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Northern印迹法

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Northern印迹法(英语:Northern blot),又称 RNA 印迹法,是分子生物学生物化学中常用的实验方法,通过探测样品中的RNA(或隔离的mRNA)来研究基因表达[1][2]

通过Northern印迹法来检测RNA的流程图

利用探针侦测由凝胶电泳分离出来的RNA片段,寻找含有特测序列的RNA片段。与Southern印迹法相似,RNA样品经过凝胶电泳后会按照大小分离,然后将样品从凝胶转印到膜上,并用与目标序列互补的标记的探针来探测。实验结果可以根据所用探针的不同,以多种方式来观察,但大多数都显示的是样品中被探测的RNA条带的相对位置,也就是分子大小;而条带的强度则与样品中目标RNA的含量相关。这一方法可以测量目标RNA在不同样品中的情况,因此已经被普遍用于研究特定基因在生物体中表现的时刻和表现量,也是这类研究中最基本的手段。

发明者是斯坦福大学的James Alwine和乔治·斯塔克(George Stark)在1977年发明,其名字是源于第一种印迹技术,Southern印迹法(命名者为Edwin Southern[1],两者很相似,与Southern印迹法主要的不同是Northern印迹法探测的是RNA分子,而不是DNA分子。[3]

原理

与Southern印迹法相似,胶体可以选用琼脂凝胶或是聚丙烯酰胺凝胶,被检测物是RNA,“探针”(probe)是与目标序列互补的RNA、DNA序列或是寡核苷酸,但是探针至少要有25个碱基对与目标序列互补。

Capillary blotting system setup for the transfer of RNA from an electrophoresis gel to a blotting membrane.

胶体

RNA样品通常以含甲醛的琼脂凝胶电泳来分离,甲醛作为RNA变性剂,将RNA的二级结构变性成一级结构。凝胶内用溴化乙锭(EtBr)染色,可在UV光下观察到RNA样品的品质、大小。

实验步骤

实验大至分为铸胶、跑胶、转渍、北方杂合反应等几个部分。

参见

参考文献

  1. ^ 1.0 1.1 Alberts, B., Johnson, A., Lewis, J. Raff, M., Roberts, K., Walter, P. 2008. Molecular Biology of the Cell, 5th ed. Garland Science, Taylor & Francis Group, NY, pp 538–539.
  2. ^ Kevil, C. G., Walsh, L., Laroux, F. S., Kalogeris, T., Grisham, M. B., Alexander, J. S. (1997) An Improved, Rapid Northern Protocol. Biochem. and Biophys. Research Comm. 238:277–279.
  3. ^ Bor, Y.C.; Swartz, J.; Li, Y.; Coyle, J.; Rekosh, D.; Hammarskjold, Marie-Louise. Northern Blot analysis of mRNA from mammalian polyribosomes. Nature Protocols. 2006. doi:10.1038/nprot.2006.216. 

外部链接