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核糖核酸外切酶

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RNA分別透過水解(左方)和磷酸解(右方)的3'端解解反應簡圖。

核糖核酸外切酶(Exoribonucleases)是核糖核酸(RNA)的外切酶,是一種能降解RNA,並將5'端3'端核苷酸移除的酶。能移除5'端核苷酸的這種酶稱作「5'-3'核糖核酸外切酶」,而能移除3'端的則稱作「3'-5'核糖核酸外切酶」。

此類酶有兩種機理,分別是以水(水解活性)或以無機磷酸鹽(磷酸解活性)去破壞RNA上的核苷酸-核苷酸鍵。水解核糖核酸外切酶分類在EC3.1中,因以水去降解RNA,因此生成單磷酸核苷;而以無機磷酸鹽降解的則因有外在磷酸鹽加在生成分子上,因此形成二磷酸核苷

核糖核酸外切酶存在於所有生命的界別中,包括細菌古菌及所有真核生物。能對不同類別的RNA種類作用,包括信使RNAtRNA核糖體RNA微RNA。核糖核酸外切酶可簡單如單個蛋白質分子的(如核糖核酸酶D核糖核酸酶PH),亦可以複雜至包含多個蛋白質分子的外切體複合物(當中包括核糖核酸外切酶的四個家族)。

主要家族

家族 成員例子 分佈 催化活性
RNR 核糖核酸酶R 部分細菌及所有真核生物 3'-5'水解
核糖核酸酶II
Rrp44
DEDD 核糖核酸酶D 部分細菌及所有真核生物 3'-5'水解
核糖核酸酶T
PM/Scl-100
寡核苷酸酶
RBN RNase BN 部分細菌 3'-5'水解
PDX PNPase 所有界 3'-5'磷酸解
PM/Scl-75
核糖核酸酶PH
RRP4 Rrp4 所有真核生物及大部分古菌 3'-5'水解
5PX 核糖核酸外切酶I 所有真核生物 5'-3'水解
核糖核酸外切酶II

參考文獻

外部連結

參見