RecBCD
RecBCD是大腸桿菌體內用來起始DNA同源重組的蛋白質。由3個不同的亚基所組成,分別是RecB、RecC與RecD(這些名稱也可用來表示轉錄出這些蛋白質的基因)。其中RecB與RecD是解旋酶。
RecBCD同時也作為模式酵素,用來當作實驗中所使用的單分子螢光(single molecule fluorescence),以了解蛋白質與DNA的交互作用。
RecBCD路徑
RecBCD途径(RecBCD pathway)是許多生物進行同源重組(homologous recombination)時所用的生化路徑之一。此過程的開端是起於RecBCD蛋白質與脱氧核糖核酸雙螺旋相接,並利用自身的DNA解旋酶(DNA helicase)使脱氧核糖核酸上的「Χ site」(chi site)部分(一段以5'-GCTGGTGG-3'排列而成的序列)分成兩股,產生一個單股的脱氧核糖核酸末端。
接著RecA蛋白質與SSB就能將這段脱氧核糖核酸末端(3'端)包覆。接著RecA會使末端侵入另一段雙股DNA,並搜尋同源區段。當找到同源區段時,就會使被侵入的脱氧核糖核酸生成D环,然後其中一端斷裂。這時就會有兩段脱氧核糖核酸各自有一條斷裂的末端,此末端將會靠近另一段脱氧核糖核酸。
DNA連接酶(DNA ligase)再將兩條斷裂的脱氧核糖核酸黏合,產生霍利迪交叉。然後受到RuvA與RuvB蛋白的影響產生branch migration,最後完成脱氧核糖核酸的重組。
參考文獻
- Singleton MR, Dillingham MS, Gaudier M, Kowalczykowski SC, Wigley DB, "Crystal structure of RecBCD enzyme reveals a machine for processing DNA breaks",Nature. (2004) Nov 11; 432 (7014): 187-93.
- Robert F. Weaver. Molecular biology 3rd edition. McGraw-Hill. ISBN 0-07-284611-9.