南京大学生物学系是中国第一个生物学系，现设在南京大学生命科学学院。
民国9年（1920年），南京高等师范学校成立生物学系，秉志为系主任。民国10年，成立国立东南大学。南京高等师范学校和国立东南大学时期，生物系设在农科。教授还有秉志、胡先骕、陈焕镛、钱崇澍等人。
民国17年（1928年），校名改为国立中央大学。国立中央大学时期，生物学系设在理学院，曾一度分为植物学系、动物学系。
1949年，中央大学更名南京大学，欧阳翥仍任系主任。1952年金陵大学生物系并入南京大学生物系。
1990年，生物系和生化系合组生命科学院。1994年，生物学系更名为生物科学与技术系。