bronchitis virus, IBV
鼠类 鼠類的冠狀病毒 鼠冠狀病毒 鼠肝炎病毒
英文 Coronavirus in rodents Murine coronavirus, M-COV Mouse hepatitis virus, MHV
  1. 「鳥類的冠狀病毒」，可以gamma、delta分段，gamma里似乎除了Cegacovirus，都是鸟类的？
  2. 「禽冠狀病毒」里可以一笔带过以Avian coronavirus 9203为模式株的另一个ICTV定義的种，主要介绍该种下各个株
  3. IBV建议还是移动回原条目名，顺便吐槽一下英文维基对这里的处理："Avian coronavirus (IBV) is a coronavirus that infects birds, causing the associated disease avian infectious bronchitis (IB). "让人一头雾水

另外，阁下不先把冠状病毒提报DYK吗？还没上过，再不提报要过期了 --Htmlzycq（留言） 2021年2月8日 (一) 06:05 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：鼠肝炎病毒我沒有另立條目，直接寫在鼠冠狀病毒裡面，閣下的意思將禽冠狀病毒（Avian Coronavirus、ICTV的那個種）與傳染性支氣管炎病毒（IBV）分成兩個不同條目嗎？這裡比鼠類更難處理是因為MHV至少通通是從屬於M-CoV之下的，但IBV不同的株系分散在Avian Coronavirus以及Avian Coronavirus 9203這兩個物種中，另一點是Duck coronavirus 2714下的許多病毒株又叫做Avian Coronavirus XXXX（[18]此篇Fig.1有清楚的演化樹）。如果分開的話，禽冠狀病毒跟禽冠狀病毒9203就只講分類，傳染性支氣管炎病毒才介紹病毒機制與疾病？另一種處理方式是只寫一個條目禽冠狀病毒，將Avian Coronavirus, Avian Coronavirus 9203跟Duck coronavirus 2714的分類，下面各病毒（包括IBV、火雞病毒、鴨病毒的分子機制流行病學研究歷史）都包含在內。
是的，gamma只有Cegacovirus是哺乳類，有一點讓我感到意外的是，原本以為鯨豚這支是從某個鳥類病毒外溢過去，應該散落在鳥類支系中，但Cegacovirus其實是整個gamma的基群，在演化史上是個有趣的課題。
DYK只有中間不要中斷超過7天都行的，我這裡還有許多內容可以迅速的「打將」（不知道閣下下不下棋，借用圍棋術語）--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月8日 (一) 07:05 (UTC)[回复]

原来IBV和Avian Coronavirus的关系这么复杂，在下感觉IBV作为条目应该就写作为模式株的 NC 001451 的发现与研究，至于 KY 805845 、 MK 937829 这些分类在9203里的一笔带过吧

如同这篇文章指出的发现了多个鸟类冠状病毒物种，在下觉得根本问题是RdRp同一性大于90这个单一标准过于武断，导致2JL14、9203等奇怪的物种名

在下是赞成分開条目的，但是禽冠狀病毒跟禽冠狀病毒9203最好先缓一缓不写，估计2020年的这篇文章之后，ICTV会更新gamma和delta的种属分类，现在可以先把（包括IBV、火雞病毒、鴨病毒的分子機制流行病學研究歷史）都包含在 Igacovirus 或鳥類的冠狀病毒条目内。

PS:[19]这篇文章里，2018b版的ICTV分类，gamma还只有两个亚属两个种。

PS2: 想到一个综述性条目避免“原创研究”的方法，[20]里 dual-published both in the journal and Wikipedia --Htmlzycq（留言） 2021年2月8日 (一) 11:42 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：在下認為ICTV短期內應該不會更新gamma的物種數了，雖然那篇文章提出應該多列鴿子與鵝的兩病毒物種，但兩者都缺乏完整序列，感謝這篇文章的作者詳細介紹了整個鳥類冠狀病毒複雜的分類狀況，我感覺現在文獻中人類之外冠狀病毒的綜述文章相當缺乏。

MHV的文獻很多分別介紹不同病毒株（MHV-JHM、MHV-A59、MHV-3）的，不過IBV的文獻好像都是將其視為一體介紹，很少有專門介紹NC001451、KY805845等專門株系的（不過我還也沒開始細找），但IBV本身又是個複系群，加上鴨冠狀病毒很長一段時間被視為A-CoV，在下感覺如您所說，建一個Igacovirus的條目把這三個物種全部包含在內是最適合的（IBV、火雞病毒、鴨病毒、ACoV、ACoV9203都重定向到這條目），之後若有餘力再寫鳥類的冠狀病毒（綜述文章，包含gamma與delta的），但以Igacovirus為這一大型條目名稱又感覺有點彆扭。
閣下提供「談冠色變」的文章，裡面有許多有意思的中文名，像「普氏蹄蝠冠狀病毒Zhejiang2013」「黃鼠冠狀病毒HKU24」，要不要把這些條目移動到相應名稱？
Whoa! 感謝閣下提供PloS Wiki，看起來太有趣了，感覺比在中文維基寫條目有趣多，我都快跳槽了，不過我挺驚訝為何多年來文章這麼少，PloS Genetics與PloS Computational Biology各約十篇左右，PloS One則一篇都沒有，這可是全世界的作者啊，不曉得是不是他們審稿很嚴，還是大多數科學研究者不會像我倆這樣業餘去鑽研一個主題....--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月8日 (一) 23:53 (UTC)[回复]

翻译与译名问题

如果有发表文献支持，那还是移动吧，貌似“China Rattus”在中国大陆被称为“黃鼠”？同时感觉在下18年开的某菌菇译名的玩笑，最后导致阁下对社群某些事物心灰意冷，实在不好意思啦

跳槽应该算不上吧，毕竟可以草稿里中英文双向并进吗，吐槽一下自己在英文写的很多stub条目都没有翻译到中文，主要也是人名译名问题

PloS Wiki 上应该可以用类似 HKU1-related coronavirus 这样的符合惯例的“原创”分类名吧--Htmlzycq（留言） 2021年2月9日 (二) 04:02 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：剛剛移動了HKU24與浙江2013的標題，這篇中文文章還是有許多類似「魯布巴特蜜環菌」的譯名，果蝠屬（Rousettus）給翻成了「盧塞圖斯蝠」，伏翼屬（Pipistrellus）給翻成「皮皮斯特勒斯蝙蝠」這樣荒謬的名字，看到這些我不禁想起閣下當年開玩笑說如果有人想在中文維基建立「魯布巴特蜜環菌」，他首先需要發表一篇中文論文使用此名，再到中文維基來移動名稱.......不過我對中文維基的社群不再抱持希望，其實是社群長期沈淪退化使然，大概到我退選管理員才完全絕望，跟譯名事件沒有直接關係。看看現在的中文維基，社群沉痾、體制僵化，眾人以方針指引為利劍刺向彼此，新手被非常粗暴地對待....說到「跳槽」的話題，不瞞您說，我確實有在考慮將重心移到英文版，例如把自己在中文寫的優特翻譯到英文版，或在英文版寫出優特後再自己翻譯過來。
還是別說這些不開心的了，說些有趣的。剛翻查HKU24時看到這篇[21]，delta居然都外溢到鼠類去了，看完讓我更加覺得在PloS Wiki上寫"Coronavirus in rodents"是個好點子，不知道PloS Genetics或PloS One會不會有興趣收錄這樣的文章；還有這篇[22]（這篇的主題其實相當符合PloS Topic Article的內容形式），竟有在海豹中發現alpha與gamma CoV的紀錄。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月9日 (二) 23:08 (UTC)[回复]

谢谢阁下分享文章，说说在下的几点发现

1. PLOS ONE并不是没有发表于enwiki的文章，不过只有一篇en:Dicke model在下完全看不懂在说什么 囧rz……

2. 感觉"Coronavirus in rodents"是个很重要的话题，虽然没有文献明说，但目前的数据很明显指出HKU1、HECV-4408和OC43都是传播到人的以鼠类为 reservoir 的冠状病毒，不过传播途径不同：

HKU1 HECV-4408 OC43
来源 某支接近LRLV的鼠冠状病毒 某支接近LAMV/HKU24的鼠冠状病毒 某支接近LAMV/HKU24的鼠冠状病毒
中间宿主 可能没有 β1冠状病毒中的牛冠状病毒 某支β1冠状病毒
影响 可能大范围传播过 个例 大范围传播
受体 9-O-Ac-Sias 9-O-Ac-Sias 9-O-Ac-Sias

3. frontier上的那篇mini review的篇幅相对PLOS Topic Pages短了一些。个人感觉，其实mini review的篇幅更适合维基百科，如果"Coronavirus in rodents"要写到PLOS Topic的篇幅，像上面传播到人的鼠类冠状病毒内容也要写进去了，还有地理分布等。

4. α1CoV的姊妹群被叫做α2CoV，这有足够的参考文献支持吗？如果这样命名形成惯例的话，那β1CoV的在鼠类的冠状病毒中的姊妹群也可以被叫做β2CoV了？

--Htmlzycq（留言） 2021年2月10日 (三) 04:11 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：PloS Topic Article這樣的平台應該好好對科研人員推廣才是，應該比WikiJournal的吸引力高多了。是的，鼠類在此扮演的角色很關鍵，且考慮到人類接觸老鼠的機率遠大於接觸蝙蝠的機率，這樣的傳播事件應該發生了很多次，只是因不造成嚴重疾病而不為人知罷了。

α2CoV的命名來自[23]，不知道"Murine Coronavirus"的定義會不會擴大到包含整個Embevirus的鼠病毒。
在這裡存放一些昨晚查到有關鼠病毒的文章或資料庫中的序列[24][25][26][27]（unpublished）[28]（unpublished），如果有機會寫"Coronavirus in rodents"所需的文獻，我會繼續收集，閣下如有發現遺漏的也歡迎貼在這裡。目前看來鼠病毒的主要支序應該是清楚了，Alpha一支（鹿城等），Beta三支（M-CoV、HKU1-like、HKU24-like，但後者有可能再細分），沒有明顯地域性（有兩篇是歐洲樣本），但樹形每一篇有些許差異，我有機會可以自己用軟體將所有序列跑一遍試試（畢竟可以明目張膽的原創研究了）。另外兔HKU14那邊也有許多接近的兔病毒，且alpha也有一支兔病毒（跟古老文獻中發現的兔腸道病毒吻合）。此外鼩鼱病毒也是alpha的一支，應該位在比較基群（仍有分歧），雖然非嚙齒類，許多文獻把它跟鼠一起討論。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月10日 (三) 22:03 (UTC)[回复]

