肉鳍鱼总纲 （学名 ：Sarcopterygii ，英语 ：lobe-finned fish ）是硬骨鱼类 的一个演化支 ，与辐鳍鱼 互为姐妹群 。肉鳍鱼的特点是鳍 的主体是一个内有多关节 内骨骼 （附肢骨骼 ）和骨骼肌 的附肢 （而不像辐鳍鱼那样是仅有皮肤 覆盖棘骨 的折扇 形鳍），在胸鳍 和腹鳍 的基部有胛骨 和强劲的肌肉与肋骨 相连，和之后四足动物 的四肢 同源 。此总纲之下包括腔棘鱼纲 及肺鱼四足纲 [ 1] [ 2] 演化 自肺鱼四足纲 中的四足形类 。
肉鳍鱼最早出现在距今4.23亿年前的志留纪 晚期，在石炭纪 和二叠纪 时期兴盛并成为淡水生态系统 的顶级物种 ，但在二叠纪末大灭绝 中受到重创，大部分于距今6500万年前的晚白垩纪 绝种 。其中的腔棘鱼 曾被认为完全灭绝，直到1938年才在非洲 东南的印度洋 深海捕捉到现生 的活体，之后并在印度 等地区多次被发现而证实仍然存活于深海中，目前仅存一目二种，即矛尾鱼 ，被认为是鱼类中的活化石 。
目前已知体型最大的肉鳍鱼为石炭纪时期苏格兰 的希氏根齿鱼 ，体长可超过7米（23英尺）。现存体型最大的腔棘鱼为西印度洋矛尾鱼 ，体长可达2米（6英尺7英寸），体重可达110千克（240英磅）；体型最大的肺鱼 为非洲肺鱼科 ，体长同样可达2米（6英尺7英寸），重量可以达到50千克（110英磅）[ 3] [ 4]
分子遗传学 表明，包括人类 在内的陆生 脊椎动物 （四足动物 ）都属于这一演化支 ，依据化石 研究推测，有可能是在大约 3.6 亿年前从肉鳍鱼类中的类似蝶柱鱼 的祖先演化而来[ 5] [ 6] 鳔 因直接从空气 进行气体交换 的能力变强逐渐演化成了肺 ，因此更适应泥盆纪晚期遍布湿地 的河岸带 生态位 ，其两对硬骨 化的偶鳍也逐渐演化成了更强健的四肢 。而志留纪—泥盆纪陆地革命 后空气含氧量持续提升，加上之后泥盆纪末大灭绝 中普遍水体缺氧 造成的筛选压力 更有利那些能直接呼吸空气的族群，使得幸存的四足形类 （坚头类 ）最终演化成出原始的两栖动物 。而由于两栖动物中离片椎类 的强势，使得其它被边缘化的两栖动物不得不去适应更远离水体的生态位，其中一支——爬行形类 最终演化出了可以完全脱离水体进行繁殖的羊膜动物 。这些羊膜动物很快分化出合弓类 和蜥形类 两大演化支，并在石炭纪雨林崩溃事件 后的二叠纪成为优势的陆生动物，其中一些还在三叠纪 先后返回水域生态系统 成为海洋爬行动物 。
西印度洋矛尾鱼 腔棘鱼纲 分为腔棘目 和爪齿鱼目 。其中爪齿鱼目 生活在四亿年前左右，已灭绝。现仅存腔棘目 下矛尾鱼 ，被称为“活化石 ”。
肺鱼四足纲 （Dipnotetrapodomorpha）除了包含现存的肺鱼纲 和四足形上纲 ，也包含史前的爪齿鱼类 ，而扇鳍纲 则是个只包含前两者的泛群 、但不包含爪齿鱼类。肺鱼四足大纲与扇鳍类 的关系取决于爪齿鱼类的地位，如果爪齿鱼类较接近肺鱼四足类而不是棘腔鱼纲，则扇鳍类为肺鱼四足类的下级分支；如果爪齿鱼类不属于这里，则肺鱼四足大纲可能成为扇鳍纲的异名 ：
依照 2017 年《硬骨鱼支序分类法 现生 硬骨鱼 的演化关系如下[ 1] [ 7]
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