BM48-31病毒 (BtCoV/BM48-31/Rhi bla/Bulgaria/2008;BM48–31/BGR/2008)是严重急性呼吸系统综合症相关冠状病毒 (SARSr-CoV)的一个病毒株,在保加利亚 布腊氏菊头蝠 的粪便样本中发现,其基因组 已被完整定序,于2010年发表[ 1] 。
发现
2008年,研究人员在保加利亚 各地采集蝙蝠粪便样本,经序列分析后发现多种冠状病毒病毒株,其中属于SARSr-CoV 的可分为两支,一支皆感染地中海菊头蝠 ,另一支则包含感染布腊氏菊头蝠 、马铁菊头蝠 与西班牙菊头蝠 的病毒株,有一布腊氏菊头蝠的病毒株被完整定序,即为BM48-31病毒[ 1] 。
BM48-31病毒的基因组 长29276nt [ 2] ,与其他SARSr-CoV相较之下,此病毒株缺乏ORF8 (2019年发表的肯亚BtKY72病毒 亦不具有ORF8[ 3] ),另外此病毒株的ORF3b和其他蝙蝠SARSr-CoV的一样比SARS病毒 的短,不过相较于Rf1 等蝙蝠病毒ORF3b胺基酸 序列和SARS病毒的相似度超过90%,BM48-31病毒ORF3a胺基酸序列和SARS病毒的相似度仅有约45%[ 1] 。
分类
种系发生学 研究结果显示BM48-31病毒与BtKY72病毒 组成一个演化支 ,两者基因组序列相似度为81%[ 3] ,此演化支是SARSr-CoV 演化树的基群 ,与其他SARSr-CoV分家早于SARS-CoV 和SARS-CoV-2 分家的时间[ 4] [ 5] 。
参考文献
^ 1.0 1.1 1.2 Drexler JF, Gloza-Rausch F, Glende J, Corman VM, Muth D, Goettsche M; et al. Genomic characterization of severe acute respiratory syndrome-related coronavirus in European bats and classification of coronaviruses based on partial RNA-dependent RNA polymerase gene sequences. . J Virol. 2010, 84 (21): 11336–49. PMC 2953168 . PMID 20686038 . doi:10.1128/JVI.00650-10 .
^ Bat coronavirus BM48-31/BGR/2008, complete genome . NCBI . [2021-02-21 ] . (原始内容存档 于2022-03-29).
^ 3.0 3.1 Tao Y, Tong S. Complete Genome Sequence of a Severe Acute Respiratory Syndrome-Related Coronavirus from Kenyan Bats. . Microbiol Resour Announc. 2019, 8 (28). PMC 6624766 . PMID 31296683 . doi:10.1128/MRA.00548-19 .
^ Lu R, Zhao X, Li J, Niu P, Yang B, Wu H; et al. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. . Lancet. 2020, 395 (10224): 565–574. PMC 7159086 . PMID 32007145 . doi:10.1016/S0140-6736(20)30251-8 .
^ Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2. . Nat Microbiol. 2020, 5 (4): 536–544. PMC 7095448 . PMID 32123347 . doi:10.1038/s41564-020-0695-z .