[29]刚报道的一个SARS-COV-2相关的东南亚蝙蝠病毒。感觉可以在"Coronavirus in rodents"里顺带介绍兔病毒和鼩鼱病毒，一个宿主亲缘关系近，一个生活习性近（在我这外行人看来是这样）。另外，法国的那篇文章，里面列出的好多系列都没见过，看来在下之前看文章的地域性太重了--Htmlzycq（留言） 2021年2月11日 (四) 03:19 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：感謝閣下分享，竟又有SARS2相關的出現，想必今年還會再有，希望我都能如期寫完。那篇法國的文章中使用的許多序列是僅有上傳到NCBI，未有相應發表文章的，這些序列我正在NCBI收集，有些來自兩三個最後沒有發表鼠類研究，有些是其他齧齒動物中發現的孤例（飛鼠、豪豬、裸鼴鼠），不清楚是偶然的外溢還是確實在野外存在此病毒，這些零星序列可在Coronavirus in rodents中可列出一表格整理。兔與鼩鼱也可用一「相關病毒」之類的段落概括。感覺能寫的內容相當充足，在下認為已經可以寄信給PloS Genetics或PloS One負責Topic Article的人詢問他們是否對這樣的文章有興趣。
另外一點離題的：剛剛寫了賀歲條目王氏水牛，換換口味，這篇文章不知道閣下能不能打開，記得知網以前可免費預覽幾頁，現在好像不行了（如果要付費的話就不麻煩了）。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月11日 (四) 08:41 (UTC)[回复]

新春快乐！！！

祝阁下新春快乐！！！

在家不能打開cnki，如果在学校应该可以，话说在下前几天在PloS Genetics的编辑里留言问了关于一个图片的改进问题en:User_talk:Evolution_and_evolvability#about_this_image--Htmlzycq（留言） 2021年2月11日 (四) 09:43 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：新春快樂！待閣下有空時看看（不急），如果內容沒什麼重要的，也沒什麼能寫在條目中的新資訊就不用了，如果有少許資訊閣下認為能在條目補充就直接編輯條目吧，如果資訊量多複雜，看能不能發送至我的郵箱（我用於維基百科的專門郵箱：wikimycota@gmail.com），或用網路存儲空間分享給我，看閣下方便哪種方式都可以，感謝啦！
這位editor竟是活躍數年的維基人，我寫信問問他對Coronavirus in rodents的想法，待有回覆再通知閣下。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月11日 (四) 19:28 (UTC)[回复]

关于RaTG13，一个好消息是，这一个月内被翻译成法语等多个语言；一个坏消息是，‎Alexbrn将‎Phylogenetics一节都删去了，原因似乎是“生物医学条目不能只有一手来源”？--Htmlzycq（留言） 2021年2月12日 (五) 16:29 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：這有點胡鬧了啊....他移除的內容只是RaTG13跟SARS2的相似度、SARS跟SARS的相似度、RmYN02跟SARS的相似度，WP:非原創研究：已發表且可靠的第一手來源（如由大學出版社或主流報紙發表）可能可以使用於維基百科，但應小心謹慎，以避免濫用。對第一手來源的任何解釋都需要可靠的第二手來源的相同解釋加以支持。如果沒有第二手來源，第一手來源只能用於描述性斷言），以這種新發表的物種（病毒）而言，勢必得主要使用第一手來源（發表物種的論文）撰寫，單純客觀的事實（外觀、各項數據、序列相似度）可以直接敘述，牽涉到提出理論解釋的（根據實驗結果提出的假說、作者認為的演化過程）則應小心使用，例如加上「作者認為」「有學者提出」「可能」等字眼，但相似度.....come on
退一萬步說，發表RaTG13的原始論文已被多篇其他論文引用，有多篇論文提及RaTG13和SARS2的相似度為96.2%，引述那幾篇論文至少（在佐證這句話上）可算是第二手來源，如果非要等到有綜述性文章提到這個數字才能寫入，太不現實了。
另外，驚覺英文版有人寫了RacCS203，點進去看果然是閣下。中文版也有打算寫嗎？--Labyrinthulomycetes🦠 receptor 2021年2月13日 (六) 00:33 (UTC)[回复]

中文暂时没打算写，只是试一下英文维基对最新文章报道的病毒株系的反映，果然被加了个{{one source}} 囧rz……--Htmlzycq（留言） 2021年2月13日 (六) 00:49 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：[30][31]加進去吧，我認為這反映的是整個維基的制度正在僵化，沒想到英文版也有這樣的情形。RacCS203病毒的中文條目我有空時寫吧，這幾天分心跑去寫水牛了。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月13日 (六) 07:41 (UTC)[回复]

奇怪，加上的这两个来源也会被戴上：use of deprecated (unreliable) source 标签--Htmlzycq（留言） 2021年2月13日 (六) 08:44 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：希望只是觸發標籤吧，不要真來個人把那兩個來源移除了.....閣下知道英文維基怎麼規範在物種條目中使用第一手來源嗎？對於大量冷門、無人關注的物種，可能除了最初發表的文獻就再也無人提及了（相信機器人刷的物種條目有相當多是這樣的），這些英文維基都怎麼處理，是不是又畫蛇添足地加上一些本身也是取自原始論文的資料庫作為來源--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月13日 (六) 09:40 (UTC)[回复]

不知道，英文维基给在下的感觉是不欢迎这一类冷門物種條目。--Htmlzycq（留言） 2021年2月13日 (六) 09:49 (UTC)[回复]

是每日邮报被列为了不可靠来源，已有用户过来删除了，另外，今天终于把上次说的《病毒星球》里提到的科学家（有英文条目的）给建立了stub，顺带瞎翻译了两个来自西班牙语的胡安·曼努埃尔·加西亚-鲁伊斯和马克·戈特施林和两个研究所古斯塔夫·鲁西研究所 乔治·艾莱瓦研究所。--Htmlzycq（留言） 2021年2月13日 (六) 11:53 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：恭喜閣下又成一大功，剛好我懂點西班牙語，晚點看能不能稍微擴充，當作翻譯練習...--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月14日 (日) 03:02 (UTC)[回复]

再論鳥類冠狀病毒

@Htmlzycq：這幾天又思考了一下棘手的鳥冠狀病毒，其實綜述條目鳥類的冠狀病毒（Coronavirus in birds）是可以寫的，這個與鼠的不同，有許多文章以此為主題探討，介紹gamma與delta中的鳥病毒，我想這篇可大量介紹所有鳥病毒的研究歷史，有寫到優良條目的潛力。另外gamma的每個物種都獨立條目：Avian Coronavirus、鳥冠狀病毒9203、鴨冠狀病毒2714、鵝冠狀病毒CB17、鯨豚冠狀病毒，IBV的病毒學內容在Avian Coronavirus條目中介紹，重定向到Avian Coronavirus；火雞病毒在鳥冠狀病毒9203中介紹，重定向到鳥冠狀病毒9203。不過Avian Coronavirus的中文名不知要取什麼好，鳥冠狀病毒？感覺很容易跟綜述條目「鳥類的冠狀病毒」混淆。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月15日 (一) 06:58 (UTC)[回复]

在下赞成禽冠状病毒，见上表，另有[32]这样的文献将ICTV的Avian Coronavirus译为“禽冠状病毒”当然，把“禽冠状病毒”当作丙丁中可感染鸟的笼统介绍的文章也有--Htmlzycq（留言） 2021年2月15日 (一) 09:08 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：ok，感謝閣下提供這篇，這樣禽冠狀病毒（物種）跟鳥類的冠狀病毒（綜述文章）應該比較不會混淆，也可在條目第一行另用模板註明。英文文章中也有一堆Avian Coronavirus拿來當丙丁鳥病毒籠統介紹的。冠狀病毒這主條目寫到快吐了....--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月15日 (一) 11:26 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：先寫了沒有爭議的雁冠狀病毒CB17。剩下的有兩個問題

  1. 可能要麻煩閣下幫我看看ICTV 2019 release中把gamma分為三個亞屬五個種，報告中有沒有介紹這樣區分的依據，還有每個種分別包含哪些病毒株，還是這些資訊皆沒有提供？
  2. Avian 9203跟Duck2714都是ICTV在整支中有點隨意地選了一個病毒株作為物種名（而且ICTV本身沒有給出演化樹，使用這套新分類系統的文章我只找到兩篇[33][34]，主要資訊都是依賴第一篇，第二篇介紹gamma的文段非常詭異，把火雞、珠雞的病毒都給當物種了，9203變成只包含野鳥病毒，這應該不符合ICTV的分類）。這樣Avian 9203跟Duck2714的條目中，是否應該介紹這些在其他水鳥中發現，過去地位未定，現在被歸入這兩種的病毒？（ex，某年中國發現哪些鴨鵝的病毒，歐洲發現哪些燕雀的病毒，美國發現哪些巨嘴鳥的病毒.......2020通通給歸入Duck2714），這樣的處理有沒有原創研究疑慮？
  3. 火雞冠狀病毒本身可能就不是單系群（[35]至少歐洲跟北美的有異，再考慮其他地區，可能差別更大，跟IBV根本是沒有明確分別的），但FEMS Microbiology的綜述文章只有分析火雞的一個病毒株NC010800，就把火雞冠狀病毒都歸入9203這個物種裡（(i) AvCoV that comprises some genotypes of IBV, (ii) AvCoV 9203 that similarly comprises some genotypes of IBV and turkey coronavirus；Fig.2右上也只在9203那畫了火雞，比其他種鳥胖了一倍），真實情況應該是有些病毒株屬於Avian，有些病毒株屬於9203，但因為沒有研究去交叉分析所有火雞病毒株和IBV的關係，我如果這樣寫又成原創研究了....好像我自己寫一篇review投稿到期刊被刊出後，再來維基百科寫，才能避開這種問題
  4. 順便吐槽個，查goose coronavirus，出來都是加拿大鵝這家服飾品牌因為疫情營收下降的新聞；查turkey coronavirus，出來都是土耳其的新冠疫情。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月17日 (三) 22:25 (UTC)[回复]

