使用者:EzrealChen/備用沙盒63
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第3使徒是由庵野先提出草案，再由漫畫家鬼頭莫宏設計。庵野表示，設定上這支使徒被人類捕獲、解體、分析、嚴格保存，所以外觀的形象就定調為巨大生物的骨骼標本[1]。庵野欣賞鬼頭在《星星公主》中的設計美學，於在2006年底找鬼頭來擔當這份工作，鬼頭完成設計之後，就不再參與其中[2]。最終成品和庵野的草案大致相同，鬼頭自認沒有做太多設計[2]。因為想在序幕中上演全CG的戰鬥，第3使徒是以CG呈現為前提所設計的[1]。又因為沒有類似腳的東西的話就沒有在走的感覺，所以就附上了小小的腳[1]。
因為2號機的作畫很費工，第7使徒一開始就被安排要用CG呈現[1]。庵野在很早的時候請okama來設計一些自由點子，但後來因為庵野忙於《序》的工作，第7使徒就先擱置[1]。回到《破》的製作後，庵野請教該戰鬥橋段的負責人小松田大全有何意見，並表示即使要改動到分鏡稿也無妨。小松田與小山重人提出「飲水鳥」點子[1]，獲得庵野許可後，設計工作交由小山負責[3]。小山根據先前研究成田亨和庵野作品的經驗，想出使徒應有的兩個設計要素：「直線和幾何形狀」和「包含三角形和六角形」，此外還加上「超越人類智慧的行動方式」[3]。庵野建議小山參考大阪萬博東芝IHI館的意象，讓小山靈光一閃[3]。此外，小山採用與TV版相去不遠的風格，使徒臉部類似淺利義遠的設計，並將主色定為黑白、強調色定為紅色[3]。小山表示，這是為了讓觀眾在震驚於暫設5號機和第3使徒的新設計之後，看到第7使徒時能有一點安心感[3]。在決定顏色階段，庵野加上了一個「像時鐘一樣轉動」的設計。畫稿定案後，劇組將之建模成3D模型，在螢幕上調整過後即完成設計[3]，庵野認為小山的方案很適合用CG呈現[1]。
庵野最初請渡部隆設計第8使徒，他的設計保留了TV版的形象，並加入了「變形」的要素，使徒自球體展開的結構和點子也由他提出[1]。不過因為渡部的方案太像生物，不適合CG，所以庵野請前田真宏來做最終改動[1]。前田安排第8使徒像烏賊一樣，藉著墨黑壓壓地移動，且球體內側有在跳舞的謎之人[1]。第8使徒在最後從裡頭露出一個人形，因為人形糾纏住初號機，所以不能用CG，是唯一用作畫完成的部分[1]。庵野請益淺利義遠，打算在第8使徒也做一個人形，淺利便畫了一些草圖。本田將草圖統整，待真宏完成整體設計後，便全部再畫過一次，以求協調[1]。第8使徒的CG呈現遇到諸多麻煩，劇組迫於時限只能勉強完成，之後在2.22版後再行修正[1]。
侵蝕3號機的第9使徒和TV版大致無異，只有稍微改變顏色。該場景中的替身插入栓經過山下育人的重新設計[1]。
對於第10使徒，淺利義遠很早就被找來當設計者。淺利收到的要求是要讓第10使徒出場時看起來和TV版沒兩樣，實際上卻是完全不同[1]。淺利於是在初期稿中，將第10使徒設計成初登場時將帶狀的手臂捲起收進身體，外觀就像TV版第14使徒，然而當手臂展開後就是完全不同的模樣[1]。2007年初，庵野再次找上淺利詢問細部設計，淺利再加上了用刺出的口器來捕食EVA的設定[1]。對於，第10使徒捕食零的形態由庵野決定，淺利原本有其他方案，例如使徒長出的胴體樣貌類似torso，或者發生手腳錯置等[1]。