麻雀冠状病毒HKU17
麻雀冠状病毒HKU17 | |
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病毒分类 | |
(未分级): | 病毒 Virus |
域: | 核糖病毒域 Riboviria |
界: | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
门: | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
纲: | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
目: | 套式病毒目 Nidovirales |
科: | 冠状病毒科 Coronaviridae |
属: | 丁型冠状病毒属 Deltacoronavirus |
种: | 麻雀冠状病毒HKU17 SpCoV HKU17
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麻雀冠状病毒HKU17(sparrow coronavirus HKU17、SpCoV HKU17)是丁型冠状病毒属的一种病毒,在香港的麻雀身上发现,于2012年由香港大学研究团队发表。此病毒与猪丁型冠状病毒(PdCV)和鹌鹑冠状病毒HKU30(QuaCoV UAE-HKU30)的复制酶保守区域的氨基酸序列相似度高于90%,显示三种病毒应为同一物种的不同亚种[1][2]。
基因组
麻雀冠状病毒HKU17的基因组约长26000nt,编码冠状病毒皆有的复制酶(1ab)以及刺突蛋白(S)、外膜蛋白(sM)、膜蛋白(M)与衣壳蛋白(N)等四种结构蛋白,另有6、7a、7b与7c等四个开放阅读框编码辅助蛋白,其基因顺序为1ab-S-E-M-6-N-7a-7b-7c,其中7a位于衣壳蛋白的开放阅读框内,7b与7c则位于其下游(即基因组的最3端)[2]。
参考文献
- ^ Woo, P. C. Y.; Lau, S. K. P.; Lam, C. S. F.; Lau, C. C. Y.; Tsang, A. K. L.; Lau, J. H. N.; Bai, R.; Teng, J. L. L.; Tsang, C. C. C.; Wang, M.; Zheng, B.-J.; Chan, K.-H.; Yuen, K.-Y. Discovery of Seven Novel Mammalian and Avian Coronaviruses in the Genus Deltacoronavirus Supports Bat Coronaviruses as the Gene Source of Alphacoronavirus and Betacoronavirus and Avian Coronaviruses as the Gene Source of Gammacoronavirus and Deltacoronavirus. Journal of Virology. 2012, 86 (7): 3995–4008. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.06540-11.
- ^ 2.0 2.1 Lau, Susanna K. P.; Wong, Emily Y. M.; Tsang, Chi-Ching; Ahmed, Syed Shakeel; Au-Yeung, Rex K. H.; Yuen, Kwok-Yung; Wernery, Ulrich; Woo, Patrick C. Y.; Gallagher, Tom. Discovery and Sequence Analysis of Four Deltacoronaviruses from Birds in the Middle East Reveal Interspecies Jumping with Recombination as a Potential Mechanism for Avian-to-Avian and Avian-to-Mammalian Transmission. Journal of Virology. 2018, 92 (15). ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.00265-18.