生物分类学

關於对事物分类的科学，請參見「分類學」，其他用法請參見「分類學 (消歧義)」。

关于相似術語，请见「系統分類學」。

生物分類學（英語：biotaxonomy）簡稱分類学（taxonomy），是关于生物个体的鉴定（identification）、归类（classification）和命名（nomenclature）的原理和方法的学科；此三要件间有相互依存的关系。生物分類學範圍包括：研究生物类群间的异同程度，阐明生物间的亲缘关系、演化过程和发展规律。

要將生物分類，首先要知道生物與非生物的定義，但是我們似乎沒有辦法準確定義，以病毒來說，雖然可在其他生物體內寄生並複製，但在生物體外卻沒有一般生物的特徵如製造或攝取營養，生殖等現象。又如引起瘋牛病的朊粒（prion）可以造成感染卻無DNA成分，一直以來，DNA被視為生命遺傳物質，經由與RNA的轉錄轉譯過程，形成蛋白質，再進一步形成組成細胞的各個部分，如細胞膜、胞器等，而細胞則是我們長久以來所認為組成生命體的最小單位。

生物命名规范

关于如何为生物命名的原则有很多国际协议，例如《国际植物命名法规》（International Code of Botanical Nomenclature，简称ICBN）、《国际动物命名法规》（International Code of Zoological Nomenclature，简称ICZN）以及《国际细菌命名法规》（International Code of Nomenclature of Bacteria，简称ICNB）。第四版的生物命名法规（BioCode）草案在2000年出版，它试图在5个领域标准化命名，但现在还没有被正式采纳。《国际病毒命名和分类法规》（International Code of Virus Classification and Nomenclature，简称ICVCN）是属于生物命名法规的。

生物分界(kingdom)和域(domain)

传统上，生物分为五界(kingdom)，

• 原核生物界(bacteria) -- 原生生物界(protista) -- 真菌界(fungus) -- 植物界(plant) -- 动物界(animal)

Copeland提出过四界说：

• 原核生物界 -- 原生生物界 -- 植物界 -- 动物界

也有人使用三域系統说。这种分类方法是依據细胞是否有核以及细胞膜和细胞壁的差异。

• 古菌域(archaea) -- 细菌域(bacteria) -- 真核域(eukaryota)

另有一些不属于上述所有分类的介于生物和非生物之间的生命形式，即只能寄生于细胞内的病毒，而它们在细胞外并不表现出活跃的生命形式。

• 病毒 -- 类病毒 -- 朊粒

卡尔·林奈 1735	恩斯特·海克尔 1866	埃德·查頓 1925	赫伯特·科普蘭 1938	罗伯特·魏泰克 1969	卡尔·乌斯 et al. 1990	湯瑪斯·卡弗利爾-史密斯 1998
2 界	3 界	2域系統	界 (生物)	界 (生物)	三域系統	界 (生物)
（未論述）	原生生物	原核生物	原核生物界	原核生物界	细菌	细菌
					古菌
		真核生物	原生生物	原生生物	真核生物	原生動物
						色藻界
植物	植物		植物	植物		植物
				真菌		真菌
动物	动物		动物	动物		动物

分类表

生物分類總表

主条目：生物分類總表

这个列表以NCBI Taxonomy （页面存档备份，存于互联网档案馆）上的分類爲基礎。

生物詳細分類表

• 古菌分類表
• 細菌分類表
• 植物分類表 (NCBI)
• 动物分类表
• 真菌分类表
• 原生生物分类表

古菌域

主条目：古菌分類表

包含嗜鹽菌、一些超嗜熱菌、嗜酸菌等。

細菌域

主条目：細菌分類表

包含放線菌、衣原體、支原體、立克次體等。

真核生物域

植物界

主条目：植物分類表 (NCBI)

包含綠藻、輪藻、苔蘚植物、蕨類植物、種子植物等。

真菌/後生動物組

真菌/後生動物組除動物界和真菌外，還包含領鞭毛蟲、魚醉菌等。

動物界

主条目：動物分類表

即“後生動物”組。

真菌界

主条目：真菌分類表

包括子囊菌、擔子菌、接合菌、壺菌、聚合菌和微孢子蟲。

其餘真核生物（原生生物和真核藻類）

真核生物除動物、植物、真菌三界之外統稱原生生物，爲並系群。

• 等輻骨蟲綱（Acantharea），如等棘蟲。
• 放射蟲綱
• 雙滴蟲類（Diplomonadida），如曲滴蟲、賈第蟲。
• Parabasalidea
  • 毛滴蟲綱（Trichomonada）
  • 超鞭毛綱（Hypermastigia）
• 異葉足綱（Heterolobosea），如集胞菌。
• 眼蟲門
  • 動質體目（Kinetoplastida）
  • 眼蟲綱
• 隱藻綱（Cryptophyta）
• 定鞭藻綱（Haptophyceae），如球石藻、等鞭金藻、棕囊藻。
• 不等鞭毛類，除下列分類還包括輻球蟲、蛙片蟲等。
  • 金藻綱
  • 硅鞭藻綱（Dictyochophyceae）
  • 針胞藻綱（Raphidophyceae）
  • 前毛壺菌綱（Hyphochytriomycetes）
  • 卵菌綱
  • 褐藻門，如海帶、巨藻、馬尾藻、墨角藻。
  • 硅藻門
  • 黃藻門
• 囊泡蟲類
  • 頂複門，如瘧原蟲。
  • 纖毛蟲類，如喇叭蟲、中縊蟲、榴彈蟲、草履蟲、四膜蟲。
  • 甲藻門
• 單孢子蟲門（Haplosporidia）
• 絲足蟲類
• 根腫菌類（Plasmodiophorida）
• 粒網足蟲類（Granuloreticulosea），如有孔蟲。
• 葉足綱（Lobosea），如變形蟲（阿米巴）。
• 黏菌門
• 灰胞藻綱（Glaucocystophyceae）
• 紅藻門，如石花菜、紫菜。

註：以上真核生物列表不完全，尚包括有其他一些未歸類原生生物。

参见

• 进化生物学、系统生物学
• 亚里士多德：《工具论》
• 林奈：双名法
• 创造分类学