穆罕默德三世（Muhammet Han III，？—1211年），東喀喇汗國第十一代汗，玉素甫的兒子。他的祖父伊卜拉欣二世被西遼耶律大石賜予「土庫曼伊利克」的稱號。東喀喇汗國屬於西遼的附庸。1205年，他的父親玉素甫死在喀什噶爾，穆罕默德即位。因為密謀反叛西遼，穆罕默德被西遼皇帝耶律直魯古囚禁。屈出律取代耶律直魯古之後，釋放穆罕默德，但是他不受貴族們的歡迎，在入城時，穆罕默德被殺死在喀什噶爾城門中，東喀喇汗國滅亡。
