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保守性替换

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ClustalO英语ClustalO生成的五种哺乳动物组蛋白H1序列比對(120-180位点),标记出不保守位点的突变类型。[1]

保守性替换(英語:Conservative ReplacementConservative Substitution),或称保守性突变(英語:conservative mutation、保留性突变、保存性突变、保守突变、保守替换等,是指性状相近的氨基酸分子之间的替换英语amino acid replacement,其中的性状包含分子的离子性疏水性分子量等。[2][3]与之相对的,激进替换(英語:Radical ReplacementRadical Substitution)则是指物理化学性质非常不同的氨基酸所产生的相互替换。[2]

天然编组基因的氨基酸仅有20种,其中部分氨基酸彼此性状相似。例如,亮氨酸異亮氨酸均为脂肪族化合物,极具疏水性天冬氨酸谷氨酸均小而带负电等。氨基酸的保守性替换比起非保守性替换影响一般较小,这一点在自然界中可以观测到:非保守性替换往往造成各种异常,更容易被自然选择淘汰,故而在自然界中保守性突变更为常见。根据R基团的性质,氨基酸往往依照下表方式分类:

类型 氨基酸
脂肪族 甘氨酸, 丙氨酸, 缬氨酸, 亮氨酸, 異亮氨酸
水合或含/ 絲氨酸, 半胱氨酸, 硒半胱氨酸, 蘇氨酸, 甲硫氨酸
环状 脯氨酸
芳香族 苯丙氨酸, 酪氨酸, 色氨酸
碱性 組氨酸, 離胺酸, 精氨酸
酸性及酰胺类 天冬氨酸, 谷氨酸, 天冬酰胺, 谷氨醯胺

参见

参考资料

  1. ^ Clustal FAQ #Symbols. Clustal. [8 December 2014]. (原始内容存档于2016-10-24). 
  2. ^ 2.0 2.1 Zhang, Jianzhi. Rates of Conservative and Radical Nonsynonymous Nucleotide Substitutions in Mammalian Nuclear Genes. Journal of Molecular Evolution. 2000-01-01, 50 (1): 56–68 [2019-01-06]. ISSN 0022-2844. doi:10.1007/s002399910007. (原始内容存档于2018-09-06) (英语). 
  3. ^ Dagan, Tal; Talmor, Yael; Graur, Dan. Ratios of Radical to Conservative Amino Acid Replacement are Affected by Mutational and Compositional Factors and May Not Be Indicative of Positive Darwinian Selection. Molecular Biology and Evolution. 2002-07-01, 19 (7): 1022–1025 [2019-01-06]. ISSN 0737-4038. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a004161. (原始内容存档于2018-09-06) (英语). 

外部链接