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User:RQuichotte/考马斯亮蓝

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考马斯亮蓝R-250
Skeletal formula of Coomassie Brilliant Blue R-250
Space-filling model of the Coomassie Brilliant Blue R-250 molecule
别名 C.I. 42660, C.I. Acid Blue 83
Brilliant indocyanine 6B, Brillantindocyanin 6B
Brilliant Cyanine 6B, Serva Blue R
识别
CAS号 6104-59-2  checkY
PubChem 61365
SMILES
 
  • CCN(CC1=CC(=CC=C1)S(=O)(=O)[O-])C2=CC=C(C=C2)C(=C3C=CC(=[N+](CC)CC4=CC(=CC=C4)S(=O)(=O)[O-])C=C3)C5=CC=C(C=C5)NC6=CC=C(C=C6)OCC.[Na+]
性质
化学式 C45H44N3NaO7S2 (Sodium salt)
摩尔质量 825.97 g/mol g·mol⁻¹
溶解性（水） Insoluble in cold, slightly soluble in hot (bright red blue)
溶解性（ethanol） Slightly soluble
若非注明，所有数据均出自标准状态（25 ℃，100 kPa）下。
Coomassie Brilliant Blue G-250
别名 C.I. 42655, C.I. Acid Blue 90
Brilliant indocyanine G, Brillantindocyanin G
Xylene Brilliant Cyanine G, Serva Blue G
识别
CAS号 6104-58-1
PubChem 6324599
SMILES
 
  • CCN(CC1=CC(=CC=C1)S(=O)(=O)[O-])C2=CC(=C(C=C2)C(=C3C=CC(=[N+](CC)CC4=CC (=CC=C4)S(=O)(=O)[O-])C=C3C)C5=CC=C(C=C5)NC6=CC=C(C=C6)OCC)C.[Na+]
KEGG D10799
性质
化学式 C47H50N3NaO7S2 (Sodium salt)
摩尔质量 856.03 g/mol g·mol⁻¹
溶解性（水） Slightly soluble in cold, soluble in hot (bright blue)
溶解性（ethanol） Soluble
若非注明，所有数据均出自标准状态（25 ℃，100 kPa）下。

考马斯亮蓝 是两个 三苯基甲烷 衍生物染料（G-250和R-250）的统称，起初开发用于纺织行业，但现在通常用于分析生物化学中的蛋白质染色。考马斯亮蓝G-250比考马斯亮蓝R-250多两个 甲基。 名其"考马斯"是帝国化学工业下的一个注册商标。

起名和發現

考马斯这个名字，最初在19世纪末，被一家设在英国Blackley的染料公司Levinstein Ltd.作为贸易名使用，用来卖一些酸性羊毛染料。[1] 在1896年， 在第四次英国-阿散蒂战争期间, 英国军队占据了考马斯镇(今天的Kumasi in [[加纳|加纳]). 在1918年， Levinstein Ltd.公司并入不列颠染料公司（British Deystuffs Cororation) ，后者在1926年成为帝国化学工业的一部分。[2] 虽然帝国化学工业公司仍然持有考马斯这种商标，可是他们没有再生产这种染料。

這些藍色的二磺酸化三苯甲烷的染料首先在1913年被住在德國Elberfeld的Max Weiler所生產[3] 後來陸續發現了多種有機化學合成這種染料的方法。Var[4][5][6]

在今天，大家發表的生化論文中，通常把這些染料統稱“考馬斯”卻不區分具體用的是哪種染料。實際上國際 顏色索引 列出了超過了四十種名字帶“考馬斯”的染料。實際上也有一些其他種類的（非二磺酸化三苯甲烷）的染料，也被叫作“考馬斯”藍。 例如，[ For example, the 默克索引 (第10版) 列出了具有完全不同的結構的考馬斯藍RL ( 酸性藍92, C.I. 13390)。

染料的颜色

後綴帶R的考馬斯亮藍R-250，R意指紅色，red的簡稱，因為考馬斯亮藍R-250在藍色中略帶有紅色；而G型則意指Green，在藍色中帶有一點綠色。250起初是指染料的純度。

