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九州王朝說，係日本著名歷史學家古田武彥提出的一個假說：在奈良地方的大和朝廷興起的同時，在北九州地區還存在一個與之對立的國家，即通稱的倭國，這個倭國很可能就是最早與中國建交日本列島上的國家。一部分歷史學家認為它就是邪馬台國。

在古田武彥的假說中，從1世紀到7世紀代表日本的是倭王朝，即邪馬台王朝。其都城在大宰府。古田武彥認為，倭國也可稱為邪馬台國，是九州王朝的前身。從與漢朝通交存續到7世紀，並順利通過了大和王權的打壓，但在663年（天智3年）白江口之戰中失敗而滅亡。該學說認為倭五王即九州王朝上的君主。

二戰後在長沼賢海的幫助下，逐漸實現學說的體系化。但其他九州王朝論述者也提出不同的九州王朝情節，甚至出現了自相矛盾的說法。

主要論述

《日本書紀》、《古事記》中大部分內容都是後來大和朝廷盜用九州王朝的歷史。從公元一世紀與漢朝通交開始，日本最具代表性的政府一直都是九州倭國王朝。

公元1世紀，以博多灣附近的倭國開始逐漸形成，其統治的領域包括整個北部九州。根據中國史書《三國志》記載，一部分史學家推測，邪馬台國（異稱邪馬壹國）是以福岡平原為中心的國家，其人口總數高達兩萬戶。

而《日本書紀》和《古事記》有明顯的記載不實，考慮到從隋唐時期，日本的漢風風潮的興起，卑彌呼很可能是瓮依美香比姬，而壹與則稱為「ゐよ」。而根據日本神話，九州王朝的出現，非常符合後來神武東征，在畿內創立政權。因此該學說受到廣泛支持。

五倭王贊、珍、濟、興、武，應該都是九州王朝的國王，而筑紫君磐井應該也是國王。九州王朝有獨立的年號。

白江口之戰中，總指揮官是九州王朝的天皇「筑紫君薩夜麻」，被唐軍逮捕。倭國戰敗之後，據一部分野史的記載，唐軍曾將軍隊派往九州。因此，代表日本的九州王朝的權威消失殆盡。

太宰府是倭國的首都，其名稱為藤原京。從倭京元年（618年）到九州王朝的滅亡為止。都是日本最繁華的都市。

「壬申之亂」，基本上是以九州為舞台。吉野是佐賀縣吉野里遺蹟的吉野，倭京是飛鳥宮大宰府，大津宮也不是在近江，而是在肥後的大津。

「大化改新」是在九州藤原京中發生的事件，也是畿內大和豪族和中臣鎌足（藤原不比等）篡奪在九州倭國的天皇，以下克上的政變。

當倭國和朝鮮三國斷交後，藤原不比等滅亡了九州王朝的後裔，並擁立傀儡，成功掌權。