在ICTV里暂时没找到分类命名的说明。毕竟2019 release中给出太晚了，参考这里的gamma三亞屬五種的只有FEMS Microbiology和JVR的两篇文章也很正常，就以FEMS Microbiology里给出的树为准好了。turkey coronavirus估计和IBV一样都不是单系群，个人感觉如果要写条目，就介绍最早发现的那一株/或者是研究最全的那一株。

順便吐槽個，六种完全没有亲缘关系的猪冠状病毒，这篇文章也能写这么一大段，占了全文三分之一，可能原因是投的是兽医学杂志Journal of Veterinary Research吧，人家可能更关心畜产的病害情况。在维基里，估计建立一个猪冠状病毒的消歧义页就够了--Htmlzycq（留言） 2021年2月18日 (四) 02:54 (UTC)[回复]

序列分析

@Htmlzycq：去年便在Nature的評論文章上看到柬埔寨有未發表的SARS-CoV-2相關蝙蝠病毒，現在已經出現在biorxiv了[36]，這個大概93%。目前比較近的幾支病毒發現處：雲南、泰國、柬埔寨，感覺武漢很可能不是第一現場。
猪冠状病毒我給做了個表格，您看看如何。另外昨天寫229E的受體丙氨酸氨肽酶，發現infobox好幾個欄位顯示錯誤，剛剛上客棧技術版提問了。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月21日 (日) 01:26 (UTC)[回复]

那个表格挺好的，一目了然。在下不才，这几天才刚学会了用MEGA画系统发育树。不知道RshSTT200和RacCS203都放进进化树会怎么样。--Htmlzycq（留言） 2021年2月21日 (日) 03:37 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：我則更加不才，去年就下載了MEGA，但完全還沒開始用......之後開始摸索，如果有問題再向您請教。不知閣下有沒有興趣乾脆原創研究一篇「SARS-CoV-2 related coronaviruses」(SC2r-CoVs，RacCS203那篇已使用這個名稱)，加入比較所有SARS-CoV-2相關的病毒（目前無人完整比較過），用MEGA畫樹，再綜合比較各株異同，發表成PloS Topic Article。待閣下發表，我就當作可靠來源在中文維基畫樹，放入每個病毒的條目中--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月21日 (日) 08:28 (UTC)[回复]

阁下谦虚了，应该閣下先把文章发表了，在下再在各个stub里引用阁下的系统树，话说閣下有给PloS Topic那边的编辑邮件吗？--Htmlzycq（留言） 2021年2月21日 (日) 09:10 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：上個月弄了個abstract就給忘了....這兩天我趕緊來搞。剛順手把"SARS-CoV-3"的兩株寫了。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月21日 (日) 11:55 (UTC)[回复]

RmYN02的29671nt的完整序列阁下可以找到吗？在下发给阁下邮箱里的都是NCBI上找的SARS-CoV的ORF1ab的序列，但NCBI上只找到RmYN02的ORF1ab的部分序列--Htmlzycq（留言） 2021年2月24日 (三) 06:48 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：
  1. 可以，研究了一下發現這個序列應該是作者怕人搶了credit，沒放上NCBI，只發表在GISAID（個人實在不認同GISAID這種太過保護作者權利，阻止public access的系統），我上去註冊了，等核准後我應該能找到這個完整序列。另外發表在biorxiv上的柬埔寨蝙蝠病毒RshSTT182, RshSTT200應該也能在GISAID上找到。
  2. 閣下能收到我的回信嗎？前幾天您的email不知為何給系統分到了spam folder，不知是不是網易郵件跟gmail的問題。
  3. 發現這篇[37]，這個Zaria CoV是SARSr-CoV的外群，已經跟浙江2013一起被歸入Hibecovirus了[38]，另外還有一些去年在加彭發現的蝙蝠病毒[39]，還有Ghana343那一堆病毒，都是感染蹄蝠屬蝙蝠，這一塊（SARSr-CoV的相似病毒與基群）感覺是文獻中特別缺乏的部分，資料零散，閣下如寫這個主題的topic article，這部分應該可寫成相當精彩的內容。
  4. 一個與生物無關的，感謝閣下創了彼得·R·L·布朗，大學時我讀過他的The World of Late Antiquity，受限於背景知識而不太好讀，但挺有收穫。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月24日 (三) 21:36 (UTC)[回复]

Wikipedia Asian Month 2020 Postcard

Wikipedia Asian Month 2020
Wikipedia Asian Month 2020

Dear Participants and Organizers,

Kindly remind you that we only collect the information for Wikipedia Asian Month postcard 15/02/2021 UTC 23:59. If you haven't filled the Google form, please fill it asap. If you already completed the form, please stay tun, wait for the postcard and tracking emails.

Cheers!

Thank you and best regards,

Wikipedia Asian Month International Team, 2021.01

能否幫助改善紫絨絲膜菌

在巡查時看到了這篇條目，感覺問題很多，但因為我對真菌不是很精通，只能做一些格式上的修正，能否請您花些時間再做一些校正，謝謝。--クオン·千の海を越えて·夢か……現なのか？ 2021年1月11日 (一) 10:06 (UTC)[回复]

发现原因了，[40]这是爱丁堡大学的学生作业。--Htmlzycq（留言） 2021年1月16日 (六) 02:53 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：這您都能找到....佩服佩服，沒想到現在維基作業都能跨語言了，我原以為作者應該不懂中文，但看頁面中的名字似乎是華人（不知為何修課學生幾乎全是華人，可能這個翻譯學程是專門從事中英文間的翻譯？）不過他們的課程已於1/15結束，編者應該也不會再管這些條目了。--Wikimycota~🍄 2021年1月16日 (六) 07:45 (UTC)[回复]

请问阁下“Cystidium”一词如何翻译为好？（“间胞”如何？）以及，在下是一名喜爱真菌的编辑新手，所写内容想必错误不少，还请阁下及时指正--TheWindGrahame（留言） 2021年1月18日 (一) 13:40 (UTC)[回复]

果仁蜜餅送給您！

感謝撥空提點及建議鄙人關於北美紅橡的修改方式。 赤羽蒼玄（留言） 2021年1月27日 (三) 07:35 (UTC)[回复]

給您的星章！

友善星章
感謝 閣下一年來提點我關於植物學條目的編寫要點。

祝 閣下牛年快樂、事事順心！ 赤羽蒼玄（留言） 2021年2月11日 (四) 11:38 (UTC)[回复]

给您一一隻山羊！

祝前輩新年快樂！都是科研人咱就不說客套話了，祝前輩今年多發文章吧：）

クオン·千の海を越えて·夢か……現なのか？ 2021年2月11日 (四) 16:10 (UTC)[回复]

新年快樂！

新年快樂！
祝閣下新年快樂，萬事如意！感謝您過去一年來對中文維基百科的貢獻！—— Eric Liu 創造は生命（留言．留名．學生會） 2021年2月11日 (四) 19:52 (UTC)[回复]

要发送此消息，请使用{{subst:User:和平奮鬥救地球/HNY|選填賀詞}}。

一杯咖啡送給您！

謝謝閣下的祝賀，您也是多年來筆耕不輟、在生物學領域貢獻甚大，對我而言這也是專業度更高的學問，我也自認是比不上閣下對維基編寫的嚴肅態度近期還因黑歷史的碩論來源問題被抽掉一個GA。

麥克阿瑟是卡了很久的條目，在我深入去了解後才發現其西南太平洋戰略複雜的難以描述，也希望盡早將它完成。現在的用戶名稱則是因為有人向我表示太長才改掉的 囧rz……。

扯太遠了，謹祝閣下今年能牛年鴻運，萬事如意。 Aizag（留言） 2021年2月12日 (五) 21:09 (UTC)[回复]

牛年快乐！

牛年快乐！
送您一个云南特产——牛虎铜案！您过赞了，我现在觉得写条目对得起自己就好，云南有太多可以写的内容，也不知何时能沉淀足够的知识编写一省条目，我尽量。祝您来年阖家幸福、研究工作顺利、论文必过。同为异乡游子，您也保重！--河水|滇 2021年2月15日 (一) 21:52 (UTC)[回复]

给您一个星章！

作家星章
如果中文维基百科都是像阁下这样认真、勤奋、谦逊、有判断力的维基人，那该多好啊。 三猎（留言） 2021年2月16日 (二) 06:33 (UTC)[回复]

又有新的关于Letovirinae的信息

见[41]，英文维基里有人更新了。

另外，在下邮件里又发了新的subgroupA系统树和fasta文件，这次把那个鼠类大规模调查的也放进去了。--Htmlzycq（留言） 2021年3月1日 (一) 09:19 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：多謝，果然如閣下預測，更多Letovirus陸續發現了，我猜魚類和兩生類的會分別成為一物種。鼠類病毒樹看起來很完善了，abstract已寄出，就等PloS Genetics的編輯回覆（不知道大概要等多久）。
在寫ACE2的過程中，發現一篇相當重要的文章[42]，這篇的結論非常有意思（ACE2為受體的性狀在Sarbevirus為多次起源）。最重要的是他們發表了三個新的非洲蝙蝠序列，屬於"SARS-CoV-3"這支，過去這支是只有BtKY72跟BM48-31的，加上了這三個後畫出來的結果，這一支居然不再是基群，反倒是SARS-CoV-2成了基群，不知閣下怎麼看這個結果。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月3日 (三) 01:02 (UTC)[回复]
  1. 记得之前就有一个文章推测过冠状病毒利用ACE2可能是多次起源，属于趋同演化。从各个Simplot-Query图看，S基因也是突变最快的，有选择压力在。
  2. 在画鼠類的Embecovirus冠状病毒演化树过程中，感觉还是用ORF1ab的全序列最牢靠，仅仅用其中的RdRp会导致许多置信度很小的分支出现。
  3. 这篇文章中，"SARS-CoV-3"這支是虚线，估计作者也认为此条分支排序于此置信度不高吧。想来SARS-CoV 1、2、3这三支应该在很短的时间内就逐个分离出来了。

--Htmlzycq（留言） 2021年3月3日 (三) 08:18 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：確實這個clade可信度不高，這個樹是nsp12去畫的，如果拿整個ORF1ab去畫應該能有更穩定的結果。要是SARS-CoV-2真的是基群，那東洋區的地域分布與ORF8的起源都變成多次了。我個人對於為何要以ACE2為受體，而非其他千萬種膜蛋白也相當有興趣。
PloS topic投稿指示提供的email是整個PloS Genetics期刊編者的email，不是專門負責topic article的，等一兩週如果還沒有回應，感覺可以直接到英文維基聯絡那位負責topic article的用戶。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月3日 (三) 21:18 (UTC)[回复]

