組學
組學(英語:omics)通常指生物學中對各類研究對象(一般為生物分子)的集合所進行的系統性研究;例如,基因組學、蛋白質組學,和代謝物組學等,而這些研究對象的集合被稱為「組」。
「組學」的宗旨是:對「轉化為有機體的結構、功能和動力學的生物分子池(pools of biological molecules)」,進行集體表徵和量化[1][2]。
在英語中,「組」以 -ome 作為後綴,而「組學」以 -omics 作為後綴。例如,基因組學(genomics)是系統性研究生物體基因組(genome)中各種基因(gene)以及它們之間的相互關係的學科。
功能基因組學 (functional genomics)旨在鑑定給定生物體中儘可能多的基因的功能。 它將不同的組學技術例如轉錄組學(transcriptomics)和蛋白質組學(proteomics)與飽和突變體集合相結合[3]。
組學研究的種類
基因組學
表觀基因組學
表觀基因組是基因組的支撐結構,包括蛋白質和 RNA 結合物、替代 DNA 結構以及 DNA 上的化學修飾。
- 表觀基因組學: 現代技術包括通過染色體構象捕獲進行的染色體構象、各種染色質免疫沉澱-測序和其他與蛋白質組分離相結合的測序方法,以及發現胞嘧啶化學修飾的測序方法,如亞硫酸氫鹽測序。
- 核組學(nucleomics):研究構成「細胞核作為一個複雜、動態的生物系統,稱為核組(nucleome)」的完整基因組成分集[4][5]。 4D Nucleome Consortium於2017年正式加入國際人類表觀基因組聯合會 (頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)(International Human Epigenome Consortium, 縮寫:IHEC)。
蛋白質組學
脂類組是細胞脂類的完整補充,包括對由生物體或系統產生的一組特定脂質所做的修飾。
- 脂類組學:脂類通路和網絡的大規模研究。 使用質譜技術。
營養、藥理、毒理
其他
參考文獻
- ^ 存档副本. [2023-01-31]. (原始內容存檔於2023-05-21).
- ^ Subedi, Prabal; Moertl, Simone; Azimzadeh, Omid. Omics in Radiation Biology: Surprised but Not Disappointed. Radiation. 2022, 2: 124–129. doi:10.3390/radiation2010009 .
- ^ Holtorf, Hauke; Guitton, Marie-Christine; Reski, Ralf. Plant functional genomics. Naturwissenschaften. 2002, 89 (6): 235–249. Bibcode:2002NW.....89..235H. PMID 12146788. S2CID 7768096. doi:10.1007/s00114-002-0321-3.
- ^ Tashiro, Satoshi; Lanctôt, Christian. The International Nucleome Consortium. Nucleus. 2015-03-04, 6 (2): 89–92. PMC 4615172 . PMID 25738524. doi:10.1080/19491034.2015.1022703.
- ^ Cremer, Thomas; Cremer, Marion; Hübner, Barbara; Strickfaden, Hilmar; Smeets, Daniel; Popken, Jens; Sterr, Michael; Markaki, Yolanda; Rippe, Karsten. The 4D nucleome: Evidence for a dynamic nuclear landscape based on co-aligned active and inactive nuclear compartments. FEBS Letters. 2015-10-07, 589 (20PartA): 2931–2943. ISSN 1873-3468. PMID 26028501. S2CID 10254118. doi:10.1016/j.febslet.2015.05.037 (英語).
延伸閱讀
- Big biology: The 'omes puzzle (頁面存檔備份,存於網際網路檔案館):關於「組學」現象的討論