Rm1病毒

Rm1病毒
病毒分类
（未分级）：	病毒 Virus
域：	核糖病毒域 Riboviria
界：	正核糖病毒界 Orthornavirae
门：	小核糖病毒门 Pisuviricota
纲：	小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目：	套式病毒目 Nidovirales
科：	冠状病毒科 Coronaviridae
属：	乙型冠状病毒属 Betacoronavirus
亚属：	SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus
种：	Rm1病毒 SARSr-CoV
毒株：	Rm1病毒 Rm1

蝙蝠冠状病毒Rm1（Bat SARS CoV Rm1/2004）是严重急性呼吸系统综合症相关冠状病毒（SARSr-CoV）的一个病毒株，为SARS-CoV相关病毒，在中国湖北的大耳菊头蝠样本中发现，于2005年发表。

发现

2004年3月至11月，研究人员在中国广东、天津、广西与湖北四省市采集蝙蝠样本，在湖北宜昌皮氏菊头蝠的粪便样本中发现SARS相关病毒，即Rm1病毒，于2005年和Rf1病毒与Rp3病毒一起发表^[1]。

基因组

Rm1病毒的基因组长29749nt^[2]，序列与SARS-CoV的相似度为88.2%^[3]，其ORF8和人类以外的大多数SARSr-CoV一样有一段长29nt的插入序列，为一完整的开放阅读框，人类的ORF8则因缺少此序列而被分成8a与8b两个较小的开放阅读框。Rm1的ORF8（121个氨基酸）比人类SARS病毒ORF8辅助蛋白（121个氨基酸）少一个氨基酸，且两者氨基酸序列相似度仅35%^[1]。另外Rm1与许多蝙蝠SARSr-CoV一样在刺突蛋白的受体结合结构域（receptor binding domain, RBD）有两段分别长5和12个氨基酸的序列缺失（但不见于WIV1病毒与SHC014病毒）^[4]。

参考文献

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^ Bat SARS coronavirus Rm1, complete genome. NCBI. [2021-01-28]. （原始内容存档于2021-04-13）.
^ Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; Wu, Li-Jun; Ge, Xing-Yi; Zhang, Yun-Zhi; Daszak, Peter; Wang, Lin-Fa; Shi, Zheng-Li; Perlman, S. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. Journal of Virology. 2016, 90 (6): 3253–3256. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02582-15.
^ Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; et al. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015, 89 (20): 10532–10547. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01048-15.

[Li2005-1] 1.0 ^1.1 Li, W. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005, 310 (5748): 676–679. ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391.

[2] Bat SARS coronavirus Rm1, complete genome. NCBI. [2021-01-28]. （原始内容存档于2021-04-13）.

[YangHu2016-3] Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; Wu, Li-Jun; Ge, Xing-Yi; Zhang, Yun-Zhi; Daszak, Peter; Wang, Lin-Fa; Shi, Zheng-Li; Perlman, S. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. Journal of Virology. 2016, 90 (6): 3253–3256. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02582-15.

[LauFeng2015-4] Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; et al. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015, 89 (20): 10532–10547. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01048-15.

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