佟國器(?—?),字思遠,號匯白,襄平人 [1],是中國清朝官員,滿洲人,佟佳氏。順治二年(1645年)授浙江嘉湖兵備道,次年,擔任福建左布政使晉按察使,順治十年(1653年)擔任福建巡撫,順治十二年(1655年)調南贛巡撫,順治十五年(1658年)任浙江巡撫。
佟國器訂舊增新完成了明朝末年佟卜年初定的《佟佳氏宗譜》。