在下的wikidata讨论里，有人这样提问

Are you really sure that this zhwiki article describes the Hedgehog coronavirus 1, instead of the Erinaceus coronavirus? Both English and Persian Wikipedias are describing the first, not the second. --Liuxinyu970226 (留言) 01:06, 5 March 2021 (UTC)


在下是这样认为的，阁下当前的条目应该移动到刺猬冠状病毒1，目前发现的刺猬冠状病毒还只有1和HKU31两种，接下来有可能发现更多，估计可以改成穿山甲冠状病毒一类的条目。

  • @Htmlzycq：確實這裡也可以分成具體病毒株的條目，以及關於刺蝟病毒的綜述條目，研究了一下發現刺蝟冠狀病毒的多樣性很低，只有歐洲一個種，東亞一個種（這兩個發表後也只有幾個新序列陸續再發出，應該也都不是新種），都屬於Marbecovirus，倒是發現個有意思的：EriCoV從宿主那偷了一個基因過去[43]。關於條目命名，不知道Hedgehog coronavirus 1這個名字是怎麼來的（好像又是ICTV自己取的）？原始論文是叫EriCoV，HKU31的文章以全名（BetaCoV Erinaceus/VMC/DEU/2012）稱之，上面這篇剛發表的文章也是稱其為ErCoV。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月5日 (五) 20:03 (UTC)[回复]

原来是ICTV起的名字啊，就好像上次的2JL14一样，那要看接下来别人的论文引用是用EriCoV还是Hedgehog coronavirus 1了，之后再决定中文条目名要不要移动。顺便@Liuxinyu970226： --Htmlzycq（留言） 2021年3月7日 (日) 15:57 (UTC)[回复]

有点理解了，它是以每月提报的格式，把tree of life领域中，所有新条目推荐、优特评选的内容群发给这一领域的维基人。

中文可以这样：1，扩大，把生物化学与分子生物学等等内容都囊括进来，以服务更多维基人；2，改造，从Portal:生物学/新进条目入手，改造为类似这样的模式？--Htmlzycq（留言） 2021年3月8日 (一) 00:35 (UTC)[回复]

關於tree of life的Newsletter報導，中文版應該可以涵蓋所有生物學、醫學的內容（畢竟本來內容、編者都不多），以Portal:生物学/新进条目為基礎，每三個月或半年整理通過評選的生物條目，如果有題材可以寫短文介紹維基百科上生物條目的發展（例如上期英文版的報導，介紹一個存在十幾年的hoax taxon被刪除），另外專訪活躍寫作生物條目的維基人，做成像英文版一樣的Nesletter給有興趣的人訂閱。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月8日 (一) 01:55 (UTC)[回复]

加油！希望閣下與其他維基人能夠為本地維基百科新聞又添一生力軍。—— Eric Liu 創造は生命（留言．留名．學生會） 2021年3月16日 (二) 16:27 (UTC)[回复]

連Avian Coronavirus 9203都鬧雙胞

@Htmlzycq：雲南再+1[47]，此外發現了跟廣西穿山甲病毒接近的蝙蝠病毒。Fig.3A的演化樹應包含目前所有已知病毒株了。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月19日 (五) 07:39 (UTC)[回复]

谢谢，不知道在下从en:RaTG13的系统树一节整理出来的en:Template:SARS-CoV-2 related coronavirus接下来该整改成什么样的格式。--Htmlzycq（留言） 2021年3月19日 (五) 16:23 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：有點棘手，這篇文章畫出的樹形（全基因組、RdRP與ORF1ab）都與原本的差很多，廣東廣西的穿山甲冠狀病毒（加上新發現3個跟穿山甲接近的蝙蝠病毒）竟然成了單系群，或許得再過一兩年待更多病毒株發現才會有一個穩定的樹形。
剛才沒事找事，創立了Portal:病毒，不知道閣下有沒有興趣參與製作。現在英文版用的系統很方便，各欄位隨機輪播，基本上把各欄位的列表項目（比如數篇精選病毒、數篇疫情、數篇傳記、數篇療法）建好後，除新聞外不用太多後續維護，不像之前Portal:真菌那些欄位一掛就掛了快十年...--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月22日 (一) 00:53 (UTC)[回复]

之前几天生活琐事太忙了，个人电脑又送修多次，没有及时在wiki和邮件上回复阁下。看到了阁下似乎有点灰心，不过阁下已经“尽人事”了，冠状病毒也成为，这在各语言wiki都缺少生物学贡献者的情况下已经非常难得。Coronavirus in rodents阁下打算先再投PloS One试试？Wikijournal of Science又是怎么一个模式？在下不熟悉

--Htmlzycq（留言） 2021年3月24日 (三) 06:54 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：沒事，大概現實中壓力太大，而且連寫三條大篇幅的條目太累了，本來是覺得中文維基上對生物條目的關注實在太少，但冠狀病毒得以高票通過優良條目也令受到很大的鼓勵，或許大家還是喜歡看到我寫這類條目。我打算再投PloS One，不過得等我現實中的事物先緩緩。Wikijoural是維基學院自辦的一個期刊（但是正經期刊，有impact factor的，當然影響力不能跟PloS等相比），也是同行評審後發布成英文維基的條目。
Portal:病毒已經建立完成，各欄位都有10-25個不同條目可輪播展示，每幾個小時（或點擊頁面中的清除快取）便會更換。建立各欄位的過程中看了中文維基病毒條目的概況，實在是慘不忍睹，除了一些疾病條目的導言因為過去有台灣醫學計畫的人在寫，其他條目不是小作品，就是掛滿維護模板的問題條目。其實2005年左右便有一位知名維基人專司病毒條目，當年甚至連生物分類的infobox都不存在，他得自己用html畫出表格，寫作了大量病毒的條目，如今超過15年大部分條目都沒有任何改善，大都只列出過時屬名、種名就完事了；content bias也相當嚴重，人類以外的動物病毒極少，植物病毒、噬菌體跟感染其他生物的病毒基本上完全不存在（真菌病毒除外），連植物病毒都是紅連。這裡列出優特條目幾乎都是幾位維基人孤狼硬戰的成果，相關條目的質量完全不成比例。比對英文版跟德文版，真不知中文何時才能至少把基礎的條目大致都寫到丙級。--Labyrinthulomycetes🧬A virus is a piece of bad news wrapped in protein 2021年3月24日 (三) 18:17 (UTC)[回复]

在下感觉，中文维基生物條目除了人少以外，还有中文领域本身资料较少。这几天在家看马克·莱纳斯的《科学之种：我们为什么深深地误会了转基因》，顺便写了约瑟夫·谢尔等几个促进植物转基因技术早期发展的科学人物的STUB，发现被誉为“father of plant virology”的马普植物育种所的首任所长Erwin Baur（德语：Erwin Baur）连中文译名都找不到。

PS: 整合蛋白重定向到整合素的这个黑锅应该在下来背才是 囧rz……，在下13年创建整合素这个条目时，只看到有整联蛋白这个另一译名，整合蛋白通常都是指整合膜蛋白，不过不知道什么缘由，在下15年又建立了重定向到整合素的整合蛋白，在2020年整合膜蛋白建立后没有及时修正重定向。--Htmlzycq（留言） 2021年3月25日 (四) 01:23 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：許多生化分生名詞的中文翻譯相當混亂，如閣下所說，中文的生物資料太少了，或者說以中文寫成、有學術水準的生物（科學）資料太少，當我試著查詢一些生物名詞、人名卻完全找不到中文資料時，便常感嘆這某種程度上反映了中文是一種相當「落後」的語言，當然不能夠與英文這種國際通用語相比，但跟德文、法文、俄文相比也是相形見絀，我身邊的人大多認為生物專有名詞、論文翻譯成中文便難以看懂，改善這種情況也是我參與維基百科的初衷之一。
昨天寫了安尼魯·康特，病毒本身或是疾病的條目若沒有生物、醫學背景應該真的難以編寫，我認為這真的得去大學、研究機構招募更多人進來才能改善，但此類相關人物、書籍、大眾文化條目（也包括马克·莱纳斯等）應該是比較好寫的。Erwin Baur這種找不到的話可以名跟姓分開查（歐文·鮑爾），再沒有就得找外語譯音表了。--Labyrinthulomycetes🧬A virus is a piece of bad news wrapped in protein 2021年3月26日 (五) 01:06 (UTC)[回复]

与维基相关的讨论，应该通通在站内公开

认同阁下的想法，在这里“从我做起”，把邮件内容复制上来，总不能“作法不自毙”吗？隐去邮箱--Htmlzycq（留言） 2021年4月6日 (二) 08:43 (UTC)[回复]

靖天子:冠狀病毒我先提到DYK與GA了，不過尚未寫到自己心中完全滿意的程度，屆時再提至FA。最近在維基與現實上還是比較挫折的，PloS Genetics給拒了，ACE2直接提到FA評選又乏人關注，比較灰心。 时 间： 2021年03月17日 04:10 (星期三)

On Mon, Mar 8, 2021 at 10:49 PM 靖天子 wrote:

上週末我私信了Thomas Shafee，剛剛得到回覆，他說正在與其他editors商議，其他editor對主題的審核比較嚴格，必須非常切合PloS Genetics期刊收錄的範圍，讓我再等等。 期望新冠的熱點能增進他們收錄的意願，如果最後他們決定不收，Dr. Shafee建議改寫到Wikijournal of Science（他是主編），不過我計畫還是先問PloS One（這個沒有明確範圍總該收了吧）

On Mon, Mar 1, 2021 at 3:59 AM 靖天子 wrote: 感謝，這個成果跟新的Letovirus都太有意思了，於是我一不做二不休，熬夜將abstract寫完寄出（已cc閣下）

On Mon, Mar 1, 2021 at 1:16 AM htmlzycq wrote: 这次加入了Comparative analysis of rodent and small mammal viromes to better understand the wildlife origin of emerging infectious diseases那篇文章里有全基因组的


htmlzycq:感觉还是Coronavirus in Rodents要紧一些，SARSr-CoV (or SC2rCoV)感觉近一两年会有很大变化，估计现在有不知道多少个小组在华南以及东南亚寻找它们了。