這兩種染料的顏色，取決于溶液的酸堿性。考馬斯亮藍G型已經研究得比較詳細。[7] 在pH低於0的時候，呈現紅色，最大吸收峰位于465nm。在pH值約為1時，這種染料呈現綠色，最大吸收峰位于約620nm處。當pH高于2時，這種染料呈現一種亮藍色，最大吸收峰位于595nm。在pH為7的時候，這種染料的莫耳吸光度是43,000 M−1cm−1.[7]

染料分子呈現不同顏色的原因是分子不同的帶電荷狀態。在紅色形態時，全部三個氮原子均帶有正電。兩個磺酸基團有相當低的酸度係數，通常會帶負電，因而在pH為0左右時，整個染料分子會帶1個正電荷。綠色的形態，對應整體不帶電荷。而在中性介質（pH7）中，僅有二苯胺官能團上的氮原子帶有一個正電荷，所以整個分子帶有一個負電荷，呈藍色。這三個氮原子中前兩個失去質子的pKa分別是1.15和1.82。最后一個氮原子在強堿性環境下會失去質子，從而使染料變為粉色（pKa是12.4）[7]

考馬斯亮藍和蛋白質的氨基、羧基基團產生靜電作用，而非共價作用。染料分子和蛋白分子包括羊毛（角蛋白）形成一個蛋白質-染料分子複合物。 這種複合物的形成，使得染料的帶負電荷的形態得到了穩定，從而產生藍色，即使在多數分子帶正電荷的強酸環境下。[7] 這是布拉德福蛋白質定量法的理論依據，是一種利用考馬斯亮藍與蛋白質結合的蛋白質測定方法。這種染料與蛋白質的結合，使得考馬斯亮藍的吸收峰從465nm遷移到595nm。記錄595nm處吸光度的增加，可以用來測定蛋白質濃度。[8]

這種染料也會與陰離子去垢劑十二烷基硫酸鈉(SDS)形成複合物。[9] 這種結合，使得染料分子的綠色形態得到穩定。這個效應可以干擾布拉德福蛋白質定量法的測定。陰離子去垢劑也有可能與蛋白質競爭和染料分子結合。

生物化学中的用途

考馬斯亮藍R-250在1964年被Fazekas de St.Groth的團隊最先用來觀察蛋白。蛋白樣品在醋酸纖維素薄膜上進行電泳分離。薄膜然后被放置于5-磺基水楊酸中，使蛋白质条带固定，然后将膜浸到染料溶液中。[10]

两年之后，1965年Meyer和Lambert用考马斯亮蓝R-250去染经聚丙烯酰胺凝胶分离的蛋白质样品。他们将胶浸在含有甲醇乙酸和水的溶液中。由于染料在染色蛋白质的同时也染了聚丙烯酰胺凝胶，为了使蛋白质条带可见，他们对电泳的凝胶进行了脱色。[11]后续的文献报道聚丙烯酰胺凝胶可以被乙酸溶液成功脱色。

在1967年，第一次报道了可以使用考马斯亮蓝G让聚丙烯酰胺凝胶中的蛋白条带可见，染料是被溶解在含有甲醇的乙酸溶液中。[12] 之后发现，如果使用溶解在不含甲醇的三氯乙酸考马斯亮蓝G胶体，可以使蛋白质条带被染色，而聚丙烯酰胺不被染色。如果用这种方法，就没有必要再对胶进行脱色。[13] 现代的手段通常是将考马斯亮蓝G溶解在含有磷酸、乙醇（或甲醇）和硫酸铵 （或硫酸铝)的溶液中。[14][15][16][17]

布拉德福蛋白质定量法利用了考马斯亮蓝G-250的光谱性质去检测溶液中的蛋白质含量。[18] 将蛋白质样品加入到染料的磷酸和乙醇的溶液中。在酸性环境中，这种染料通常呈现棕红色，但是结合了蛋白质之后，染料形成蓝色形态。溶液的吸光度在595nm波长处测定。这种染料非常著名，因为它有高灵敏性，即使只有5μg蛋白也足以使染料变色。然而，这种方法有一个缺点是变色程度因蛋白质种类不同而不同：单位量蛋白质带来的吸光度改变取决于蛋白质的类型。[19]

