司馬文深（4世紀—401年），東晉宗室，司馬承的玄孫，司馬無忌的曾孫，司馬恬之孫，司馬恢之的兒子。
高陽王司馬毅在永嘉之亂時被殺。直到東晉末年，隆安元年（397年），晉安帝以譙敬王司馬恬次子司馬恢之子司馬文深出繼司馬毅，襲封高陽王（治所在今河北省蠡縣南十五里）。在位五年，隆安五年（401年）去世，無嗣，再以高密王司馬純之之子、司馬文深的族侄司馬法蓮出繼司馬文深，襲封高陽王。
