菌绿素

菌绿素 a. R 是phytyl或香叶基香叶基焦磷酸.

菌绿素，或者称细菌叶绿素（英文bacteriochlorophyll，简写BChl）是存在于多种细菌中的光合色素。它们和植物、真核藻类和蓝藻中的叶绿素结构上类似。含有菌绿素的细菌能进行光合作用，但不产生氧气。不同类群的细菌具有不同种类的菌绿素：

菌绿素种类	光合细菌	最大吸收峰(nm)	乙醇中最大吸收峰(nm)	作用
菌绿素a (BChl a)	紫细菌、绿硫细菌、绿弯菌、和Chloracidobacterium thermophilum	800-810, 850-890	364, 770	反应中心或天线
菌绿素b (BChl b)	紫细菌	1015-1035	373, 795	反应中心或天线
菌绿素c (BChl c)	绿硫细菌和绿弯菌	745-760	434, 666	天线
菌绿素cs (BChl cs)	绿弯菌	740
菌绿素d (BChl d)	绿硫细菌	725-745	427, 655	天线
菌绿素e (BChl e)	绿硫细菌	715-725	469, 654	天线
菌绿素 f	绿硫细菌（目前仅通过突变发现；自然界可能存在）	700–710
菌绿素g (BChl g)	太阳杆菌	770-790		反应中心

菌绿素a，b和g是细菌二氢卟酚，这意味着它们的分子具有含两个吡咯环（B和D）的细菌二氢卟酚大环。 菌绿素c，d，e和f是二氢卟酚，这意味着它们的分子具有二氢卟酚大环以及一个吡咯环（D）。

结构比较卟吩，二氢卟吩，细菌卟吩，异菌卟吩。注意C=C 双键的位置在两种细菌卟吩与异菌卟吩。大环的每个双键有两个π电子 (符号化为by π e⁻)。