晉昌郡，中國南北朝時設置的郡。
東晉置晉昌郡，安置巴漢流民，在今陝西省石泉縣西，領長樂、寧都、安晉、延壽、安樂、宣漢、新興、吉陽、東關、永安等10縣。劉宋將晉昌郡遷治在吉陽縣（今湖北省竹谿縣西南）。下轄吉陽、東關二縣，為僑郡。後改名新興郡。南齊在石泉縣再設晉昌郡。