最近不知道是墙还是什么原因wiki老是断，特别是在点编辑的时候，普通的浏览到还行。

彼得·R·L·布朗是在下最近在看本村陵二的《地中海世界与罗马帝国》（讲谈社世界史系列2），中译本的推荐序里将他和彼得·R·L·布朗以及玛丽·比尔德的作品《SPQR》比较，在下就看看中文维基上对这二位是否已有介绍

发现自己之前看过的纪录片《相约古罗马》就是比尔德的编剧并主持，然后发现相约古罗马、《SPQR》、玛丽·比尔德三个条目是16、18、20年由在下在内的不同维基人建立的，三者之间似没有内部链接，一笑

彼得·R·L·布朗，这个名字某种程度上也算是“原创译名”了，那位维基人移动后就更加“原创译名”了。在下不喜欢用某某某 （历史学家）这样的消歧义方式，觉得这样把人“扁平化”了，而更喜欢用中间名来为英美同名同姓人物消歧义，比如肖恩·M·卡罗尔 和 肖恩·B·卡罗尔，直到连中间名也无法消歧义

在 2021-02-25 16:45:38，靖天子 写道：


跟您確認一下，PloS Topic Article的主題，目前似乎有兩個可寫，一個是Coronavirus in Rodents, 另一個是evolution of SARSr-CoV (or SC2rCoV)，目前先詢問一個？

On Wed, Feb 24, 2021 at 5:18 PM htmlzycq wrote: 收到，谢谢，阁下辛苦了

在 2021-02-24 15:05:44，靖天子 写道：

抱歉抱歉，我看到您剛才留言才知道您有來信（不知為何被系統分到spam folder了.....） 序列我這幾天有空時找找，找到的話發給您

這幾天實驗不太順利一直耽擱.....這禮拜我便會發abstract給plot topic，屆時會cc您

On Mon, Feb 22, 2021 at 8:35 AM htmlzycq wrote: 靖天子，你好！我是HTMLZYCQ。


这边qiang好像又高了一些，维基百科又上不去了，下午上的时候试了把刚学的用MEGA画的穿山甲冠状病毒ORF1ab的树传到了维基上，但放上去之后感觉太难看了，囧


附上了mdsx文件以及做的两个图，阁下看看能不能改好看一点

zxc45那两个的没找到，RmYN02的ORF1ab在NCBI上只有片段？


最后，这是我投稿专用邮箱，给plos tropic 项目的编辑发邮件时能转我一份吗？我想看看具体的思路，找找自己能帮上忙的地方

关于冷门国家的科学家

最近继续给《科学之种》里提到的科学家消红链，在非洲那一章碰到了坦桑尼亚植物病毒学家约瑟夫·顿谷鲁，Joseph Ndunguru，抱着试试看的心态在Wikidata搜一下有没有条目，居然英文的还真有。

说实话Ndunguru这样的词，真不知道怎么发音，根据类似《病毒星球》这样的科普书写科学家小条目，一个好处是译名有来源，书中至少给出了姓氏的译名。

不用像在下当年给 John canton 编了一个“约翰·坎通”的译名，主要是各种外語譯音表中都找不到，只好自己根据发音编一个“雅”一点的了

同时在线也发现其实英文维基里 Kinvidia 等用户创建了许多非洲的学者/科学家，限于译名，没办法跟进，可惜了--Htmlzycq（留言） 2021年4月9日 (五) 04:31 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：迦納的語言契維語（Twi）簡稱tw，契維語維基百科網址是"tw.wikipedia.org"[48]，因為很多人以為是台灣版，還特地在首頁做了個橫幅請台灣用戶注意這裡不是「台灣的維基百科」，我猜這個版本的很多點閱可能都是來自台灣.....WP:外語譯音表中沒有Twi，可能可以退而求其次用同語族（大西洋-刚果语族）的Wikipedia:外語譯音表/斯瓦希里語，Nd這樣的輔音可能是翻成「恩德」，作為語言愛好者我挺想以後學一門非洲語言。
看了下這位用戶創的條目，確實都是相當有價值的內容，非洲相關內容多不受英美等主流媒體關注，非洲當地的來源網站又不穩定，實在相當難寫。--Labyrinthulomycetes🧬A virus is a piece of bad news wrapped in protein 2021年4月10日 (六) 00:40 (UTC)[回复]
（坦桑尼亞的語言是斯瓦希里語，可以直接用中文維基的外語譯音表，提到迦納是因為那位用戶是迦納人，寫的很多是迦納條目，如果能翻譯一些過來對中文維基有很大的幫助）

冠状病毒暂时没有什么建议，另外，类似于en:IL17A#Notes这里的{{Academic-written review}}是什么样一种模式？--Htmlzycq（留言） 2021年4月17日 (六) 08:44 (UTC)[回复]

日语版条目数量已经超越越南语版，即将超越瓦瑞瓦瑞语

算不算是人类维基人同机器人维基搏斗的一场胜利？开玩笑的--Htmlzycq（留言） 2021年4月23日 (五) 02:07 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：好事，但日文版的質量實在有點.....中文是不是又快被阿拉伯文超了啊，而且後面幾種語言似乎都開過機器人，會不會突然就跌出20名外了。
我打算從現在開始，將所有缺乏或仍為小作品的分子生物學的基礎條目全部掃完（User:靖天子/Molecular Biology Sweep），僅寫首段，但希望能根本地改變分生/遺傳學條目嚴重缺乏的情形。--Labyrinthulomycetes🧬 2021年4月23日 (五) 06:00 (UTC)[回复]
我前天點開了最近更改，發現日文似乎編輯頻率和我們差不多，40分鐘500筆編輯的樣子（英文是6分鐘內500筆），所以質量和中文也許半斤八兩？阿拉伯語最近沒有看到開機器人，倒是埃及阿拉伯語有人（非機器人）靠一己之力刷條目（大多為人物條目）超越中文。--Googol19980904（留言） 2021年4月26日 (一) 15:17 (UTC)[回复]
@Googol19980904：編輯深度大概跟我們差不多，但日文版專業條目的質量不怎麼樣，且一般缺乏腳註、很多條目以條列式撰寫而未組織成文，許多條目有日本中心的問題，當然這只是我偶爾點開幾條生物條目來看的印象，除英文版外質量比較好的版本我認為是德文跟俄文，特別是俄文的生物條目做得很好。閣下每天創建許多條目是很大的工作量啊，而且涉及領域很廣，我挺好奇您是怎麼挑條目來寫的，其中有許多是重要度很高的條目，例如植物病毒。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年4月27日 (二) 02:00 (UTC)[回复]
大部分都是幾句話，畢竟有些是學術類條目，我也不是那個專業的，不過翻譯條目的話看懂英文維基的首段應該沒太大問題。有總比沒有好，建好條目讓有興趣的人來擴充，畢竟很多人不會或不懂得如何創建條目。至於條目領域，那基本上就是所見即所寫。相當多的條目是來自於平時的聊天.....--Googol19980904（留言） 2021年4月27日 (二) 03:11 (UTC)[回复]
@Googol19980904：我把植物病毒給寫了，可能是我寫過條目中難度數一數二的，英文版的來源都因為過時而幾乎不能用。以後如果還有寫生物學條目，可以列入Portal:生物學/新進條目中。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年4月27日 (二) 23:36 (UTC)[回复]

惭愧，阁下把在下也列为了“一只手数得过来”的几个人之一。在下当初进入维基的初衷就是觉得中文维基分生条目太缺乏了，不过有Shakiestone建立的一系列EC模板，让在下有了先建立一系列导航模板，再根据模板一个个写条目，哪怕只写首段就好，共勉--Htmlzycq（留言） 2021年4月23日 (五) 09:25 (UTC)[回复]

日语版条目数量已经超越瓦瑞瓦瑞语版，埃及阿拉伯语版已经超越越南语版。之前看了埃及阿拉伯语版和阿拉伯语版新建的一些条目，貌似是各种人名，不知道最近埃及版新建的是什么--Htmlzycq（留言） 2021年4月29日 (四) 12:12 (UTC)[回复]

@Googol19980904：“有總比沒有好，建好條目讓有興趣的人來擴充，畢竟很多人不會或不懂得如何創建條目。”在下也是这样想的，共勉。--Htmlzycq（留言） 2021年4月29日 (四) 12:12 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：[51]"For example, Gray and his colleagues recently searched for undiscovered coronaviruses in people sick with pneumonia — and quickly found one. The team screened about 400 samples from pneumonia patients in Sarawak in Malaysia. They found at least four people infected with a new coronavirus that likely came from an animal."東洋區應該經常發生冠狀病毒（昨天發現連m6A都沒有條目，現在打到一半又發現病毒溢出都沒有條目.....我去寫好了）--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年5月3日 (一) 18:44 (UTC)[回复]

重複序列

  • @Htmlzycq：在下覺得{{重複序列}}這個模板挺怪的，首先模板把「重複序列」跟「轉座子」視為平行關系，後者應該屬於前者才對，還有把gene conversion放在interspersed repeat的子項目，據我所知interspersed repeats包含的範圍應該跟transposon是一樣的？某基因重複而發生gene conversion的情況感覺不能算是一種interspersed repeat。另外，retrotransposon跟retroposon需要分兩個條目嗎？這兩個詞應該幾乎在文獻中被當作一樣的了，英文en:retroposon提到有人把「沒有LTR的retrotransposon」（SINE跟LINE）合稱為retroposon，又有人將retroposon定義為不編碼RT的retrotransposon，沒有明確分界，寫成兩條目可能使人混淆。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年5月8日 (六) 08:16 (UTC)[回复]

真的不懂 囧rz……，transposon这一块估计是在下当初分子生物学课程上最没理解的一块内容。英文维基里较早的版本把轉座子纳入重複序列子項目的子項目。 另外，似乎是Howard Temin在区分retrotransposon跟retroposon？--Htmlzycq（留言） 2021年5月9日 (日) 09:06 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：模板我稍微改動了一下。Retrotransposon跟retroposon的區分應該因人標準不同，retroposon用的情況很少。我也覺得英文早期的版本比較合理。今天寫LTR反轉錄轉座子跟內源性反轉錄病毒讓我幾乎抓狂，文獻中混用兩者的狀況非常嚴重（例如人類的LTR-retrotransposon很多都直接被稱為retrovirus），很多文章語焉不詳（找不到夠新又夠全面的綜述文章），英文版就更是全篇迷迷糊糊，慘啊。好在剩下一條DNA transposon，等我過幾天幹掉之後這方面的基礎條目就算掃完了。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年5月9日 (日) 09:19 (UTC)[回复]

