衛星DNA
衛星DNA由串聯排列、不斷重複的非編碼DNA組成，它是着絲粒的主要組成部分，也是異染色質的主要結構部分[1]。
類型
一些人體內的衛星DNA類型包括：
| 類型 | 大小 (bp) | 位置 |
|---|---|---|
| α (alphoid DNA) | 171 | 所有染色體 |
| β | 68 | 染色體1、9、13、14、15、21、22和Y的着絲粒 |
| 1型衛星 | 25-48 | 大多數染色體的着絲粒和其它部位 |
| 2型衛星 | 5 | 大多數染色體 |
| 3型衛星 | 5 | 大多數染色體 |
長度
重複的脫氧核糖核酸核鹼基模式的長度可以從1對核鹼基到數千對核鹼基不等，整個衛星DNA的長度可以達不中斷的數百萬核鹼基。大多數衛星DNA位於染色體的端粒或着絲粒部位，不同種之間重複的核苷酸系列模式被保持完好，但是在長的系列裡也常有變換。
起源
微衛星估計是脫氧核糖核酸複製的時候出錯導致的。
病理學
衛星DNA經常出現在轉錄單位里。
結構
通過對陸生蟹Gecarcinus lateralis的研究證明真核生物力衛星DNA有高級的三維結構，3%這種陸生蟹的脫氧核糖核酸由一個叫做RU的約2100核鹼基對長的重複，這個系列裡有許多GC系列[2] [3]。在每個基因里都有約16000個RU系列。一些RU系列被複製，隨後的研究發現這裡有保存下來的普通DNA系列，這些系列之間有四個微衛星部分，這些微微性主要由在一股上的嘌呤和另一股上的嘧啶組成，其中包括約20至25對長的G和C的重複。微衛星里最常見的重複系列是CCC:AGG和CCCT:AGGG[4][5][6]。在微酸性條件下這些嘧啶:嘌呤重複形成一個三股結構[4] [4] [5] [6]。
在微衛星重複和G:C重複之間所有的變異包含被一或兩對A（嘧啶）中斷的多嘌呤段和被T（嘌呤）中段的多嘧啶段。在所有被研究的RU系列裡都沒有G嘧啶或者C嘌呤。通過它對核酸酶的反應這個非常不平衡的系列特徵被證實。在一個RU變種里TTAA系列被發現，這個系列被克隆和仔細研究[4]。
RU系列的另一個區域的特徵是由交替的嘌呤和嘧啶組成的對稱DNA系列，這個系列形成一個左旋結構。在所有克隆里均發現CGCAC:GTGCG系列，它也出現於RU的另一個區域。一段含有這個系列的區域被切出克隆來仔細研究它的結構特徵[7]。
複製的RU系列事實上沒有變化。只有微衛星的重複數目以及C和G段落的長度有差異[7][4][5][6][2][3]。
一個RU系列在與多個只含有一個Alu系列的反轉拷貝的邊上有多個Alu系列[2]。
另一種寄居蟹Pagurus policarus30%的基因由一族多AT的衛星及其逆轉結構組成[8]。
參考資料
- ^ Knight, Julian C. Human Genetic Diversity: Functional Consequences for Health and Disease. Oxford University Press. 2009: 167 [2015-12-05]. ISBN 978-0-19-922769-3. （原始內容存檔於2021-04-27）.
- ^ 2.0 2.1 2.2 Bonnewell, V.; Fowler, R. F.; Skinner, D. M. An inverted repeat borders a fivefold amplification in satellite DNA. Science (New York, N.Y.). 1983-08-26, 221 (4613): 862–865. ISSN 0036-8075. PMID 6879182.
- ^ 3.0 3.1 Skinner, D. M.; Bonnewell, V.; Fowler, R. F. Sites of divergence in the sequence of a complex satellite DNA and several cloned variants. Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. 1983,. 47 Pt 2: 1151–1157. ISSN 0091-7451. PMID 6305575.
- ^ 4.0 4.1 4.2 4.3 4.4 Fowler, R. F.; Skinner, D. M. Eukaryotic DNA diverges at a long and complex pyrimidine:purine tract that can adopt altered conformations. The Journal of Biological Chemistry. 1986-07-05, 261 (19): 8994–9001. ISSN 0021-9258. PMID 3013872.
- ^ 5.0 5.1 5.2 Stringfellow, L. A.; Fowler, R. F.; LaMarca, M. E.; Skinner, D. M. Demonstration of remarkable sequence divergence in variants of a complex satellite DNA by molecular cloning. Gene. 1985, 38 (1-3): 145–152. ISSN 0378-1119. PMID 3905513.
- ^ 6.0 6.1 6.2 Fowler, R. F.; Bonnewell, V.; Spann, M. S.; Skinner, D. M. Sequences of three closely related variants of a complex satellite DNA diverge at specific domains. The Journal of Biological Chemistry. 1985-07-25, 260 (15): 8964–8972. ISSN 0021-9258. PMID 2991230.
- ^ 7.0 7.1 Fowler, R. F.; Stringfellow, L. A.; Skinner, D. M. A domain that assumes a Z-conformation includes a specific deletion in some cloned variants of a complex satellite. Gene. 1988-11-15, 71 (1): 165–176. ISSN 0378-1119. PMID 3215523. doi:10.1016/0378-1119(88)90088-1.
- ^ Fowler, R. F.; Skinner, D. M. Cryptic satellites rich in inverted repeats comprise 30% of the genome of a hermit crab. The Journal of Biological Chemistry. 1985-01-25, 260 (2): 1296–1303. ISSN 0021-9258. PMID 2981841.
參考書籍
- Beridze, Thengiz. Satellite DNA. Springer-Verlag. 1986. ISBN 978-0-387-15876-1.
- Hoy, Marjorie A. Insect molecular genetics: an introduction to principles and applications. Academic Press. 2003: 53. ISBN 978-0-12-357031-4.