朱存器（？—？），大都寶坻人，元朝官員，祖籍徐州，後遷居寶坻。
蒙元帝國建立後，朱存器擔任修內司使。曾經在夜裡經過盧溝橋，撿到一囊黃金，便在原地等待失主還給他。失主找到他後，表示願意平分，朱存器堅絕推辭，只是笑着離開。其子是元朝攻下海南島的將領朱國寶。