又有报道新SARS-related病毒

石正丽女士最新的BioRxiv预印本：“Identification of a novel lineage bat SARS-related coronaviruses that use bat ACE2 receptor”

报导了RaTG15等8个病毒株，是sars-1与sars-2之外的SARS-related lineage。但可惜的是，没有把肯尼亚到保加利亚的BM48-31、BtKY72那一批被我们称为“sars-cov-3”也纳入系统树（倒是纳入了ZJ2003等），所以不知道RaTG15是不是和“sars-cov-3”一支。--Htmlzycq（留言） 2021年5月26日 (三) 06:04 (UTC)[回复]

一个令人高兴的事，法语维基百科有A1AA1A等用户改进了SARS-CoV-2模板，并建立了RacCS203等多个条目--Htmlzycq（留言） 2021年5月26日 (三) 14:35 (UTC)[回复]

拿呗，就是快半年了，可能需要更新（就等那几篇BioRxiv预印本publish了）

在下想要不要先在英文里建立SARS-CoV-1 related模板，把WIV1、WIV16、HKU3、SHC014病毒--Htmlzycq（留言） 2021年6月12日 (六) 04:01 (UTC)[回复]

英文版的en:Template:SARS-CoV-1 related coronavirus已经写好了，樹形參考[54]这篇文章，顺便都放进去了英文en:Severe acute respiratory syndrome–related coronavirus条目中，还联络了法文维基的A1AA1A用户，他说下周就翻译为法语。--Htmlzycq（留言） 2021年6月13日 (日) 06:23 (UTC)[回复]

另外，还看见了用户夏瑾凉安把阁下主编的果子貍SARS冠狀病毒、鼠冠狀病毒、凯氏带搬运到了英文--Htmlzycq（留言） 2021年6月13日 (日) 06:28 (UTC)[回复]

前幾週有看到這幾篇被翻譯到英文版，挺好的，逆向輸出。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年6月13日 (日) 08:49 (UTC)[回复]

另外， Rm1 · Rf1 · Rs672 这三个病毒应该在 SARS-CoV-1 related 这个系统树的哪里？--Htmlzycq（留言） 2021年6月13日 (日) 14:52 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：抱歉忘了回，看了下SARS-1支系的樹有點棘手，每篇文章樹形都不同，比較新起且涵蓋多數病毒株的是[55]（但160B33並非基群），另外還可參考[56][57]，我感覺綜合比較之下，Rm1跟Rf1可以放在同支，Rs672應該當成{SARS, WIV1, SHC014, WIV16}的姐妹群，Rp3就更不清楚了，應該跟YNLF_31C接近，但具體位置不好說。
另外（我猜閣下也已經注意到了）很高興看到A1AA1A在法文維基也開始寫這些SARS1與2變種的條目，以及上週上線的這篇文章[58]，RpYN06相似度僅次於RaTG13，但樹形不太穩定啊，不知為何英文版模板決定把它畫成{SARS-CoV-2, RaTG13}的外群，感覺只是依照相似度數字高低排列，沒什麼依據（文章中貌似並沒有長這樣的樹）。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年6月19日 (六) 05:15 (UTC)[回复]

把RpYN06畫成{SARS-CoV-2, RaTG13}的外群是在下做的，因为RpYN06这篇文章的全基因组树形和别的文章有些不太一样，所以只能当成是外群，待进一步的文章分析吧

SARS-1支系的樹，在下都不知道怎么画了，先把16BO133和JTMC15病毒画在一起？--Htmlzycq（留言） 2021年6月19日 (六) 09:20 (UTC)[回复]

用MEGA自己画了一下SARS-1系统树

截至2021年1月 (2021-01)，SARS-CoV與相關病毒株的系統發生樹：

 
 
 
 

BtCoV HKU3 與SARS-COV相似度87.9 % · 中华菊头蝠 · 香港、中國廣東 （2004年採集、2005年發表、2010年又發表若干新病毒株）[1]

 
 

Rm1

 
 
 
 
 

Rf1 87.8 % · 马铁菊头蝠 · 中國湖北宜昌 （2004年採集、2005年發表）[2]

 
 
 

16BO133 85 % · 马铁菊头蝠 · 韓國全羅北道 （2016年採集、2019年發表）[3]

 
 

JTMC15 85 %

 
 

JL2012 85 %

 
 
 
 
 
 
 

LYRa11 90.9 % · 中菊头蝠 · 中國雲南保山 （2011年採集、2014年發表）[4]

 
 
 
 

Rp3 92.6 % · 皮氏菊头蝠 · 中國廣西南寧 （2004年採集、2005年發表）[2]

 
 

Rs672

 
 
 
 

SL-CoV YNLF_31C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中國雲南禄丰 （2013年採集、2015年發表）[5]

 
 

SL-CoV YNLF_34C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中國雲南禄丰 （2013年採集、2015年發表）[5]

 
 
 
 
 
 

SHC014 95.4 % · 中華菊頭蝠 · 中國雲南昆明 （2011年採集、2013年發表）[6]

 
 

WIV1 95.6 % · 中华菊头蝠 · 中國雲南昆明 （2012年採集、2013年發表）[6]

 
 
 

WIV16 96.0 % · 中华菊头蝠 · 中國雲南昆明 （2013年採集、2016年發表）[7]

 
 
 
 

果子貍SARS冠狀病毒 99.8 % · 果子狸 · 中國廣東[1]

 
 

SARS-CoV 100 %

 
 
 
 
 
 
 

SARS-CoV-2 79 %

 
  蝙蝠病毒
  果子狸病毒
  人類病毒 
參考文獻
  1. ^ 1.0 1.1 Xing‐Yi Ge, Ben Hu, and Zheng‐Li Shi. BAT CORONAVIRUSES. Lin-Fa Wang and Christopher Cowled (编). Bats and Viruses: A New Frontier of Emerging Infectious Diseases, First Edition.. John Wiley & Sons. 2015. 
  2. ^ 2.0 2.1 Li, W. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005, 310 (5748): 676–679. ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391. 
  3. ^ Kim Y, Son K, Kim YS, Lee SY, Jheong W, Oem JK. Complete genome analysis of a SARS-like bat coronavirus identified in the Republic of Korea.. Virus Genes. 2019, 55 (4): 545–549. PMC 7089380 可免费查阅. PMID 31076983. doi:10.1007/s11262-019-01668-w. 
  4. ^ He B, Zhang Y, Xu L, Yang W, Yang F, Feng Y; et al. Identification of diverse alphacoronaviruses and genomic characterization of a novel severe acute respiratory syndrome-like coronavirus from bats in China.. J Virol. 2014, 88 (12): 7070–82. PMC 4054348 可免费查阅. PMID 24719429. doi:10.1128/JVI.00631-14. 
  5. ^ 5.0 5.1 Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; et al. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015, 89 (20): 10532–10547. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01048-15. 
  6. ^ 6.0 6.1 Xing-Yi Ge; Jia-Lu Li; Xing-Lou Yang; et al. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature. 2013, 503 (7477): 535–8. Bibcode:2013Natur.503..535G. PMC 5389864 可免费查阅. PMID 24172901. doi:10.1038/nature12711. 
  7. ^ Yang XL, Hu B, Wang B, Wang MN, Zhang Q, Zhang W; et al. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus.. J Virol. 2016, 90 (6): 3253–6. PMC 4810638 可免费查阅. PMID 26719272. doi:10.1128/JVI.02582-15. 
  • @Htmlzycq：Good Job!這是全基因組下去畫的嗎？結果跟今年初那篇一樣16BO133不是基群，反而是HKU3、Rm1、Rf1這些相似度更高的更早分家，這點相當有意思啊，照理說16B0133、JTMC15、JL2012這幾株一來與SARS的相似度最低，二來地理上最遠（吉林與韓國，都在東洋區之外），真不知生物地理學上是怎麼演化的，可能整個東北亞還有很多不為人知的SARSr-CoV，只是過去研究者都未曾涉及，只把注意力放在華南西南一帶。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年6月21日 (一) 05:36 (UTC)[回复]


是用全基因組下去畫的，和上述还有一点点不一样，SARS-CoV与SHC014更近，WIV1和WIV16为一支，图已经发给阁下的邮箱了

16B0133、JTMC15、JL2012这一支全位于吉林與韓國，而且在下的比较显示其与SARS-CoV的相似度在85%以上，没有之前报道的82%，与之最接近的Rf1也位于“華西南”之外的湖北 --Htmlzycq（留言） 2021年6月21日 (一) 05:56 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：多謝。這個圖中的SHC014 (MT308984)是Mutant SARS coronavirus Urbani clone SARS-Urbani-MA_SHC014-spike，好像是Ralph Baric做的SARS-CoV骨架、SHC014刺突融合病毒，也就是除了spike來自SHC014之外，其他序列都是來自SARS-CoV Urbani的，不知道我的理解有沒有錯誤，可能是因此才跟SARS-CoV變成一個clade。SHC014的完整序列應該是這個：[59]
看來SARS1基部的那幾株還不是很明朗，不知道是有哪些先分出去，還是像閣下的結果這樣整支包括HKU3、160OB33、Rf1、Rm1在內都一起分出去。不知閣下有沒有看過關於冠狀病毒生物地理學的文章（我並沒有找到過），感覺是很有意思的課題。這篇顯示除吉林那株外，河北陝西山西還各有一株SARSrCoV，不知道會不會也是這一支的。看這篇文章還有幾個有趣的發現：原來台灣也發現過SARSr-CoV（CYCU‐R9/TW/2013），可惜只定了RdRp，挺好奇這一株的位置；圖中標出了南海諸島讓我一開始以為南沙上都有SARSr-CoV，仔細看才發現根本沒有....；以及陝西跟山西的英文就差多一個a。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年6月21日 (一) 23:22 (UTC)[回复]


前几天找了22个SARS-COV-1、WIV1的近源序列，用MEGA花了二十几个小时跑ALIGN，又花了十几个小时跑PHYLOGENY，结果电脑崩溃了，什么都没保存住 囧rz……

