長老教會來臺後,李庥牧師夫婦積極籌備設校,李庥過世後其妻接手,但因病而在1884年返回英國,由女性宣教士朱約安(Miss Joan Stuart) 、與文安(Miss Annie e. Butler)繼承創校事宜。新樓女學校創校後,兩人與萬真珠輪流主持校務,而當其中一位負責校務時,另外二位則前往新樓醫館或去鄉村巡迴,直到日治時期1903年時英國女宣教會派盧仁愛(J.A.Lloyd)前來擔任第一任校長為止,校名也改為「長老教女學校」。1918年,原有校舍已不敷使用,於是在努力募款後買下了今天校地,而新校舍則在1923年11月完工並於該月28日舉行落成典禮。而在1927年時因盧仁愛校長轉任神學院女子部,而由吳瓅志(J.W.Galt)出任第二任校長,其任內廢除了小學部,使該校成為完全的中學校。但後來因太平洋戰爭等因素,吳瓅志被迫離職返回英國,由日籍人士出任校長,並於1939年改為「長榮高等女學校」。二次大戰結束進入民國時期後,改為「私立長榮女子中學」。[4]