与蛋白质结合后，带负电荷的考马斯亮蓝G-250分子会让蛋白质整体带上负电荷。这个性质，可以被用来分离蛋白质或蛋白质复合物，使用非变性条件下的聚丙烯酰胺凝胶电泳——Blue Native PAGE电泳。[20][21]这样的复合体的迁移能力既取决于蛋白质复合体的分子质量，也取决于结合到蛋白质上的染料量。

考马斯亮蓝染色，也可以用于western印迹分析中的一步。[22]它的作用是先于抗体的染色，可以作为对照。

药理用途

2009年，考马斯亮蓝G在实验中被用来治疗实验室大鼠的脊髓损伤。[23] 它通过减少个体肿胀反应而生效，而肿胀反应会导致损伤区域的神经元死于代谢的压力。这个方法在大鼠上测试有效。两组脊髓损伤大鼠被用来测试，一组给予考马斯亮蓝G处理，一组没有处理。测试结果证明，相较于没有处理的大鼠，用染料处理的大鼠可以更好的运动，并且在运动测试中取得更高的得分。[24] 这种治疗能否用在人类身上的相关测试还在进行中。近期的实验中曾在损伤后15分钟后，施予染料治疗有效。但是在现实生活中，病人需要一定时间才能赶到急救室，所以这种治疗应该即使在受伤后两小时后施放仍然有效。唯一报道的副作用是大鼠会短暂的变蓝。[23][25][26]

亮蓝G作为染料可以被外科医生使用来完成视网膜手术，它的贸易名是Brilliant Peel.[27]

法医学应用

纽约州立大学奥尔巴尼分校的一个实验，反应了考马斯染料可以去靶向结合芳香族氨基酸（苯丙氨酸，酪氨酸，色氨酸）和碱性侧链氨基酸（赖氨酸，精氨酸和组氨酸），从而使得布拉德福分析可以用来做指纹的分析。布拉福德分析已经可以成功的用来检测指纹的男女属性。女性指纹样品相较于男性指纹样品，会带来更高的吸收峰（在相近波长下）。这提供了一种更简单的指纹分析方法，将需要分析的氨基酸数从23个减少到了6个，而且相对于茚三酮化学测定方法，需要的准备工作量更少，因为茚三酮测定法需要加热、酶联反应等。[28]

参考文献

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  2. ^ Fox, M. R. Dye-makers of Great Britain 1856-1976 : A History of Chemists, Companies, Products and Changes. Manchester: Imperial Chemical Industries. 1987: 259. 
  3. ^ Colour Index (pdf) 4 3rd. Bradford: Society of Dyers and Colourists. 1971: 4397–4398. 
  4. ^ FR patent 474260,「Procédé de production de colorants de la série du triarylméthane」,发行于1915-02-16,指定于Bayer 
  5. ^ US patent 1218232,Weiler, Max,「Blue Triphenylmethane Dye」,发行于1917-03-06 
  6. ^ GB patent 275609,「Manufacture of Triarylmethane-dyestuffs」,发行于1927-11-03,指定于IG Farbenindustrie 
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  22. ^ Welinder, Charlotte; Ekblad, Lars. Coomassie Staining as Loading Control in Western Blot Analysis. Journal of Proteome Research. 2011, 10 (3): 1416–1419. doi:10.1021/pr1011476. 
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  28. ^ Brunelle, Erica; Le, Anh Minh; Huynh, Crystal; Wingfield, Kelly; Halámková, Lenka; Agudelo, Juliana; Halámek, Jan. Coomassie Brilliant Blue G-250 Dye: An Application for Forensic Fingerprint Analysis. Analytical Chemistry. 2017-04-04, 89 (7): 4314–4319. ISSN 0003-2700. doi:10.1021/acs.analchem.7b00510. 

延伸阅读

  • Gessner, T.; Mayer, U. Triarylmethane and Diarylmethane Dyes. Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry 6th Edition. Weinheim: Wiley-VCH. 2002. ISBN 3527306730. doi:10.1002/14356007.a27_179{{inconsistent citations}} 

外部链接

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