不过根据SARS-COV-1、WIV1、WIV16、SHC014这四五个的complete gemone跑的树，当前的树的这一块是对的--Htmlzycq（留言） 2021年6月25日 (五) 10:40 (UTC)[回复]

冠状病毒国际前沿研究与创新论坛

会议通知 |冠状病毒国际前沿研究与创新论坛 阁下有没有兴趣投个摘要？--Htmlzycq（留言） 2021年6月28日 (一) 16:49 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：有意思，我思考一下，您投嗎？
看了最近的條目數統計趨勢，貌似再一個月我們應該能一次超過瓦瑞瓦瑞跟越南語這兩個當年用機器人刷的版本？漏看了一個0，還早.....--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年6月30日 (三) 20:09 (UTC)[回复]

还是您来投吧，在下最近时间不多，不知阁下想要投哪个内容，可以邮箱同时发我。年初估算过中文应该2022年超过機器人--Htmlzycq（留言） 2021年7月1日 (四) 04:01 (UTC)[回复]

会议联系人刘博士刚好是在下硕士期间的同届同学，问他他说这个会相对来说还是比较开放，没那么大的难度--Htmlzycq（留言） 2021年7月1日 (四) 15:14 (UTC)[回复]

有位德语维基人问阁下一些关于Ralph S. Baric来源的问题，见在下英文的讨论页 --Htmlzycq（留言） 2021年7月1日 (四) 15:34 (UTC)[回复]

[60]这个视频的前半段是刘博士介绍自己的研究

另外，法语维基里，系统树改成了以RdRp的--Htmlzycq（留言） 2021年7月5日 (一) 05:11 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：最近也比較忙，而且沒想到有關於這個論壇五大主題的摘要，大概先不投了，關於之前被拒的那個「鼠類冠狀病毒」，在下還是想等有空時（估計年底）試試看PloS One的Topics Article。這幾天有空時我得趕緊去回覆那位德語維基人，以及更新Baric的條目。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年7月5日 (一) 09:46 (UTC)[回复]

辛苦！--Htmlzycq（留言） 2021年7月5日 (一) 10:34 (UTC)[回复]

[61] Susan R. Weiss的讲课视频，有中译--Htmlzycq（留言） 2021年7月20日 (二) 07:04 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：多謝分享，以前聽他的演講有提到自己做的領域過去都乏人問津（類似Baric實驗室本來都要倒了），他都打算退休，但去年時勢造英雄，一夕爆紅，發覺大家都開始重視他做的東西 囧rz……。這系列課程是專門開給中國觀眾的嗎？
我挺推薦This Week in Virology，很好的節目，深入淺出，特別有幾集講病毒起源、駁斥實驗室洩漏說的。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年7月24日 (六) 06:16 (UTC)[回复]

那应该是宾夕法尼亚大学的公开课程，不是專門開給中國觀眾的，Susan R. Weiss是讲者之一，刚好第六讲第七讲是她，我看着名字这么熟悉，想起阁下写过她的条目，就转过来了，应该还有后续，中文还没译全，说实话，这译者还是比较搞怪的 --Htmlzycq（留言） 2021年7月24日 (六) 09:16 (UTC)[回复]

《維基人》2021年3月 第十四期

給您的星章！

作家星章
感謝您接受《維基人》的採訪！—— Eric Liu 創造は生命（留言．留名．學生會） 2021年3月2日 (二) 15:24 (UTC)[回复]

Re:ACE2已經寫完

謝謝祝福。

謝謝有關ACE2的編輯, 等我看完後, 可以提供生物非專業人士的意見。--Wolfch (留言) 2021年3月4日 (四) 06:31 (UTC)[回复]

有關首段的「SARS-CoV與SARS-CoV-2和ACE2結合的能力應為多次起源，可能與病毒的重組有關。」,　不太清楚「多次起源」意思，意思是這些病毒在發展過程中, 各因為不同的原因而發展了和ACE2結合的能力嗎？--Wolfch (留言) 2021年3月4日 (四) 09:44 (UTC)[回复]
@Wolfch：我做個比喻（實際情況更複雜，我假想一個比較單純的情況），假設一個家族有10種病毒，都是從同一個祖先所衍生而成，這10種病毒都可以與ACE2結合，那很可能這10種病毒的共同祖先也是能與ACE2結合的（或者這個共同祖先不能與ACE2結合，10種病毒是各自分別獲得這樣的能力，但這個機率就比前者低許多）；假如有9種病毒可以和ACE2結合，1種不行，那麼有兩種可能：10種病毒的共祖可以與ACE2結合，但有1種自己喪失了這個能力，或者共祖不能與ACE2結合，有9種病毒分別各自獲得這個能力（機率比前著低很多）；假如是只有2種病毒可與ACE2結合，另外8種不行，那就比較可能是共祖不能與ACE2結合，這2種病毒是後來各自獲得了結合力（另一種情況是共祖可與ACE2結合，但有8種病毒都喪失了結合力，但機率就低許多）
SARS-CoV和SARS-CoV-2就接近上面的第三種情況，它們與ACE2結合的能力應該是趨同演化的結果，所以說是多次起源的。所以「這些病毒在發展過程中，各發展了和ACE2結合的能力」是對的，但「原因」應該是一樣的（為了感染細胞）--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月4日 (四) 10:13 (UTC)[回复]
說明的很清楚，謝謝，我想一下有沒有其他的詞可以代替「多次起源」。--Wolfch (留言) 2021年3月4日 (四) 10:42 (UTC)[回复]
@Wolfch：我稍微改寫了這句話，去掉了「多次起源」。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月4日 (四) 19:03 (UTC)[回复]

Re:‎Portal:病毒

謝謝您對醫學翻譯計劃的肯定，我會將訊息轉給計劃的負責人，謝謝您。--Wolfch (留言) 2021年3月22日 (一) 23:32 (UTC)[回复]

有關醫學翻譯計劃貢獻，又有提報過DYK的病毒相闗條目, User:Koala0090提供的資料如下：

  • 醫學翻譯計劃曾在2015年擴充過流行性感冒條目，之後在2017年提報過DYK, 同年也通過優良條目和典範條目評選。
  • 普通感冒條目在2012年曾經DYK通過，醫學翻譯計劃後來也在2018年擴充過普通感冒條目（因此DYK的版本和醫學翻譯計劃沒有什麼關係）

不過上述條目都是和病毒有關疾病的條目，不是介紹病毒的條目，不知是否符合portal:病毒的需求？謝謝 --Wolfch (留言) 2021年3月23日 (二) 08:54 (UTC)[回复]

Re

术业有专攻而已。

长期以来研究数理化生医学的文献资料绝大多数是英语文献，甚至日语文献都远远超出汉语数倍。

人的精力有限，钻研这些学科的同时做不到仔细衡量汉语措辞，往往只能按英语用词习惯来写，写出来的姑且算“科学式”汉语吧。然而汉语就是汉语，之所以有科学式汉语，不过是汉语没学到家只用根据英语、口语生造措汇乃至句式。

举个可能很多人会觉得不可思议的例子。查教授的小说我觉得很了不起，这不仅是因为情节、想象，更是文笔。从《越女剑》到《鹿鼎记》，全书没有“进行”，没有“XX性”，没有“在少林寺”这类开头，也没有“最XXX之一”，甚至完全没有“之一”，没有“主义”，没有“作出了很大的贡献”，没有“成功”。很多人会认为这是学科差异，我不觉得，我觉得这是汉语学没学到家的问题。

只举一例，汉语本来连男女都不分，哪来的性。但科学界写文章，世间万物的所有特点就像电脑文件“属性”选项，有数以万计的复选框一个个选就行，似乎汉语原有的形容词不管用，其实都是没学到。“永久居民身份证”，“永久”是形容词，形容后面的居民身份证非常通顺，便要故做姿态写成“永久性居民身份证”；某种疾病会传染，非要说某种疾病“有传染性”，传染病要叫“传染性疾病”，极易传染、容易传染、不易传染、不传染，偏要写成“传染性极强、传染性很强、传染性不强、传染性为零”，似乎这样就更有“科学性”般。流行感冒要叫“流行性感冒”，很专业要说很有专业性；他的看法、建议言之有物、脚踏实地、一针见血、说到点子上……非要说“很有建设性”；不可能、可能、有可能、很可能就显得“不科学”，要改成“可能性为零（没有这个可能性）、有这个可能性、可能性很大”，“纪念建筑”非要写“纪念性建筑物”。总而言之，除“性别”、“个性”这类辞汇，汉语稍算入门的都不会写出XX性这种词。

极力建议参考余光中的《中文的常态与变态》，我的总结还远不如他全面。

当然，我上述的看法估计只对大陆人有意义，因为就我的观察不管香港还是台湾，在这方面做法相反。

最后重申，这只是术业有专攻，能在数理化生医领域贡献，汉语学不到家又有什么要紧，再说我也没见过这些领域年轻一代的专业人士有谁在乎。--7（留言） 2021年3月28日 (日) 03:01 (UTC)[回复]

评论得好！身为台湾人，常觉得对汉语的无力！但，先不论政策面，光就自小学习开始，就肩负学汉英两种语言的负担，更何况汉语的语法，个人觉得大家并不重视，实在难以回天！再者，汉语也是有其缺陷的，只能靠政策逆转其弱点，就如1920年发布的《通令采用新式标点符号文》。 --yyfroy 2021年4月17日 (六) 05:30 (UTC)

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作家星章
了不起的創作！ yyfroy 2021年4月17日 (六) 04:57 (UTC)

卡氏帶

靖天子您好，許久不見，感謝您一直以來對生物條目的無私貢獻。想請問，您最新提報DYK的卡氏帶發育段落的第二段第一句寫到「卡氏帶蛋白蛋白為膜蛋白」，請問這是單純的冗字嗎？因為不知道原本想表達什麼所以我沒有動他。--Yrr933!(留言) 2021年4月17日 (六) 14:20 (UTC)[回复]

@yrr933!：好久不見！是的，多了蛋白二字，感謝您指出。很高興看到您又開始編輯，且正就讀微免生藥相關的科系，都十年了.....最近有打算寫作哪些條目嗎？--Labyrinthulomycetes🧬A virus is a piece of bad news wrapped in protein 2021年4月17日 (六) 18:12 (UTC)[回复]

