SNOMED CT
SNOMED CT(Systematized Nomenclature of Medicine -- Clinical Terms,医学系统命名法-临床术语,医学术语系统命名法-临床术语),是一部经过系统组织编排的,便于计算机处理的医学术语集,涵盖大多数方面的临床信息,如疾病、所见、操作、微生物、药物等。采用该术语集,可以协调一致地在不同的学科、专业和照护地点之间实现对于临床数据的标引、存储、检索和聚合。同时,它还有助于组织病历内容,减少临床照护和科学研究工作中数据采集、编码及使用方式的变异。
目的
在指称同一事物的时候,不同的临床医生和医疗卫生机构往往会采用不同的临床术语。例如,对于心脏病学专科医师来说,心脏病发作、心肌梗死以及MI可能指的是同一含义,而对于电脑来说,三者之间则全然不同。因此,不同的医疗保健服务提供者、医疗服务设施、研究人员以及其他相关方之间需要协调一致地交换临床信息(语义互操作性);而且,不同的地方对于医学信息的记录方式也各不相同(如采用纸质记录或者采用电子记录),因而需要一种广泛全面而又协调统一的医学术语系统(medical terminology system),作为信息基础结构(information infrastructure)的组成部分。
设计
SNOMED CT是一个组配式概念体系(compositional concept system,组合式概念体系)。这就是说,可以通过与其他概念的组合,对概念加以特化。SNOMED CT是以描述逻辑为基础,在设计上便于将内容作为一种动态资源加以维护。
组成要素
- 概念:每个唯一性数字型代码、唯一性名称(全称,即Fully Specified Name)和描述(包括一条首选术语和一条或多条同义词)所指定的基本含义单位。
- 描述:赋予同一概念的不同术语或名称(同义词)。
- 层级结构:19 个高级层级结构;每个高层层级结构又分别具有各自的子级层级结构。
- 关系:用于在同一层级结构之内或不同层级结构之间将不同的概念联系起来。
- 子集[1]
基本设计原理
284196006|Burn of skin|: {246112005|Severity|=24484000|severe, 363698007|Finding Site|= 113185004|Structure of skin between fourth and fifth toes|:272741003|Laterality|=7771000|left|}
与SNOMED CT特定发布版本之中所已经收录的那套实体相比,此类表达式属于是所谓的'后组配型'(post-coordinated,后组型),而前者通常从总体上称为'先组配型'(pre-coordinated,先组型)概念。不过,这些先组配型概念之中的大多数(85%)当前实际上还属于是原初型实体(primitive entities)。
注意:在其他的上下文(语境)或项目之中,'coordination'一词可能并不是指对某个候选新建表达式的详细说明,而可能是指在多重层级结构之中集成某一概念的后续操作(也就是对此概念加以分类)。然而,在SNOMED CT术语集之中,当说到已经对某一表达式进行了'后组配'的时候,并不意味着同时也对其进行了分类。
在同时顾及到SNOMED CT发布版本数据集之中已经收录的那些概念以及最终用户群体所已经创建或有待创建的任何其他特别概念的情况下,对于任何此类后组配型表达式的可靠分析和比较,的确都相当需要运用某种合适的描述逻辑分类算法。截至2007年,SNOMED CT的内容将其本身局限于EL++形式体系的一种子集;SNOMED CT将自身局限于下列运算符:
top, bottom primitive roles and concepts with asserted parent(s) for each concept definition and conjunction but NOT disjunction or negation role hierarchy but not role composition domain and range constraints existential but not universal restriction a restricted form of role inclusion axiom (xRy ^ ySz => xRz)
在不久的将来,可能会对其逻辑加以扩展,从而将一般概念蕴含公理(General Concept Inclusion Axioms)包括进来。
