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單倍群

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分子演化的研究中,單倍群(Haplogroup)是一組類似的單倍型(Haplotype),它們有一個共同的單核苷酸多態性祖先。因為單倍群由相似的單倍型組成,所以可以從單倍型來預測單倍群。單核苷酸多態性試驗被用來確認單倍型。單倍群以字母來標記,並且以數字和一些字母來做補充,例如O3e1. Y染色體和線粒體單倍群有不同的單倍群標記方法。單倍群可用來標記數千年前的祖先來源。[1]

人類遺傳學英語human genetics中,最常被拿來研究的單倍群是Y染色體(Y-DNA)單倍群線粒體DNA(mtDNA)單倍群,這兩個都可以被用來定義遺傳群體。Y染色體脫氧核糖核酸單倍群僅能以父系遺傳,同時mtDNA僅能以母系遺傳[註 1]

基於遺傳標記的人類單倍型分類,特別是藉助唯一事件多樣性英語Unique event polymorphism(UEPs),在過去幾年中快速發展着。

單倍群群體遺傳學

一般被認為對於某個存活到現在的特定單倍型突變自然選擇並不存在偏好與否,所以除去突變率(其會根據不同的標記而變化)群體遺傳學中主要影響單倍群比例的原因是遺傳漂變

人類Y染色體DNA單倍型類群

人類Y染色體DNA(Y-DNA)單倍型類群被命名為A到T,其中部分被更進一步以數字及小寫拉丁字母細分。主Y染色體單倍型類群編號的設計係由Y染色體協會建立。[2]

人類Y染色體DNA單倍型類群進化樹

Y染色體最近共同祖先
A
A1b A1a-T
A1a A2-T
A2 A3 BT
B CT
DE CF
D E C F
G H IJK
IJ K
I J LT K(xLT)
L T M NO P S
O N Q R

各族群Y染色體單倍型類群 · 著名的Y染色體單倍型類群人

Y染色體亞當是由研究人員命名,用來指稱人類父系的最近共同祖先。主要的Y染色體單倍群及其在前歐洲殖民地發生狀況的地理分佈如下:

全球前殖民地各族群主要的Y染色體單倍群及其依據海岸遷移模型的可能遷移路線

無M168突變族群

有M168突變族群

M168突變發生於約公元前5萬年。

  • 單倍群C(M130):大洋洲、北/中/東亞、北美洲,僅略微存在於南美洲、南亞、西亞及歐洲
  • 單倍群F(M89):大洋洲、歐洲、亞洲、美洲
  • YAP+單倍群

有M89突變族群

M89突變發生於約公元前4萬5千年。

  • 單倍群F(P14, M213):南印度、斯里蘭卡、中國、韓國
  • 單倍群G(M201):出現在歐亞大陸的許多族群,但比率不高;最常見於高加索、伊朗高原及安那托利亞;在歐洲主要分佈於希臘、義大利、伊比利、提洛、波希米亞;在北歐則極為罕見
  • 單倍群H(M69):南印度、斯里蘭卡、尼泊爾、巴基斯坦、伊朗、中亞及阿拉伯

有L15及L16突變族群

有M9突變族群

M9突變發生於約公元前4萬年。

  • 單倍群K
    • 單倍群LT(L298/P326)
      • 單倍群L(M11, M20, M22, M61, M185, M295):南亞、中亞、西南亞、地中海地區
      • 單倍群T(M70, M184/USP9Y+3178, M193, M272):北非、非洲之角、西南亞、地中海地區、南亞,以往稱為單倍群K2
    • 單倍群K(xLT)(rs2033003/M526)
有M526突變族群

人類粒線體DNA單倍體群

人類粒線體DNA單倍體群被標為不同字母: A, B, C, CZ, D, E, F, G, H, pre-HV, HV, I, J, pre-JT, JT, K, L0, L1, L2, L3, L4, L5, L6, L7, M, N, O, P, Q, R, S, T, U, UK, V, W, X, Y, and Z.

人類粒線體DNA單倍體群

  最近的共同粒線體祖先    
L0   L1  
L2 L3   L4 L5 L6 L7
  M N  
CZ D E G Q   A I O   R   S W X Y
C Z B F pre-HV   pre-JT P  UK
HV JT U K
H V J T

定義群體

人類單倍型遷移地圖

單倍群可以用來定義遺傳學群體和地理分佈。例如,以下是mtDNA單倍群一般性區域分佈:

  • 非洲人:L0、L1、L2、L3、L4、L5、L6
  • 西部歐亞人:H、T、U、V、X、K、I、J、W
  • 東部歐亞人:A、B、C、D、E、F、G、Y、Z
  • 美洲原住民:A、B、C、D、X
  • 澳洲-美拉尼西亞人:P、Q、S

線粒體單倍群分為3群,以3個連續的字母L、M、N表示。人類第一次在群內分離成L0和L1-6。L1-6隨後引伸出其他群,其中的L3分離成M和N群。M群組成包括人類第一波由離開非洲,順著南部沿海地區向東的大遷移​​路線。

Y染色體DNA單倍型類群和粒線體DNA單倍體群的相同之處

以下是Y染色體DNA單倍型類群和粒線體DNA單倍體群大約的相同之處:

Y-DNA單倍群 mtDNA單倍 地理分佈/族群
A L0 東非及南非
B L1、L4 東非及中非
E L2、L3 非洲
D、O、N、P、Q、C2 M8a/C/Z, D, G (M型); A, N9/Y (N型); B, F (R型) 東亞、西伯利亞
K、M (M9-正、M45-負) B、P (R型); N; Q (M型) 以及大洋洲的特定M分支 大洋洲
R、I、T、J、E (V13, M81, 及M123型) R0, HV/H/V, JT/J/T, U/K (R型) 南亞、歐洲、西亞、北非、非洲之角
Q、C2 A、X (N型), B(R 型); C、D (M型) 西伯利亞極東端、美洲

參看

註釋

  1. ^ 所謂父系或母系遺傳是指說其後代能夠接受誰的基因。如果是父系遺傳,則他們的子代只會接受父親的基因,反之亦然。

參考文獻

  1. ^ The International Society of Genetic Genealogy see Haplogroup definition in DNA-NEWBIE GLOSSARY [1]頁面存檔備份,存於網際網路檔案館
  2. ^ Y Chromosome Consortium. [2008-08-04]. (原始內容存檔於2017-01-16). 
  3. ^ 存档副本 (PDF). [2009年7月2日]. (原始內容 (PDF)存檔於2009年6月19日). 

外部連結

一般資料

新聞

所有單倍體群

Y染色體DNA單倍型類群

粒線體DNA單倍體群