送您的腺嘌呤核苷三磷酸

送您的腺嘌呤核苷三磷酸
为您对科学条目的热忱和毅力。 安忆Talk 2021年6月11日 (五) 04:42 (UTC)[回复]

能否帮助改善条目吐鲁番花条蛇

您好呀，我在试着写新发现的物种吐鲁番花条蛇（User:HaziiDozen/沙盒/4），但不确定二名法定名人的部分是不是这么写。对条目内容我也不是很自信是否概括全面了。希望能得到帮助，如果有错误或者遗漏请告诉我或者直接修改都可以。谢谢～～～🙏🙏--认为久坐对腰不好并强烈建议大家躺着编辑维基百科的HaziiDozen（留言） 2021年6月16日 (三) 08:33 (UTC)[回复]

同行评议邀请（？） 腺相关病毒

您好，我最近尝试写了一下腺相关病毒，但毕竟隔行如隔山，我现在（包括过去）研究的方向和病毒学相去甚远，因此觉得条目质量很一般。如果您有兴趣，是否愿意提一些建议，做一些改善呢？--クオン·千の海を越えて·残夢 2021年7月9日 (五) 12:40 (UTC)[回复]

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不倦星章
編輯維基百科條目的過程往往既孤獨又繁瑣，許多人有知識、能力卻未必有心力持續奉獻，而您卻長期持續為生物學領域條目做出貢獻。謹此表達欽佩之意。 燈火闌珊處（留言） 2021年7月13日 (二) 08:51 (UTC)[回复]

请问如何分辨Ganoderma lucidum与Ganoderma lingzhi的幼小子实体？

靖天子您好！2012年的一篇文献(Cao, Y., Wu, S. H., & Dai, Y. C. (2012). Species clarification of the prize medicinal Ganoderma mushroom “Lingzhi”. Fungal Diversity, 56(1), 49-62.)认为，原产于中国的灵芝与作为灵芝属模式种的亮盖灵芝（ Ganoderma lucidum ）并非同一物种，应当单独定种为Ganoderma lingzhi 。文章还提到Ganoderma lingzhi 成熟子实体的菌管口显黄色，而产自欧洲的Ganoderma lucidum 菌管口为白色；但是否有通过观察区分两者的幼小子实体的方法？

以及如果可以，请问您可否帮助分辨该幼小灵芝子实体属于何种(2021.6.8摄于北京大学镜春园)？

十分感谢！

--TheWindGrahame（留言） 2021年8月3日 (二) 10:28 (UTC)[回复]

  • @TheWindGrahame：讀了這篇文章，另外找到這篇[62]，好像都沒有提到區分幼小子實體的方法，兩者外形太接近，要成熟後才可勉強區分（菌孔顏色、形狀、子實體上有黑色條帶與否）。不過既然是在北京大學看到的，我猜是G. lingzhi的機率比較大？G. lingzhi主要分布於亞洲，G. lucidum主要分布於歐洲，但是中國也有G. lucidum（原本被歸為G. tsugae，但Cao 2012已將G. tsugae處理成G. lucidum的異名），所以不能完全肯定是G. lingzhi。--Mesomycetozoea🧬 2021年8月4日 (三) 05:48 (UTC)[回复]
  • @靖天子：谢谢！另外还请问五棱散尾鬼笔（Lysurus mokusin）与中华散尾鬼笔（Lysurus mokusin f. sinensis（Lloyd）Kobayasi）的区分？英文Wiki那边给出的是中华散尾鬼笔“ having a head that was more angular and conical at the top”（更棱角分明，顶部显圆锥形）因为没有查到原文献（英文Wiki那边给的 Kobayasi Y. (1938). "Hymenogastrineae et Phallineae". In Nakai T, Honda M (eds.). Nova Flora Japonica. Tokyo, Japan: Sanseido Co. p. 52.）所以不太理解......TheWindGrahame（留言） 2021年8月8日 (日) 16:13 (UTC)[回复]
  • @TheWindGrahame：那份文獻是日文的（小林義雄. ヒメノガスター亜目及スツポンタケ亜目. 大日本植物誌. 東京: 三省堂. 1938 （日语）. ）確實網路上找不到。英文版條目中引的另一個文獻Seok 2005則說

This taxa is very similar to Lysurus mokusin Fr. f. mokusin, but different from it in having the longitudinal angular-conic top of head."

另外查到另一份中文文獻（图力古尔、李玉. 吉林省担子菌补记(四). 吉林农业大学学报. 2003, 25 (1): 41-44. ），其中提到

本种有时作为Lysurus mokusin (Pers.)Fr.的变型, 即Lysurus mokusin (Pers.)Fr.f. sinensis(Lioyd)Kobayasi , 与原变型L.mokusin (Pers.)Fr. f.mokusin 的区别在于后者头部的爪形托臂不结合形成尖细的咀。也有人主张将L.sinensis 合并到L.mokusin 中

這樣看來，兩者的差別非常微小，僅是鬼筆頂部的形狀稍有差異（「嘴」的有無），加上鬼筆分類混亂，異名極多，中华散尾鬼笔是否真為有效分類（單系群）也未可知。
這篇條目的英文版質量不錯，篇幅也不長，要不要把它翻譯過來？（只有一個小問題，英文版說中國僅福建有分布，實際上中國各地均有分布，例如上述的吉林）--Mesomycetozoea🧬 2021年8月12日 (四) 02:40 (UTC)[回复]
@靖天子 或许我可以尝试一下？最近总算也有些时间--TheWindGrahame（留言） 2021年8月16日 (一) 06:09 (UTC)[回复]

Wikipedia:典范条目评选/提名区#紫式部

我已經再修改好了，不知道閣下有沒有再看一次？我至少想有個回應。SANMOSA Σουέζ 2021年8月4日 (三) 08:31 (UTC)[回复]

中文版离越南语版条目数量差距不到5万了

这个暑假里，中文版条目数量平均日增300+，另外，瑞典语版条目数量从原300多万下跌到298万了，阁下知道怎么回事吗？ --Htmlzycq（留言） 2021年8月9日 (一) 00:22 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：瓦瑞是不是也有掉？難不成他們良心發現開始清掃那堆垃圾物種條目了......基金會有沒有工具可以看各語言條目數每天的增長情形？
閣下參加幾天後舉行的線上Wikimania嗎--Mesomycetozoea🧬 2021年8月12日 (四) 03:01 (UTC)[回复]

在下找了这个页面的编辑历史，瑞典语版是从去年年中373万开始缓慢下跌的，一年来下跌了75万多，估计是瑞典语维基人在手动提删吧；宿务语还在上升，有可能突破600万；瓦瑞语没有往下掉，不过中文版快超过他了。線上Wikimania估计参加不了，在下这里老是掉线 囧rz……--Htmlzycq（留言） 2021年8月12日 (四) 05:11 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：宿务语好像也就一個禮拜多個一兩篇條目吧。瑞典语雖然機器刷了不少條目，但有些知識類的條目還是蠻全的。--Googol19980904（留言） 2021年8月13日 (五) 04:11 (UTC)[回复]
@Htmlzycq：摸索了一下線上Wikimania實在很難參加.....不過演講影片都上傳到Youtube了，可以慢慢欣賞（有幾個人講的挺有意思的）--Mesomycetozoea🧬 2021年8月15日 (日) 19:58 (UTC)[回复]

有关于Transposable element的讨论

见en:User_talk:Evolution_and_evolvability#Transposable_element，另外，7-8月间有英文用户创建了冠状病毒S蛋白在内的多个条目，见en:Template:Coronavirus genomes

@Htmlzycq：厲害，都是同一位維基人寫的，而且內容都相當豐富，SMEN這四種蛋白都挺難寫的，我僅在主條目冠狀病毒中介紹（包括5'與3'UTR），我倒是曾想過寫ORF3與ORF8這兩種對冠狀病毒致病、免疫非常重要的蛋白，這兩篇目前英文版沒有，估計那位維基人很快也會寫到。
但是這個模板有一個問題，nonstructural protein X在這裡看起來是指輔助蛋白（ORF1a/b與SMEN以外的其他蛋白），只列到ns8，但容易與ORF1a/b編碼的14種蛋白（也稱為ns）混淆，改稱ORFX比較妥當。可能還有因命名未統一而產生的連結問題，例如ORF3b（英语：ORF3b），英文版已經有條目了，模板中的nonstructural protein 3卻仍是紅字。另一點是這些輔助蛋白在不同冠狀病毒的種類與數目經常不同，不同屬冠狀病毒中名為ORF3的蛋白可能是完全不同的，可能僅能稱為ORF3b in SARS-like coronaviruses，而不能稱為Coronavirus ORF3b（但即使是SARS-like coronavirus輔助蛋白也可能有異，例如ORF8可能分成8a與8b兩個ORF，或者僅有一個完整的ORF），這裡命名不好處理，我猜那位維基人可能是因此而暫時止步於結構蛋白。--Mesomycetozoea🧬 2021年9月3日 (五) 06:36 (UTC)[回复]

96.8%

是在下根据新闻添加的，，不过似乎学界对全基因组相似度不太关心了，更关心RdRP的相似度，比如法文维基的编者已经把SARS-CoV-2树改成了基于RdRP的树。在下一直有一个想法，就是一模板多用，比如:

{{SARS-CoV-2 related coronavirus|whole}} 用于展示基于全基因组的树

{{SARS-CoV-2 related coronavirus|Orf1ab}} 用于展示基于Orf1ab的树

{{SARS-CoV-2 related coronavirus|RdRP}} 用于展示基于RdRP的树

{{SARS-CoV-2 related coronavirus|Spike}} 用于展示基于S基因的树

不过没时间做。--Htmlzycq（留言） 2021年10月31日 (日) 11:12 (UTC)[回复]

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立陶宛星章
感謝閣下對本次「立陶宛感謝祭」線上編輯松的踴躍貢獻！希望未來閣下能秉持此般熱忱，持續貢獻維基百科。祝　編安！-Peacearth（留言） 2021年8月25日 (三) 01:25 (UTC)[回复]

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编辑星章
感謝靖天子的勉勵和提醒，使條目「紅槍會」有所改善。先生的認真精神值得所有維基人效法。 Banyangarden（留言） 2021年9月18日 (六) 06:38 (UTC)[回复]

能擴充艾恩宏嗎?

[63]，因也與立陶宛與台灣關係有關。--Outlookxp（留言）

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