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突觸小泡蛋白

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Synaptobrevin
神經SNARE複合體的高解像度結構,以三種視角呈現。圖例:synaptobreivin-2(紅色)、Syntaxin-1(粉紅色)、SNAP-25(紫色)
鑑定
標誌Synaptobrevin
PfamPF00957舊版
InterPro英語InterProIPR016444
PROSITE英語PROSITEPDOC00368
SCOP英語Structural Classification of Proteins1sfc / SUPFAM
OPM英語Orientations of Proteins in Membranes database家族197
OPM英語Orientations of Proteins in Membranes database蛋白4wy4
膜蛋白數據庫英語Membranome351

突觸小泡蛋白(英語:synaptobrevins,synaptobrevin isotypes 1-2)是分泌囊泡的小膜嵌入蛋白分子量為18千道爾頓(kDa),是囊泡相關膜蛋白(VAMP) 家族的一部分。 [1] [2] [3] [4] [5]

Synaptobrevin是參與SNARE複合體形成的SNARE蛋白之一。

結構

在核心SNARE複合體的四個α螺旋當中:

  • 一個由synaptobrevin貢獻
  • 一個由syntaxin貢獻
  • 兩個由SNAP-25(在神經元中)貢獻。

功能

SNARE蛋白是驅動胞吐作用中膜融合分子機制的關鍵組分。然而,他們的功能受到多種調節性蛋白(整體叫做SNARE master)的微調。

分類

在用於SNARE蛋白的Q/R命名法中,VAMP/synaptobrevin 家族成員被歸類為R-SNAREs ,因為在蛋白質一級結構序列中的特定位置存在精氨酸而得名(與Q-SNAREs相對。他們是位於標的細胞膜上的SNARE,含有穀氨酸)。 Synaptobrevin 在 V/T 命名法中被歸類為V-SNARE。V/T命名法是另一種分類方法,以SNARE的位置歸類:V-SNAREs位於囊泡上;T-SNAREs 位於標的細胞膜上。[6]

臨床重要性

Synaptobrevin會被破傷風痙攣蛋白(一種來自破傷風桿菌的蛋白質,可引起破傷風)降解。

肉毒桿菌(Clostridium botulinum)製造肉毒桿菌毒素,其各種血清型會切下特定神經SNARE蛋白上特定的肽鍵,而Synaptobrevin正是某些血清型的標的蛋白。

含有該結構域的人類蛋白

SEC22A ; SEC22B ; SYBL1 ; VAMP1;VAMP2 ;VAMP3 ;VAMP4;VAMP5;VAMP8 ;YKT6

參考資料與註釋

  1. ^ Baumert M, Maycox PR, Navone F, De Camilli P, Jahn R. Synaptobrevin: an integral membrane protein of 18,000 daltons present in small synaptic vesicles of rat brain. EMBO J. February 1, 1989, 8 (2): 379–84. PMC 400817可免費查閱. PMID 2498078. doi:10.1002/j.1460-2075.1989.tb03388.x. 
  2. ^ Bock JB, Scheller RH. SNARE proteins mediate lipid bilayer fusion. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. October 1999, 96 (22): 12227–9. Bibcode:1999PNAS...9612227B. PMC 34255可免費查閱. PMID 10535902. doi:10.1073/pnas.96.22.12227可免費查閱. 
  3. ^ Ernst JA, Brunger AT. High resolution structure, stability, and synaptotagmin binding of a truncated neuronal SNARE complex. J Biol Chem. 2003, 278 (10): 8630–6 [2023-05-30]. PMID 12496247. doi:10.1074/jbc.M211889200可免費查閱. (原始內容存檔於2008-04-22). 
  4. ^ Fasshauer D, Sutton RB, Brunger AT, Jahn R. Conserved structural features of the synaptic fusion complex: SNARE proteins reclassified as Q- and R-SNAREs. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. December 1998, 95 (26): 15781–6. Bibcode:1998PNAS...9515781F. PMC 28121可免費查閱. PMID 9861047. doi:10.1073/pnas.95.26.15781可免費查閱. 
  5. ^ Weber T, Zemelman BV, McNew JA, Westermann B, Gmachl M, Parlati F, Sollner TH, Rothman JE. SNAREpins: minimal machinery for membrane fusion. Cell. 1998, 92 (6): 759–72. PMID 9529252. S2CID 5637048. doi:10.1016/S0092-8674(00)81404-X可免費查閱. 
  6. ^ Juan S. Bonifacino and Benjamin S. Glick. "The Mechanisms of Vesicle Budding and Fusion." Cell, Vol. 116, 153–166, January 23, 2004,

外部鏈結