理论上而言,为了评估其究竟是早已在世界范围内分发的那370,000个先组配型概念之中的任何一个已有概念的父概念、先祖概念、子概念或者其他后裔概念,还是在语义上与之等价,可以将描述逻辑推理应用于任何新的候选后组配型表达式。不过,部分随着与CTV3之间合并产物的不断沉降,2007年SNOMED的内容之中依然含有未被发现的语义重复性原初型概念和定义型概念。此外,许多概念依然归属原初型,但同时它们的语义却又可以利用同时存在于该系统之中的其他原初型概念和作用关系(roles)加以合理合法的定义。正是因为语义内容之中的这些疏漏之处以及实际或可能存在的冗余,各种用来推导归类关系或语义等价关系的算法在实际当中的性能必将不够完善,但程度却无法预知。
特性
采用同一部诸如SNOMED CT之类的标准术语集来记录信息的好处,与采用电子照护记录以及采用结构化形式记录临床信息的那些好处息息相关。
用途
SNOMED CT是美国联邦政府指定的一套数据标准之一,旨在用于临床信息的电子交换。
采用SNOMED CT的计算机应用程序示例
历史
2002年1月,SNOMED RT(SNOMED Reference Terminology,医学术语系统命名法-参考术语集)与英国国家卫生服务部(National Health Service,NHS)的临床术语(Clinical Terms,又称为Read Codes)相互合并,并经过扩充和结构重组,从而形成了SNOMED CT[2]。SNOMED RT在历史上的优点就是它的那些专业医学术语集以及所采用的分布式协作开发方法,而第3版临床术语(Clinical Terms Version 3,CTV3)的优势则是它在全科医学方面的那些术语集[3]。通过把这两个体系组合起来,SNOMED CT目前成为现有任何语言之中最为广泛全面的临床词表,收录有超过344,000个概念,涵盖了临床医学的大多数方面[2]。SNOMED CT还与其他的术语集之间进行着交叉映射,如ICD-9-CM、ICD-O3、ICD-10、实验室方面的LOINC以及OPCS-4。SNOMED CT还支持ANSI(页面存档备份,存于互联网档案馆),DICOM(页面存档备份,存于互联网档案馆),HL7,and ISO(页面存档备份,存于互联网档案馆)标准[4]。2002年4月,发布了SNOMED CT 西班牙语版;2003年4月,发布了SNOMED CT 德语版。
美国国立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM)代表美国健康与人类服务部(Department of Health and Human Services, HHS),就核心SNOMED CT(包括西班牙语版和英文版)及其不断更新的永久许可证,与美国病理学家协会(College of American Pathologists,CAP)之间签署了一份协议。这份合同旨在为NLM提供一份永久性的许可证(页面存档备份,存于互联网档案馆),以便在NLM的一体化医学语言系统[5]UMLS Metathesaurus之中分发SNOMED,在美国国内供美国政府(联邦、州、地方和属地)和私营组织机构免费使用。这份合同同时还涵盖了美国病理学家协会在2003年6月30日至2008年6月29日之间所发行的对于SNOMED CT的更新。
2007年4月,国际卫生术语标准制定组织(International Health Terminology Standards Development Organization,IHTSDO)收购了SNOMED CT。
参考文献
参见
- 国际卫生术语标准制定组织(International Health Terminology Standards Development Organization,IHTSDO)
- HL7
- CPT
- ICD-O
- UMLS
- LOINC
- MEDCIN
- 临床数据交换标准协会(Clinical Data Interchange Standards Consortium,CDISC)
- DOCLE
外部链接
- IHTSDO 网站 - SNOMED 所有者主页(页面存档备份,存于互联网档案馆)
- www.snomed.org(正在搬迁)(页面存档备份,存于互联网档案馆)
- CAP SNOMED Terminology Solutions - SNOMED CT的原创者(页面存档备份,存于互联网档案馆)
- CliniClue SNOMED CT Browser - 免费软件下载
- UMLS-SNOMED 常见问题解答(页面存档备份,存于互联网档案馆)
- NHS Connecting for Health UK
- SNOB - Desktop SNOMED Browser - 免费软件下载
- SNOMED CT Browser with SNOFLAKE view at dataline.co.uk
- VMIL 术语浏览器
- SNOCat: SNOMED Categorizer/Browser