核糖核酸外切酶
核糖核酸外切酶(Exoribonucleases)是核糖核酸(RNA)的外切酶,是一種能降解RNA,並將5'端或3'端的核苷酸移除的酶。能移除5'端核苷酸的這種酶稱作「5'-3'核糖核酸外切酶」,而能移除3'端的則稱作「3'-5'核糖核酸外切酶」。
此類酶有兩種機理,分別是以水(水解活性)或以無機磷酸鹽(磷酸解活性)去破壞RNA上的核苷酸-核苷酸鍵。水解核糖核酸外切酶分類在EC3.1中,因以水去降解RNA,因此生成單磷酸核苷;而以無機磷酸鹽降解的則因有外在磷酸鹽加在生成分子上,因此形成二磷酸核苷。
核糖核酸外切酶存在於所有生命的界別中,包括細菌、古菌及所有真核生物。能對不同類別的RNA種類作用,包括信使RNA、tRNA、核糖體RNA及微RNA。核糖核酸外切酶可簡單如單個蛋白質分子的(如核糖核酸酶D和核糖核酸酶PH),亦可以複雜至包含多個蛋白質分子的外切體複合物(當中包括核糖核酸外切酶的四個家族)。
主要家族
家族 | 成員例子 | 分佈 | 催化活性 |
---|---|---|---|
RNR | 核糖核酸酶R | 部分細菌及所有真核生物 | 3'-5'水解 |
核糖核酸酶II | |||
Rrp44 | |||
DEDD | 核糖核酸酶D | 部分細菌及所有真核生物 | 3'-5'水解 |
核糖核酸酶T | |||
PM/Scl-100 | |||
寡核苷酸酶 | |||
RBN | RNase BN | 部分細菌 | 3'-5'水解 |
PDX | PNPase | 所有界 | 3'-5'磷酸解 |
PM/Scl-75 | |||
核糖核酸酶PH | |||
RRP4 | Rrp4 | 所有真核生物及大部分古菌 | 3'-5'水解 |
5PX | 核糖核酸外切酶I | 所有真核生物 | 5'-3'水解 |
核糖核酸外切酶II |
參考文獻
- Zuo Y, Deutscher MP. Exoribonuclease superfamilies: structural analysis and phylogenetic distribution. Nucleic Acids Res. 2001, 29 (5): 1017–26. PMC 56904 . PMID 11222749. doi:10.1093/nar/29.5.1017.