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基因密度

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基因密度（英語：genomic density）单位长度DNA上基因的数量，单位通常为百万碱基对的基因数量（gene/Mb）。其中人类的基因密度为每百万碱基对大约有11至15个基因，而秀丽隐杆线虫的基因密度则高达每百万碱基对200个基因。[1]由于细菌没有内含子且密码子较少，因此细菌的基因密度远超人类。[2]

部分生物的基因密度列表

原生动物

物种 基因数量 基因组碱基对总长度（百万碱基对） 基因密度
田鼠巴贝虫 3,685[3] 6.4[4] 575.8
貝氏貝諾孢子蟲 8,546[5] 58.8[6] 145.3
小隐孢子虫 3,887[7] 9.1[8] 427.1
蓝氏贾第鞭毛虫 5,388[9] 11.5[10] 468.5
杜氏利什曼原蟲 8,123[11] 32.4[12] 250.7
惡性瘧原蟲 5,683[13] 23.5[14] 241.8
致病疫霉 19,344[15] 203.2[16] 95.2
四膜虫 26,996[17] 130.4[18] 207
水泰勒原蟲 4,141[19] 8.3[20] 498.9
弓形蟲 8,925[21] 64.5[22] 138.4
克氏錐蟲 25,183[23] 32.5[24] 774.9

参考文献

  1. ^ Science Reference: Gene. Science Daily. [2013-10-15]. （原始内容存档于2015-03-28）. 
  2. ^ Sands, Jeff. Genomes of Bacteria. Lehigh University. [2013-10-15]. （原始内容存档于2021-01-26）. 
  3. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Babesia_microti/latest_assembly_versions/GCF_000691945.2_ASM69194v2. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-31]. 
  4. ^ Babesia microti (ID 11700) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-31]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  5. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Besnoitia_besnoiti/latest_assembly_versions/GCF_002563875.1_Bbes1.0. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-31]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  6. ^ Besnoitia besnoiti (ID 62526) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-31]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  7. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Cryptosporidium_parvum/latest_assembly_versions/GCF_000165345.1_ASM16534v1. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-31]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  8. ^ Cryptosporidium parvum (ID 29) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-31]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  9. ^ Giardia intestinalis (ID 26) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-31]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  10. ^ Giardia intestinalis (ID 26) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-30]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  11. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Leishmania_donovani/latest_assembly_versions/GCF_000227135.1_ASM22713v2. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-31]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  12. ^ Leishmania donovani (ID 3516) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-31]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  13. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Plasmodium_falciparum/latest_assembly_versions/GCF_000002765.5_GCA_000002765. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-30]. 
  14. ^ Plasmodium falciparum (ID 33) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-30]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  15. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Phytophthora_infestans/latest_assembly_versions/GCF_000142945.1_ASM14294v1. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-31]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  16. ^ Phytophthora infestans (ID 293) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-31]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  17. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Tetrahymena_thermophila/latest_assembly_versions/GCF_000189635.1_JCVI-TTA1-2.2. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-30]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  18. ^ Tetrahymena thermophila (ID 222) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-30]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  19. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Theileria_parva/latest_assembly_versions/GCF_000165365.1_ASM16536v1. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-31]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  20. ^ Theileria parva (ID 38) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-31]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  21. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Toxoplasma_gondii/latest_assembly_versions/GCF_000006565.2_TGA4. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-31]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  22. ^ Toxoplasma gondii (ID 30) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-31]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  23. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Trypanosoma_cruzi/latest_assembly_versions/GCF_000209065.1_ASM20906v1. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-30]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
  24. ^ Trypanosoma cruzi (ID 25) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-30]. （原始内容存档于2022-07-31）. 
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